「SARSコロナウイルス2」の版間の差分
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| 株 = '''重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2<ref name="WHO_name" /> [[:en:Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2|SARS-CoV-2]]''' |
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'''重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2型'''{{refnest|group="注"|和名には[[表記ゆれ]]があり定まっていない。表記の例は[[#名称]]を参照。}}（じゅうしょうきゅうせいこきゅうきしょうこうぐんコロナウイルス2がた、{{lang-en-short|severe acute respiratory syndrome coronavirus 2}}、略称: '''SARS-CoV-2'''、{{lang-zh|严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2}}）は、[[新型コロナウイルス感染症 (2019年)|新型コロナウイルス感染症（COVID-19）]]<ref>[https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51466362 Coronavirus disease named Covid-19] BBC NEWS 2020年2月12日</ref>の原因となる、[[SARS関連コロナウイルス]]（SARSr-CoV）に属する[[オルトコロナウイルス亜科|コロナウイルス]]である<ref name="ICTV20200211">{{PDFlink|[https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.937862v1.full.pdf Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: The species and its viruses |
'''重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2型'''{{refnest|group="注"|和名には[[表記ゆれ]]があり定まっていない。表記の例は[[#名称]]を参照。}}（じゅうしょうきゅうせいこきゅうきしょうこうぐんコロナウイルス2がた、{{lang-en-short|severe acute respiratory syndrome coronavirus 2}}、略称: '''SARS-CoV-2'''、{{lang-zh|严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2}}）は、[[新型コロナウイルス感染症 (2019年)|新型コロナウイルス感染症（COVID-19）]]<ref>[https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51466362 Coronavirus disease named Covid-19] BBC NEWS 2020年2月12日</ref>の原因となる、[[SARS関連コロナウイルス]]（SARSr-CoV）に属する[[オルトコロナウイルス亜科|コロナウイルス]]である<ref name="ICTV20200211">{{PDFlink|[https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.937862v1.full.pdf Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: The species and its viruses - a statement of the Coronavirus Study Group]}} - ICTV (February 11, 20) |
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</ref>。[[日本]]の[[国家機関]]や主要な[[報道機関]]は'''新型コロナウイルス'''と呼んでおり<ref name="n567">{{Cite web|url=https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/kenkou_iryou/dengue_fever_qa_00001.html|accessdate=2020-04-24|title=新型コロナウイルスに関するQ&A（一般の方向け）|publisher=厚生労働省}}</ref><ref name="nhk567">{{Cite web|url=https://www3.nhk.or.jp/news/special/coronavirus/|accessdate=2020-04-24|title=特設サイト 新型コロナウイルス|publisher=NHK}}</ref>、'''新型コロナ'''と省略される場合もある<ref name="nhk567" /><ref name="nk567">{{Cite web|url=https://r.nikkei.com/topics/topic_DF_TA_20012202/|accessdate=2020-04-24|title=新型コロナウイルス|publisher=日本経済新聞}}</ref><ref name="yomiuri567">{{Cite web|url=https://www.yomiuri.co.jp/topics/20200129-OYT8T50025/|accessdate=2020-04-24|title=新型コロナウイルス情報|publisher=読売新聞}}</ref><ref name="sankei567">{{Cite web|url=https://www.sankei.com/main/topics/main-36641-t.html|accessdate=2020-04-24|title=新型コロナ|publisher=産経新聞 (産経ニュース)}}</ref>。 |
</ref>。[[日本]]の[[国家機関]]や主要な[[報道機関]]は'''新型コロナウイルス'''と呼んでおり<ref name="n567">{{Cite web|url=https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/kenkou_iryou/dengue_fever_qa_00001.html|accessdate=2020-04-24|title=新型コロナウイルスに関するQ&A（一般の方向け）|publisher=厚生労働省}}</ref><ref name="nhk567">{{Cite web|url=https://www3.nhk.or.jp/news/special/coronavirus/|accessdate=2020-04-24|title=特設サイト 新型コロナウイルス|publisher=NHK}}</ref>、'''新型コロナ'''と省略される場合もある<ref name="nhk567" /><ref name="nk567">{{Cite web|url=https://r.nikkei.com/topics/topic_DF_TA_20012202/|accessdate=2020-04-24|title=新型コロナウイルス|publisher=日本経済新聞}}</ref><ref name="yomiuri567">{{Cite web|url=https://www.yomiuri.co.jp/topics/20200129-OYT8T50025/|accessdate=2020-04-24|title=新型コロナウイルス情報|publisher=読売新聞}}</ref><ref name="sankei567">{{Cite web|url=https://www.sankei.com/main/topics/main-36641-t.html|accessdate=2020-04-24|title=新型コロナ|publisher=産経新聞 (産経ニュース)}}</ref>。 |
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[[2019年]]11月に[[中華人民共和国]][[湖北省]][[武漢市]]付近で発生が初めて確認され<ref name="NatureZhou">{{cite journal | vauthors = Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, Si HR, Zhu Y, Li B, Huang CL, Chen HD, Chen J, Luo Y, Guo H, Jiang RD, Liu MQ, Chen Y, Shen XR, Wang X, Zheng XS, Zhao K, Chen QJ, Deng F, Liu LL, Yan B, Zhan FX, Wang YY, Xiao GF, Shi ZL | display-authors = 6 | title = A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin | journal = Nature | pages = |
[[2019年]]11月に[[中華人民共和国]][[湖北省]][[武漢市]]付近で発生が初めて確認され<ref name="NatureZhou">{{cite journal | vauthors = Zhou P, Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, Si HR, Zhu Y, Li B, Huang CL, Chen HD, Chen J, Luo Y, Guo H, Jiang RD, Liu MQ, Chen Y, Shen XR, Wang X, Zheng XS, Zhao K, Chen QJ, Deng F, Liu LL, Yan B, Zhan FX, Wang YY, Xiao GF, Shi ZL | display-authors = 6 | title = A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin | journal = Nature | pages = 1-4 | date = February 2020 | pmid = 32015507 | doi = 10.1038/s41586-020-2012-7 | url = https://www.nature.com/articles/s41586-020-2012-7 }}</ref>、その後、[[新型コロナウイルス感染症の流行 (2019年-)|COVID-19の世界的流行]]（[[パンデミック]]）を引き起こしている<ref name="reuters20200312" /><ref name="nhk20200312" /><ref name="nikkei20200312" />。[[21世紀]]以降、[[自然破壊]]などの結果として新型[[ウイルス]]の流行が急増した<ref>[https://www.newsweekjapan.jp/stories/world/2020/05/1-148.php パンデミック頻発の裏に環境破壊、新型コロナ終息には1年以上＝山本･長崎大教授] ニューズウィーク日本版 (2020年5月5日)</ref><ref>[https://www.huffingtonpost.jp/entry/un-prevent-future-pandemics_jp_5f040ce5c5b6db5967462146?utm_hp_ref=jp-kokuren 自然破壊が続くと新型コロナのような感染症が増える。国連が警告→「動物から人間に移ってきます」] ハフポスト日本版 (2020年7月7日)</ref>が、その中でも世界の殆どの国に感染が拡大した初めてのウイルスとなった。国によって異なる流行像がある<ref>[https://eprints.lib.hokudai.ac.jp/dspace/bitstream/2115/77531/1/jjsc27-b_uchimura.pdf 「新型コロナウイルスを考える」を考える(P9)]</ref>。 |
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== 名称 == |
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</ref><ref>[https://bibgraph.hpcr.jp/abst/pubmed/32337143 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）：最新情報] - Bibgraph（ビブグラフ）</ref>。また、'''SARSコロナウイルス-2'''<ref> |
</ref><ref>[https://bibgraph.hpcr.jp/abst/pubmed/32337143 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）：最新情報] - Bibgraph（ビブグラフ）</ref>。また、'''SARSコロナウイルス-2'''<ref> |
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|author = 一ノ瀬 俊明他 |
|author = 一ノ瀬 俊明他 |
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|title = 時空間ランダムウォークモデルによる感染対策の検証 |
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|date = 2020-05-07 |
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|publisher = 社会環境システム研究センター（国立研究開発法人国立環境研究所） |
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|journal = Discussion Paper Series |
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|pages = 2020-02 |
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|ref = }}</ref><ref>{{Cite news|url=https://www.jiji.com/jc/article?k=000000210.000024308&g=prt|title=アストラゼネカのアカラブルチニブ（Calquence）、新型コロナウイルス感染症19例の入院患者さんの大多数において有望な臨床効果を示す|publisher=時事通信|date=2020-06-12|accessdate=2020-06-23}}</ref>や'''SARSコロナウイルス2'''<ref>{{Cite web|url=https://www.msdmanuals.com/ja-jp/%E3%83%9B%E3%83%BC%E3%83%A0/16-%E6%84%9F%E6%9F%93%E7%97%87/%E5%91%BC%E5%90%B8%E5%99%A8%E7%B3%BB%E3%82%A6%E3%82%A4%E3%83%AB%E3%82%B9/%E3%82%B3%E3%83%AD%E3%83%8A%E3%82%A6%E3%82%A4%E3%83%AB%E3%82%B9%E3%81%A8%E6%80%A5%E6%80%A7%E5%91%BC%E5%90%B8%E5%99%A8%E7%97%87%E5%80%99%E7%BE%A4%EF%BC%88covid-19%E3%80%81mers%E3%80%81sars%EF%BC%89|title=コロナウイルスと急性呼吸器症候群（COVID-19、MERS、SARS） - 16. 感染症|website=MSDマニュアル家庭版|accessdate=2020-06-23|language=ja-JP}}</ref><ref>{{Cite web|url=http://www.jpeds.or.jp/uploads/files/yobo_kansensho_20200522.pdf.pdf|title=「学校、幼稚園、保育所において予防すべき感染症の解説」|publisher=日本小児科学会|accessdate=2020-06-23|language=ja-JP}}</ref>、'''サーズコロナウイルス2'''<ref name="kgk202004">{{Cite |和書|author = 氏家誠 |title = 化学 2020年4月号 |date = 2020|pages = 44|publisher = [[化学同人]] |ref = harv }}</ref>（読み: サーズコロナウイルス ツー<ref name="kgk202004"/>）などと呼称・表記される場合もある。 |
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日本の国家機関や主要な報道機関は単に'''新型コロナウイルス'''と呼称している<ref name="n567" /><ref name="nhk567"/><ref name="nk567"/><ref name="bbc20200205"/><ref name=":52">{{Cite web|url=https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000164708_00001.html|website=www.mhlw.go.jp|accessdate=2020-03-26|title=新型コロナウイルス感染症<!--新型コロナウイルス関連肺炎の発生-->について|publisher=厚生労働省 (日本)}}</ref>。 |
日本の国家機関や主要な報道機関は単に'''新型コロナウイルス'''と呼称している<ref name="n567" /><ref name="nhk567"/><ref name="nk567"/><ref name="bbc20200205"/><ref name=":52">{{Cite web|url=https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000164708_00001.html|website=www.mhlw.go.jp|accessdate=2020-03-26|title=新型コロナウイルス感染症<!--新型コロナウイルス関連肺炎の発生-->について|publisher=厚生労働省 (日本)}}</ref>。 |
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WHOは2020年2月11日、新型コロナウイルスによる[[病気|疾患]]を'''[[新型コロナウイルス感染症 (2019年)|COVID-19]]'''（'''''Co'''rona'''vi'''rus '''d'''isease 20'''19''''' の略称）と命名している<ref name="name-covid-19">{{Cite web|url=https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200211-sitrep-22-ncov.pdf|title=Novel Coronavirus (2019-nCoV), Situation Report |
WHOは2020年2月11日、新型コロナウイルスによる[[病気|疾患]]を'''[[新型コロナウイルス感染症 (2019年)|COVID-19]]'''（'''''Co'''rona'''vi'''rus '''d'''isease 20'''19''''' の略称）と命名している<ref name="name-covid-19">{{Cite web|url=https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200211-sitrep-22-ncov.pdf|title=Novel Coronavirus (2019-nCoV), Situation Report -22|publisher=''[[世界保健機関|World Health Organization]] (WHO)''|date=2020-02-11|accessdate=2020-02-12|format=pdf|language=en}}</ref>。 |
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=== 2019-nCoVという呼称 === |
=== 2019-nCoVという呼称 === |
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このウイルスは[[国際ウイルス分類委員会]] (ICTV) により、SARSコロナウイルス (SARS-CoV) と同じ種（の姉妹系統）と見なされており、[[ベータコロナウイルス]]属の[[SARS関連コロナウイルス]] (SARSr-CoV) という種に属している<ref name="ICTV20200211" />。ただし、SARSコロナウイルスの直接の子孫ではない<ref name="CVSG" />。元々[[コウモリ]]などの[[野生動物]]が保因していたものが、それぞれ独立してヒトに伝播、ヒトへの感染能力を獲得したと考えられている<ref name="CVSG">{{cite web|url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.937862v1.full.pdf|title=Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: The species and its viruses|author=Coronavirus Study Group|website=[[bioRxiv]]|date=11 February 2020|accessdate=12 February 2020}}</ref>。 |
このウイルスは[[国際ウイルス分類委員会]] (ICTV) により、SARSコロナウイルス (SARS-CoV) と同じ種（の姉妹系統）と見なされており、[[ベータコロナウイルス]]属の[[SARS関連コロナウイルス]] (SARSr-CoV) という種に属している<ref name="ICTV20200211" />。ただし、SARSコロナウイルスの直接の子孫ではない<ref name="CVSG" />。元々[[コウモリ]]などの[[野生動物]]が保因していたものが、それぞれ独立してヒトに伝播、ヒトへの感染能力を獲得したと考えられている<ref name="CVSG">{{cite web|url=https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.937862v1.full.pdf|title=Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: The species and its viruses|author=Coronavirus Study Group|website=[[bioRxiv]]|date=11 February 2020|accessdate=12 February 2020}}</ref>。 |
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2020年3月26日には、[[マレーセンザンコウ]]からゲノムが85〜92%類似するコロナウイルスが発見されており、これらはよりSARS-CoV-2の祖先に近いと考えられる<ref name="CurrentOrigin">{{cite journal|vauthors=Zhang T, Wu Q, Zhang Z|title=Probable Pangolin Origin of SARS-CoV-2 Associated with the COVID-19 Outbreak|journal=[[Current Biology]]| volume=30| pages= |
2020年3月26日には、[[マレーセンザンコウ]]からゲノムが85〜92%類似するコロナウイルスが発見されており、これらはよりSARS-CoV-2の祖先に近いと考えられる<ref name="CurrentOrigin">{{cite journal|vauthors=Zhang T, Wu Q, Zhang Z|title=Probable Pangolin Origin of SARS-CoV-2 Associated with the COVID-19 Outbreak|journal=[[Current Biology]]| volume=30| pages=1-6|date=19 March 2020|doi=10.1016/j.cub.2020.03.022|pmid=32197085}}</ref><ref name="NEJM">{{cite journal |vauthors=Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, Song J, Zhao X, Huang B, Shi W, Lu R, Niu P, Zhan F, Ma X, Wang D, Xu W, Wu G, Gao GF, Tan W | display-authors=3 |title=A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019 |journal=New England Journal of Medicine |date=January 2020 |volume= 382|issue= 8|pages= 727-733|doi=10.1056/NEJMoa2001017 |pmid=31978945 }}</ref>。 |
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==ゲノム配列== |
==ゲノム配列== |
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== 構造 == |
== 構造 == |
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[[ファイル:SARS-CoV-2 without background.png|thumb|200px|[[アメリカ疾病予防管理センター]]が作成したSARS-CoV-2のイメージ<br />{{legend|#FF0000|赤い突起:[[スパイク]]タンパク(S)<ref name=newton>板倉龍「猛威を振るう「新型コロナウイルス」」[[ニュートン (雑誌)|ニュートン]]2020年4月号</ref>}}{{legend|#808080|灰色の被膜が[[エンベロープ (ウイルス)|エンベロープ]]、主成分は脂質で、アルコールや石鹸により破壊できる<ref name=newton/>。}}{{legend|#FFFF00|黄色の付着物:エンベロープタンパク<ref name=newton/>。}}{{legend|#fd7e00|オレンジの付着物が[[膜タンパク質]]<ref name=newton/>。}}]] |
[[ファイル:SARS-CoV-2 without background.png|thumb|200px|[[アメリカ疾病予防管理センター]]が作成したSARS-CoV-2のイメージ<br />{{legend|#FF0000|赤い突起:[[スパイク]]タンパク(S)<ref name=newton>板倉龍「猛威を振るう「新型コロナウイルス」」[[ニュートン (雑誌)|ニュートン]]2020年4月号</ref>}}{{legend|#808080|灰色の被膜が[[エンベロープ (ウイルス)|エンベロープ]]、主成分は脂質で、アルコールや石鹸により破壊できる<ref name=newton/>。}}{{legend|#FFFF00|黄色の付着物:エンベロープタンパク<ref name=newton/>。}}{{legend|#fd7e00|オレンジの付着物が[[膜タンパク質]]<ref name=newton/>。}}]] |
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ウイルス粒子（[[ビリオン]]）は、50〜200 [[ナノメートル|nm（ナノメートル）]]ほどの大きさである<ref>{{cite journal |authors=Chen N, Zhou M, Dong X, Qu J, Gong F, Han Y, Qiu Y, Wang J, Liu Y, Wei Y, Sia J, You T, Zhang X, Zhang L |title=Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study |journal= Lancet |volume = 395 | issue = 10223 |pages= |
ウイルス粒子（[[ビリオン]]）は、50〜200 [[ナノメートル|nm（ナノメートル）]]ほどの大きさである<ref>{{cite journal |authors=Chen N, Zhou M, Dong X, Qu J, Gong F, Han Y, Qiu Y, Wang J, Liu Y, Wei Y, Sia J, You T, Zhang X, Zhang L |title=Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study |journal= Lancet |volume = 395 | issue = 10223 |pages=507-513 |doi=10.1016/S0140-6736(20)30211-7 |date=2020-03-14}}</ref>。一般的なコロナウイルスと同様に、S（スパイク）タンパク質、N（[[ヌクレオカプシド]]）タンパク質、M（膜）タンパク質、E（[[エンベロープ (ウイルス)|エンベロープ]]）タンパク質として知られる4つのたんぱく質と、RNAにより構成されている。このうち、Nタンパク質がRNAと結合して[[ヌクレオカプシド]]を形成し、脂質と結合したS、EおよびMタンパク質がその周りを取り囲んで[[エンベロープ (ウイルス)|エンベロープ]]を形成する。エンベロープの最も外側に位置するSタンパク質は、細胞表面の[[アンジオテンシン変換酵素|ACE2]]受容体に結合して[[細胞]]への感染を可能とする<ref name="WuStructure" />。ヒトへの感染にACE2受容体を利用する点は[[SARSコロナウイルス]]（SARS-CoV）と共通しており、[[DPP-4]]受容体を利用する[[MERSコロナウイルス]]（MERS-CoV）や、{{仮リンク|アラニンアミノペプチダーゼ|en|Alanine aminopeptidase|label=アミノペプチダーゼN}} (APN) を利用するヒトコロナウイルス229Eとは異なる<ref>{{cite journal|vauthors=Fehr AR, Perlman S|date=2015|title=Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis|url=|journal=Methods in Molecular Biology|publisher=Springer|volume=1282|pages=1-23|doi=10.1007/978-1-4939-2438-7_1|isbn=978-1-4939-2438-7|pmc=4369385|pmid=25720466|quote=See Table 1.|veditors=Maier HJ, Bickerton E, Britton P}}</ref>。ウイルスゲノムは29,903 [[塩基]]で、[[一本鎖プラス鎖RNAウイルス]]である<ref>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947</ref>。 |
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タンパク質やRNAのSARSコロナウイルスとの相同性は、Sタンパク質が76.0%、Nタンパク質が90.6%、Mタンパク質が90.1%、Eタンパク質が94.7%<ref name="pmid32106567" />、RNAが80%となっている<ref name="WuStructure">{{cite journal|vauthors=Wu C, Liu Y, Yang Y, Zhang P, Zhong W, Wang Y, Wang Q, Xu Y, Li M, Li X, Zheng M, Chen L, Li H|display-authors=3|title=Analysis of therapeutic targets for SARS-CoV-2 and discovery of potential drugs by computational methods |journal=Acta Pharmaceutica Sinica B| date=February 2020| name-list-format=vanc| doi=10.1016/j.apsb.2020.02.008}}</ref><ref>[https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMe2001126]</ref>。一方で同じベータコロナウイルスの中でも別種<ref name="ICTV20200211" />のMERSコロナウイルスとは、それぞれ4.6%、7.6%、6.3%、30.5%<ref name="pmid32106567">{{cite journal|author =Ahmed SF, Quadeer AA, McKay MR|date=Feb. 2020|title=Preliminary Identification of Potential Vaccine Targets for the COVID-19 Coronavirus (SARS-CoV-2) Based on SARS-CoV Immunological Studies. |journal=Viruses|volume=12|issue=3|page=|doi=10.3390/v12030254}}</ref>、50%<ref name="WuStructure" />しか一致していない。 |
タンパク質やRNAのSARSコロナウイルスとの相同性は、Sタンパク質が76.0%、Nタンパク質が90.6%、Mタンパク質が90.1%、Eタンパク質が94.7%<ref name="pmid32106567" />、RNAが80%となっている<ref name="WuStructure">{{cite journal|vauthors=Wu C, Liu Y, Yang Y, Zhang P, Zhong W, Wang Y, Wang Q, Xu Y, Li M, Li X, Zheng M, Chen L, Li H|display-authors=3|title=Analysis of therapeutic targets for SARS-CoV-2 and discovery of potential drugs by computational methods |journal=Acta Pharmaceutica Sinica B| date=February 2020| name-list-format=vanc| doi=10.1016/j.apsb.2020.02.008}}</ref><ref>[https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMe2001126]</ref>。一方で同じベータコロナウイルスの中でも別種<ref name="ICTV20200211" />のMERSコロナウイルスとは、それぞれ4.6%、7.6%、6.3%、30.5%<ref name="pmid32106567">{{cite journal|author =Ahmed SF, Quadeer AA, McKay MR|date=Feb. 2020|title=Preliminary Identification of Potential Vaccine Targets for the COVID-19 Coronavirus (SARS-CoV-2) Based on SARS-CoV Immunological Studies. |journal=Viruses|volume=12|issue=3|page=|doi=10.3390/v12030254}}</ref>、50%<ref name="WuStructure" />しか一致していない。 |
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SARS-CoV-2には、SARSコロナウイルスと異なり、Sタンパク質に感染力と病原性を高める[[フーリン (タンパク質)|フーリン]]切断部位が存在する<ref name="Proximal">{{cite journal |vauthors=Andersen KG, Rambaut A, Lipkin WI, Holmes EC, Garry RF |title=Correspondence: The proximal origin of SARS-CoV-2 |url=https://www.nature.com/articles/s41591-020-0820-9 |date=17 March 2020 |journal=[[Nature Medicine]] |pages= |
SARS-CoV-2には、SARSコロナウイルスと異なり、Sタンパク質に感染力と病原性を高める[[フーリン (タンパク質)|フーリン]]切断部位が存在する<ref name="Proximal">{{cite journal |vauthors=Andersen KG, Rambaut A, Lipkin WI, Holmes EC, Garry RF |title=Correspondence: The proximal origin of SARS-CoV-2 |url=https://www.nature.com/articles/s41591-020-0820-9 |date=17 March 2020 |journal=[[Nature Medicine]] |pages=1-3 |doi=10.1038/s41591-020-0820-9 |access-date=8 April 2020 |archive-url=https://web.archive.org/web/20200318001738/https://www.nature.com/articles/s41591-020-0820-9 |url-status=live |name-list-format = vanc}}</ref>。これはサルベコウイルスの中では他に例が無いが、コロナウイルス科全体で見れば珍しいものではなく、多くの[[マウス肝炎コロナウイルス]]（MHV-JHMやMHV-A59）やヒトコロナウイルス（[[MERSコロナウイルス|MERS-CoV]]、[[ヒトコロナウイルスOC43|HCoV-OC43]]）などが同様の部位を保有している<ref name="pmid32057769">{{cite journal |authors=Coutard, B., ''et a;.'' |title=The spike glycoprotein of the new coronavirus 2019-nCoV contains a furin-like cleavage site absent in CoV of the same clade. |date= 2020 |journal=Antiviral Res. |pages= |volume =176|issue =104742 |doi=10.1016/j.antiviral.2020.104742 }}</ref>。 |
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{{Gallery |
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==== イギリス・ケンブリッジ大学などからの報告 ==== |
==== イギリス・ケンブリッジ大学などからの報告 ==== |
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2020年4月のイギリス・ケンブリッジ大学などによる報告では、このウイルスはA、B、Cの3つの型に分けられるとした。Aは中国のコウモリ由来のウイルスに近く、中国や日本の感染者でも見つかったが、米国やオーストラリアの感染者が多かった。Ａから変異したＢが武漢市を中心として中国や近隣諸国で爆発的に増えたとみられ、欧米などに飛び火した例は少なかった。Ｂから変異したＣはイタリア、フランス、英国など欧州で多かった<ref>{{Cite journal|last=Forster|first=Peter|last2=Forster|first2=Lucy|last3=Renfrew|first3=Colin|last4=Forster|first4=Michael|date=2020-04-28|title=Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes|url=https://www.pnas.org/content/117/17/9241|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences|volume=117|issue=17|pages= |
2020年4月のイギリス・ケンブリッジ大学などによる報告では、このウイルスはA、B、Cの3つの型に分けられるとした。Aは中国のコウモリ由来のウイルスに近く、中国や日本の感染者でも見つかったが、米国やオーストラリアの感染者が多かった。Ａから変異したＢが武漢市を中心として中国や近隣諸国で爆発的に増えたとみられ、欧米などに飛び火した例は少なかった。Ｂから変異したＣはイタリア、フランス、英国など欧州で多かった<ref>{{Cite journal|last=Forster|first=Peter|last2=Forster|first2=Lucy|last3=Renfrew|first3=Colin|last4=Forster|first4=Michael|date=2020-04-28|title=Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes|url=https://www.pnas.org/content/117/17/9241|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences|volume=117|issue=17|pages=9241-9243|language=en|doi=10.1073/pnas.2004999117|issn=0027-8424|pmid=32269081}}</ref><ref>{{Cite web|title=変異パターンは３種類 新型コロナウイルス―ワクチン開発に応用期待・英大学：時事ドットコム|url=https://www.jiji.com/jc/article?k=2020040900986&g=soc|website=時事ドットコム|accessdate=2020-04-29|language=ja}}</ref>。 |
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==== 日本バイオデータからの報告 ==== |
==== 日本バイオデータからの報告 ==== |
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==免疫細胞への感染能力== |
==免疫細胞への感染能力== |
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新型コロナウイルスは、[[T細胞]]の細胞株であるMT-2細胞株およびA3.01細胞株それぞれに対し、[[SARSコロナウイルス]]（SARS-CoV）と新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）を感染させ比較したところ、SARS-CoVは細胞に感染しなかったのに対し、SARS-CoV-2は細胞へ感染したと報告された<ref name="Cellular & Molecular Immunology">{{cite journal |vauthors=Xinling Wang, Wei Xu, Gaowei Hu, Shuai Xia,Zhiping Sun, Zezhong Liu, Youhua Xie, Rong Zhang, |
新型コロナウイルスは、[[T細胞]]の細胞株であるMT-2細胞株およびA3.01細胞株それぞれに対し、[[SARSコロナウイルス]]（SARS-CoV）と新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）を感染させ比較したところ、SARS-CoVは細胞に感染しなかったのに対し、SARS-CoV-2は細胞へ感染したと報告された<ref name="Cellular & Molecular Immunology">{{cite journal |vauthors=Xinling Wang, Wei Xu, Gaowei Hu, Shuai Xia,Zhiping Sun, Zezhong Liu, Youhua Xie, Rong Zhang, |
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Shibo Jiang and Lu Lu| display-authors=3 |title=SARS-CoV-2 infects T lymphocytes through its spike protein-mediated membrane fusion, 2020 |journal=Cellular & Molecular Immunology |date=April 2020 |pmid=32265513 |doi=10.1038/s41423-020-0424-9}}</ref>。ただし細胞内でのウイルスの複製はできなかったと報告されている。2020年6月8日、本研究に用いた手法および結論に対する信頼性に懸念が生じたとして、本論文の編集者により現在この論文で用いられた手法および結論が正しかったかどうかを調査中である旨が発表された。その後の検証で、初代培養のT細胞ではなく細胞株を用いていたことや[[フローサイトメトリー]]の手法に瑕疵があったことを理由に、本[[論文]]は撤回された<ref name="Cellular & Molecular Immunology" />。 |
Shibo Jiang and Lu Lu| display-authors=3 |title=SARS-CoV-2 infects T lymphocytes through its spike protein-mediated membrane fusion, 2020 |journal=Cellular & Molecular Immunology |date=April 2020 |pmid=32265513 |doi=10.1038/s41423-020-0424-9}}</ref>。ただし細胞内でのウイルスの複製はできなかったと報告されている。2020年6月8日、本研究に用いた手法および結論に対する信頼性に懸念が生じたとして、本論文の編集者により現在この論文で用いられた手法および結論が正しかったかどうかを調査中である旨が発表された。その後の検証で、初代培養のT細胞ではなく細胞株を用いていたことや[[フローサイトメトリー]]の手法に瑕疵があったことを理由に、本[[論文]]は撤回された<ref name="Cellular & Molecular Immunology" />。 |
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==発見== |
==発見== |
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新型コロナウイルスは[[2019年]]11月に中国武漢で発生が確認され、同年[[12月31日]]に最初に[[世界保健機関]] (WHO) に報告された<ref name="WHO5Jan2020">{{cite web|url=https://www.who.int/csr/don/05-january-2020-pneumonia-of-unkown-cause-china/en/|title=Pneumonia of unknown cause |
新型コロナウイルスは[[2019年]]11月に中国武漢で発生が確認され、同年[[12月31日]]に最初に[[世界保健機関]] (WHO) に報告された<ref name="WHO5Jan2020">{{cite web|url=https://www.who.int/csr/don/05-january-2020-pneumonia-of-unkown-cause-china/en/|title=Pneumonia of unknown cause - China. Disease outbreak news|date=5 January 2020|publisher=[[World Health Organization]]|accessdate=6 January 2020|archiveurl=https://web.archive.org/web/20200107032945/https://www.who.int/csr/don/05-january-2020-pneumonia-of-unkown-cause-china/en/|archivedate=7 January 2020|url-status=live}}</ref>。その後2019年から翌[[2020年]]にかけて発生した[[中国本土における2019年コロナウイルス感染症の流行状況|中国武漢でのアウトブレイク]]において[[肺炎]]患者の[[核酸増幅検査|核酸検査]]陽性患者サンプルにより、[[ゲノム]]配列が決定された<ref>{{Cite web|url=http://www.chinacdc.cn/dfdt/201912/t20191226_209404.html|title=中国疾病预防控制中心|website=www.chinacdc.cn|accessdate=9 January 2020}}</ref><ref name=":0">{{Cite news|url=http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/09/c_138690570.htm|title=New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert |newspaper=Xinhua |date=2020-01-09 |accessdate=9 January 2020}}</ref><ref name=":1">{{Cite web|url=https://platform.gisaid.org/epi3/start/CoV2020|title=CoV2020|author=|first=|date=|website=platform.gisaid.org|archiveurl=|archivedate=|accessdate=12 January 2020}}</ref>。 |
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2020年[[1月20日]]、[[病原体]]を調査している[[中華人民共和国|中国]]・[[中華人民共和国国家衛生健康委員会|国家衛生健康委員会]] (NHC) 専門家の[[鍾南山]]グループ長は、[[広東省]]でヒトからヒトへの感染（ヒト - ヒト感染）が確認されたと発表した<ref name=":cbc2">{{Cite news|url=https://www.cbc.ca/news/health/coronavirus-human-to-human-1.5433187|title=China confirms human-to-human transmission of new coronavirus|last=|first=|date=Jan 20, 2020|newspaper=CBC News|accessdate=2020-01-21}}</ref>。新しいコロナウイルスに対する特定の治療法はないが、既存の[[抗ウイルス薬]]を流用することはできるとしている<ref>{{Cite news|url=https://www.reuters.com/article/us-china-health-pneumonia-who-idUSKBN1ZD16J|title=WHO says new China coronavirus could spread, warns hospitals worldwide|date=2020-01-14|newspaper=Reuters|accessdate=2020-01-21|language=en}}</ref>。 |
2020年[[1月20日]]、[[病原体]]を調査している[[中華人民共和国|中国]]・[[中華人民共和国国家衛生健康委員会|国家衛生健康委員会]] (NHC) 専門家の[[鍾南山]]グループ長は、[[広東省]]でヒトからヒトへの感染（ヒト - ヒト感染）が確認されたと発表した<ref name=":cbc2">{{Cite news|url=https://www.cbc.ca/news/health/coronavirus-human-to-human-1.5433187|title=China confirms human-to-human transmission of new coronavirus|last=|first=|date=Jan 20, 2020|newspaper=CBC News|accessdate=2020-01-21}}</ref>。新しいコロナウイルスに対する特定の治療法はないが、既存の[[抗ウイルス薬]]を流用することはできるとしている<ref>{{Cite news|url=https://www.reuters.com/article/us-china-health-pneumonia-who-idUSKBN1ZD16J|title=WHO says new China coronavirus could spread, warns hospitals worldwide|date=2020-01-14|newspaper=Reuters|accessdate=2020-01-21|language=en}}</ref>。 |
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{{legend|#510000|感染者1,000,000人以上}} |
{{legend|#510000|感染者1,000,000人以上}} |
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{{legend|#900000|感染者100,000-999,999人}} |
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{{legend|#ffdfe0|感染者 |
{{legend|#ffdfe0|感染者1-99人}}]] |
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この株による最初の既知のヒトへの感染は2019年11月下旬に発生した<ref>{{Cite web|url=http://www.who.int/csr/don/12-january-2020-novel-coronavirus-china/en/|title=Novel Coronavirus |
この株による最初の既知のヒトへの感染は2019年11月下旬に発生した<ref>{{Cite web|url=http://www.who.int/csr/don/12-january-2020-novel-coronavirus-china/en/|title=Novel Coronavirus - China|website=[[World Health Organization]] (WHO)|access-date=1 February 2020|archive-url=https://web.archive.org/web/20200123165233/https://www.who.int/csr/don/12-january-2020-novel-coronavirus-china/en/|archive-date=23 January 2020|url-status=live|date=12 January 2020}}</ref><ref name="early-enwiki">{{cite journal|last=Cohen|first=Jon|date=January 2020|title=Wuhan seafood market may not be source of novel virus spreading globally|journal=Science|page=|doi=10.1126/science.abb0611|issn=0036-8075|name-list-format=vanc}}</ref>。新型コロナウイルス (SARS-CoV-2) の拡散は、2019年11月中旬に中国の[[湖北省]][[武漢市]]で最初に発生。その後、中国の全ての省に蔓延し、また[[アジア]]、[[ヨーロッパ]]、[[北アメリカ|北米]]、[[アフリカ]]、[[オセアニア]]など他の160以上の国にも拡散した<ref name="GI2020Update-enwiki">{{cite web|url=https://gisanddata.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6|title=Operations Dashboard for ArcGIS|last=|first=|date=|website=gisanddata.maps.arcgis.com|url-status=live|accessdate=2020-03-01|name-list-format=vanc}}</ref>。このウイルスのヒト - ヒト感染による拡散は、[[アフリカ]]を除く<ref>{{cite news|url=https://www.reuters.com/article/us-china-health-egypt/egypt-confirms-first-coronavirus-case-says-affected-person-is-foreigner-idUSKBN20826K|title=Egypt confirms first coronavirus case, says affected person is a foreigner|publisher=[[Reuters]]|date=15 February 2020|accessdate=15 February 2020|archive-url=https://web.archive.org/web/20200215180753/https://www.reuters.com/article/us-china-health-egypt/egypt-confirms-first-coronavirus-case-says-affected-person-is-foreigner-idUSKBN20826K|archive-date=15 February 2020|url-status=live}}</ref>これらすべての地域で確認されている<ref name="Chan24Jan2020-enwiki">{{Cite journal|date=January 2020|title=A familial cluster of pneumonia associated with the 2019 novel coronavirus indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster|journal=Lancet|volume=395|issue=10223|pages=514-523|doi=10.1016/S0140-6736(20)30154-9|pmid=31986261|vauthors=Chan JF, Yuan S, Kok KH, To KK, Chu H, Yang J, Xing F, Liu J, Yip CC, Poon RW, Tsoi HW, Lo SK, Chan KH, Poon VK, Chan WM, Ip JD, Cai JP, Cheng VC, Chen H, Hui CK, Yuen KY|display-authors=3}}</ref><ref>{{cite journal|date=January 2020|title=Transmission of 2019-nCoV Infection from an Asymptomatic Contact in Germany|journal=N. Engl. J. Med.|volume=|issue=|pages=|doi=10.1056/NEJMc2001468|pmid=32003551|vauthors=Rothe C, Schunk M, Sothmann P, Bretzel G, Froeschl G, Wallrauch C, Zimmer T, Thiel V, Janke C, Guggemos W, Seilmaier M, Drosten C, Vollmar P, Zwirglmaier K, Zange S, Wölfel R, Hoelscher M|display-authors=3}}</ref><ref>{{cite journal|date=30 January 2020|title=The Coronavirus Is Now Infecting More People Outside China|url=https://www.wired.com/story/the-coronavirus-is-now-infecting-more-people-outside-china/|journal=[[Wired (magazine)|Wired]]|accessdate=30 January 2020}}</ref><ref>{{cite news|title=Coronavirus: Singapore reports first cases of local transmission; 4 out of 6 new cases did not travel to China|url=https://www.straitstimes.com/singapore/coronavirus-spore-reports-first-cases-of-local-transmission-4-out-of-6-new-cases-did-not|last1=Khalik|first1=Salma|date=4 February 2020|accessdate=5 February 2020|newspaper=[[The Straits Times]]|archive-url=https://web.archive.org/web/20200204101450/https://www.straitstimes.com/singapore/coronavirus-spore-reports-first-cases-of-local-transmission-4-out-of-6-new-cases-did-not|archive-date=4 February 2020|url-status=live|name-list-format=vanc}}</ref>。 |
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2020年1月下旬時点での主要な[[アウトブレイク]]は[[中国大陸]]に限局されていたが<ref>{{Cite web|title=Wuhan virus: China reports fourth death in pneumonia outbreak; 15 medical workers infected|url=https://www.straitstimes.com/asia/east-asia/china-says-fourth-person-dies-in-wuhan-pneumonia-outbreak|website=straitstimes|date=2020-01-21|accessdate=20 January 2020}}</ref><ref>{{Cite news|title=CDC confirms first US case of coronavirus that has killed 9 in China|url=https://www.cnbc.com/2020/01/21/cdc-to-announce-first-us-case-of-china-coronavirus-that-has-killed-6-cnn-reports.html|date=2020-01-22|accessdate=22 January 2020|author=Berkeley Lovelace Jr.|newspaper=CNBC}}</ref><ref>{{Cite news|title=China virus death toll rises to nine|url=https://www.9news.com.au/world/china-virus-death-toll-rises-to-nine/9da1e621-42e9-40eb-924a-967a46166f74|date=2020-01-22|accessdate=22 January 2020|newspaper=9news.au}}</ref><ref>{{Cite news|title=Wuhan virus: Number of cases soars past 400 in China, death toll rises to 9|url=https://www.channelnewsasia.com/news/wuhan-virus-pneumonia-deaths-number-cases-china-12299846|date=2020-01-22|accessdate=22 January 2020|newspaper=Channelnewsasia}}</ref><ref>{{Cite news|title=French cases show coronavirus has reached Europe|url=https://www.theguardian.com/science/2020/jan/24/french-cases-show-coronavirus-has-reached-europe|work=The Guardian|date=2020-01-24|accessdate=2020-01-24|issn=0261-3077|language=en-GB|agency=Associated Press}}</ref><ref>{{Cite web|title=Wuhan virus: Nepal confirms first case of new coronavirus|url=https://www.straitstimes.com/asia/south-asia/wuhan-virus-nepal-confirms-first-case-of-new-coronavirus|website=The Straits Times|date=2020-01-24|accessdate=2020-01-24|languge=en}}</ref><ref>{{Cite news|url= https://www.yomiuri.co.jp/world/20200127-OYT1T50084/ |title= 速まる感染ペース、中国本土の死者８０人…李首相が武漢市入り |newspaper= 読売新聞オンライン |publisher= 読売新聞 |date= 2020-01-27 |accessdate= 2020-01-28 }}</ref><ref>{{Cite news|title=新型肺炎 中国の患者4515人 死者は106人に|url=https://www3.nhk.or.jp/news/html/20200128/k10012261821000.html|newspaper=NHKニュース|date=2020-01-28|accessdate=2020-01-28}}</ref><ref>{{Cite news|title=新型肺炎、中国で死者１００人突破 患者４５００人超―ＷＨＯトップも北京入り|url=https://www.jiji.com/jc/article?k=2020012800400&g=int|newspaper=時事ドットコム|date=2020-01-28|accessdate=2020-01-28}}</ref><ref>{{Cite web|title=新型肺炎「武漢だけで、２月4日までに最大35万人超が感染」英米研究チーム|author=飯塚真紀子|url=https://news.yahoo.co.jp/byline/iizukamakiko/20200127-00160519/|website=Yahoo!ニュース 個人|date=2020-01-27|accessdate=2020-01-27}}</ref><ref>{{Cite web|title=Read et al. nCoV-2019 early epidemic predictions.pdf|url=https://drive.google.com/file/d/1fz7EwlAJjrZs708YGPym1Xj_3PmysukL/view?usp=embed_facebook|website=Google Docs|date=2020-01-23|accessdate=2020-01-27}}</ref>、その後は[[東アジア]]・[[ヨーロッパ]]を中心とし世界各地に拡散した。 |
2020年1月下旬時点での主要な[[アウトブレイク]]は[[中国大陸]]に限局されていたが<ref>{{Cite web|title=Wuhan virus: China reports fourth death in pneumonia outbreak; 15 medical workers infected|url=https://www.straitstimes.com/asia/east-asia/china-says-fourth-person-dies-in-wuhan-pneumonia-outbreak|website=straitstimes|date=2020-01-21|accessdate=20 January 2020}}</ref><ref>{{Cite news|title=CDC confirms first US case of coronavirus that has killed 9 in China|url=https://www.cnbc.com/2020/01/21/cdc-to-announce-first-us-case-of-china-coronavirus-that-has-killed-6-cnn-reports.html|date=2020-01-22|accessdate=22 January 2020|author=Berkeley Lovelace Jr.|newspaper=CNBC}}</ref><ref>{{Cite news|title=China virus death toll rises to nine|url=https://www.9news.com.au/world/china-virus-death-toll-rises-to-nine/9da1e621-42e9-40eb-924a-967a46166f74|date=2020-01-22|accessdate=22 January 2020|newspaper=9news.au}}</ref><ref>{{Cite news|title=Wuhan virus: Number of cases soars past 400 in China, death toll rises to 9|url=https://www.channelnewsasia.com/news/wuhan-virus-pneumonia-deaths-number-cases-china-12299846|date=2020-01-22|accessdate=22 January 2020|newspaper=Channelnewsasia}}</ref><ref>{{Cite news|title=French cases show coronavirus has reached Europe|url=https://www.theguardian.com/science/2020/jan/24/french-cases-show-coronavirus-has-reached-europe|work=The Guardian|date=2020-01-24|accessdate=2020-01-24|issn=0261-3077|language=en-GB|agency=Associated Press}}</ref><ref>{{Cite web|title=Wuhan virus: Nepal confirms first case of new coronavirus|url=https://www.straitstimes.com/asia/south-asia/wuhan-virus-nepal-confirms-first-case-of-new-coronavirus|website=The Straits Times|date=2020-01-24|accessdate=2020-01-24|languge=en}}</ref><ref>{{Cite news|url= https://www.yomiuri.co.jp/world/20200127-OYT1T50084/ |title= 速まる感染ペース、中国本土の死者８０人…李首相が武漢市入り |newspaper= 読売新聞オンライン |publisher= 読売新聞 |date= 2020-01-27 |accessdate= 2020-01-28 }}</ref><ref>{{Cite news|title=新型肺炎 中国の患者4515人 死者は106人に|url=https://www3.nhk.or.jp/news/html/20200128/k10012261821000.html|newspaper=NHKニュース|date=2020-01-28|accessdate=2020-01-28}}</ref><ref>{{Cite news|title=新型肺炎、中国で死者１００人突破 患者４５００人超―ＷＨＯトップも北京入り|url=https://www.jiji.com/jc/article?k=2020012800400&g=int|newspaper=時事ドットコム|date=2020-01-28|accessdate=2020-01-28}}</ref><ref>{{Cite web|title=新型肺炎「武漢だけで、２月4日までに最大35万人超が感染」英米研究チーム|author=飯塚真紀子|url=https://news.yahoo.co.jp/byline/iizukamakiko/20200127-00160519/|website=Yahoo!ニュース 個人|date=2020-01-27|accessdate=2020-01-27}}</ref><ref>{{Cite web|title=Read et al. nCoV-2019 early epidemic predictions.pdf|url=https://drive.google.com/file/d/1fz7EwlAJjrZs708YGPym1Xj_3PmysukL/view?usp=embed_facebook|website=Google Docs|date=2020-01-23|accessdate=2020-01-27}}</ref>、その後は[[東アジア]]・[[ヨーロッパ]]を中心とし世界各地に拡散した。 |
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4月16日時点では、世界全体の累計で感染者数が200万人を超え、死者も13万3,000人を超えている。アメリカの感染者数は61万人を超え、次いでスペイン17万人超、イタリア16万人超となっている。 |
4月16日時点では、世界全体の累計で感染者数が200万人を超え、死者も13万3,000人を超えている。アメリカの感染者数は61万人を超え、次いでスペイン17万人超、イタリア16万人超となっている。 |
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6月28日には、世界で感染者が1,000万人を超え、死者も50万人を超えている。アメリカの感染者数は251万人を超え、次いでブラジルが131万人、ロシア63万人、インド52万人と続き、上位4カ国の合計が世界全体の約半数を占めた。<ref>{{Cite web|url=https://www.nikkei.com/article/DGXMZO60904010Y0A620C2MM8000/|title=コロナ感染、世界で1000万人 |
6月28日には、世界で感染者が1,000万人を超え、死者も50万人を超えている。アメリカの感染者数は251万人を超え、次いでブラジルが131万人、ロシア63万人、インド52万人と続き、上位4カ国の合計が世界全体の約半数を占めた。<ref>{{Cite web|url=https://www.nikkei.com/article/DGXMZO60904010Y0A620C2MM8000/|title=コロナ感染、世界で1000万人 新興国で急増|accessdate=2020年7月10日|publisher=日本経済新聞}}</ref> |
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{{see also|重症急性呼吸器症候群#兆候と症状}}<!--see also タグは、現在リソース不足でSARSを準用するという意味で-->主症状は2020年1月21日判明分で、40℃程度の高熱 (98%) 、乾いた[[咳嗽|咳]] (76%) 、息切れ (55%) などである<ref>{{cite journal|last1=Wang|first1=Chen|last2=Horby|first2=Peter W.|last3=Hayden|first3=Frederick G.|last4=Gao|first4=George F.|date=24 January 2020|title=A novel coronavirus outbreak of global health concern|journal=[[The Lancet]]|doi=10.1016/S0140-6736(20)30185-9|doi-access=free}}</ref><ref>{{Cite journal|date=2020-02-01|title=Template:2019-20 Wuhan coronavirus data/Patients characteristics|url=https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Template:2019-20_Wuhan_coronavirus_data/Patients_characteristics&oldid=938585560|journal=Wikipedia|language=en}}</ref>。他に、[[全身倦怠感]]、吐き気、筋肉痛等を催すと報告されている<ref name=":3" /><ref name=":4" />。顕著な合併症は[[肺炎]]である。しかし症状がないまま濃厚接触をしてしまう事が度々ある<ref name=":5">{{Cite web|url=https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000164708_00001.html|website=www.mhlw.go.jp|accessdate=2020-01-27|title=中華人民共和国湖北省武漢市における新型コロナウイルス関連肺炎の発生について|publisher=厚生労働省 (日本)}}</ref>。 |
{{see also|重症急性呼吸器症候群#兆候と症状}}<!--see also タグは、現在リソース不足でSARSを準用するという意味で-->主症状は2020年1月21日判明分で、40℃程度の高熱 (98%) 、乾いた[[咳嗽|咳]] (76%) 、息切れ (55%) などである<ref>{{cite journal|last1=Wang|first1=Chen|last2=Horby|first2=Peter W.|last3=Hayden|first3=Frederick G.|last4=Gao|first4=George F.|date=24 January 2020|title=A novel coronavirus outbreak of global health concern|journal=[[The Lancet]]|doi=10.1016/S0140-6736(20)30185-9|doi-access=free}}</ref><ref>{{Cite journal|date=2020-02-01|title=Template:2019-20 Wuhan coronavirus data/Patients characteristics|url=https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Template:2019-20_Wuhan_coronavirus_data/Patients_characteristics&oldid=938585560|journal=Wikipedia|language=en}}</ref>。他に、[[全身倦怠感]]、吐き気、筋肉痛等を催すと報告されている<ref name=":3" /><ref name=":4" />。顕著な合併症は[[肺炎]]である。しかし症状がないまま濃厚接触をしてしまう事が度々ある<ref name=":5">{{Cite web|url=https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000164708_00001.html|website=www.mhlw.go.jp|accessdate=2020-01-27|title=中華人民共和国湖北省武漢市における新型コロナウイルス関連肺炎の発生について|publisher=厚生労働省 (日本)}}</ref>。 |
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2月20日までのWHOと中国の専門家による調査では、典型的な症状・徴候として発熱 |
2月20日までのWHOと中国の専門家による調査では、典型的な症状・徴候として発熱(87.9%)、咳(67.7%)、疲労(38.1%)、痰(33.4%)、息切れ (18.6%)、のどの痛み(13.9%)、頭痛(13.6%)、筋肉痛・関節痛(14.8%)、悪寒 (11.4%)などが報告されている<ref>{{Cite web|title=コロナウイルス病 2019（COVID-19）に関するWHO-中国合同ミッション報告書|url=https://extranet.who.int/kobe_centre/sites/default/files/pdf/WHO%E4%B8%AD%E5%9B%BD%E5%90%88%E5%90%8C%E3%83%9F%E3%83%83%E3%82%B7%E3%83%A7%E3%83%B3%E5%A0%B1%E5%91%8A%E6%9B%B8_20200309.pdf|format=PDF|website=WHO Kobe|accessdate=2020-03-16|language=ja|publisher=}} [https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/who-china-joint-mission-on-covid-19-final-report.pdf Report of the WHO-China Joint Mission on Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)],WHO,2020-2-24</ref>。 |
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他のコロナウイルス科ウイルス感染症<ref group="注">[[重症急性呼吸器症候群|SARS]]、[[中東呼吸器症候群|MERS]]ほか</ref>との鑑別は外観所見上からは難しい。ただし、発熱せずに死亡した患者もいるので、発熱検知装置だけで検出できない可能性もある。また、[[無症候性キャリア|無症候キャリア]]が感染能を持つ可能性もある<ref name=":3">{{Cite web|title=中国の新型コロナウイルス、発熱せず死亡も－水際での阻止困難|url=https://www.msn.com/ja-jp/news/world/%E4%B8%AD%E5%9B%BD%E3%81%AE%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B3%E3%83%AD%E3%83%8A%E3%82%A6%E3%82%A4%E3%83%AB%E3%82%B9%E3%80%81%E7%99%BA%E7%86%B1%E3%81%9B%E3%81%9A%E6%AD%BB%E4%BA%A1%E3%82%82%EF%BC%8D%E6%B0%B4%E9%9A%9B%E3%81%A7%E3%81%AE%E9%98%BB%E6%AD%A2%E5%9B%B0%E9%9B%A3/ar-BBZfk0n|website=www.msn.com|accessdate=2020-01-23|publisher=|date=2020/01/23}}</ref><ref name=":4">{{Cite web|title=新型肺炎「無症状の潜伏期間に他人に感染させる可能性」専門家|url=https://www3.nhk.or.jp/news/html/20200127/k10012260501000.html|website=NHKニュース|accessdate=2020-01-30|last=日本放送協会}}</ref>。 |
他のコロナウイルス科ウイルス感染症<ref group="注">[[重症急性呼吸器症候群|SARS]]、[[中東呼吸器症候群|MERS]]ほか</ref>との鑑別は外観所見上からは難しい。ただし、発熱せずに死亡した患者もいるので、発熱検知装置だけで検出できない可能性もある。また、[[無症候性キャリア|無症候キャリア]]が感染能を持つ可能性もある<ref name=":3">{{Cite web|title=中国の新型コロナウイルス、発熱せず死亡も－水際での阻止困難|url=https://www.msn.com/ja-jp/news/world/%E4%B8%AD%E5%9B%BD%E3%81%AE%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B3%E3%83%AD%E3%83%8A%E3%82%A6%E3%82%A4%E3%83%AB%E3%82%B9%E3%80%81%E7%99%BA%E7%86%B1%E3%81%9B%E3%81%9A%E6%AD%BB%E4%BA%A1%E3%82%82%EF%BC%8D%E6%B0%B4%E9%9A%9B%E3%81%A7%E3%81%AE%E9%98%BB%E6%AD%A2%E5%9B%B0%E9%9B%A3/ar-BBZfk0n|website=www.msn.com|accessdate=2020-01-23|publisher=|date=2020/01/23}}</ref><ref name=":4">{{Cite web|title=新型肺炎「無症状の潜伏期間に他人に感染させる可能性」専門家|url=https://www3.nhk.or.jp/news/html/20200127/k10012260501000.html|website=NHKニュース|accessdate=2020-01-30|last=日本放送協会}}</ref>。 |
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== 研究事例 == |
== 研究事例 == |
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*'''川崎病発症との関連''' |
*'''川崎病発症との関連''' |
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**欧米において、SARS-Cov-2感染と[[川崎病]]発症の関連が疑われているが、報告も少なく診断の点で問題があり、川崎病ではなく、全身性血管炎として推移を見守ればよい<ref>[https:// |
**欧米において、SARS-Cov-2感染と[[川崎病]]発症の関連が疑われているが、報告も少なく診断の点で問題があり、川崎病ではなく、全身性血管炎として推移を見守ればよい<ref>横田俊平, 名古希実, 金田宜子, 土田博和, 森雅亮, 「[https://doi.org/10.14961/cra.32.98 新型コロナウイルス感染（SARS-CoV-2）と小児：新生児から思春期まで～抗リウマチ薬治療下にある小児リウマチ性疾患児は治療変更が必要か～]」『臨床リウマチ』 2020年 32巻 2号 p.98-107, {{doi|10.14961/cra.32.98}}。</ref>。 |
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*'''二次被害''' |
*'''二次被害''' |
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**家庭内暴力・子ども虐待、子どもの貧困問題、性的虐待、ストレスによる過食・肥満などの女性の心身への2次被害、健康被害が増加することが予想される<ref>[https:// |
**家庭内暴力・子ども虐待、子どもの貧困問題、性的虐待、ストレスによる過食・肥満などの女性の心身への2次被害、健康被害が増加することが予想される<ref>森恵美, 『[https://doi.org/10.18977/jspog.25.1_1 新型コロナウイルス感染拡大に思うこと]」『女性心身医学』25巻 1号 2020年 p.1, {{doi|10.18977/jspog.25.1_1}}。</ref>。 |
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*'''栄養学''' |
*'''栄養学''' |
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**感染予防能は肥満者と十分な栄養を摂っている人で高いことが判っている<ref>[https:// |
**感染予防能は肥満者と十分な栄養を摂っている人で高いことが判っている<ref>風見公子, 「[https://doi.org/10.3861/kenko.86.3_97 新型コロナウイルス感染症対策に食事から出来ること]」『日本健康学会誌』 86巻 3号 2020年 p.97-98, {{doi|10.3861/kenko.86.3_97}}。</ref>。 |
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*'''視点''' |
*'''視点''' |
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**ウイルスに意図や道徳的視野を与えることは妥当ではない<ref>[https:// |
**ウイルスに意図や道徳的視野を与えることは妥当ではない<ref>[https://hdl.handle.net/2268/248155 新型コロナウィルス時代の情熱とは]</ref>。 |
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*'''ソーシャルメディアの感情分析''' |
*'''ソーシャルメディアの感情分析''' |
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**新型コロナウイルスが日本に上陸し、北海道で緊急事態宣言がなされて以降、ツイートを行ったユーザの偏りがほぼ無くなり、新型コロナウイルスが一般的な話題になった<ref>[https:// |
**新型コロナウイルスが日本に上陸し、北海道で緊急事態宣言がなされて以降、ツイートを行ったユーザの偏りがほぼ無くなり、新型コロナウイルスが一般的な話題になった<ref>鳥海不二夫, 榊剛史, 吉田光男, 「[https://doi.org/10.1527/tjsai.F-K45 ソーシャルメディアを用いた新型コロナ禍における感情変化の分析]」『人工知能学会論文誌』 35巻 4号 2020年 p.F-K45_1-7, {{doi|10.1527/tjsai.F-K45}}。</ref>。 |
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*'''交通事故対策との関係''' |
*'''交通事故対策との関係''' |
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**新型ウイルスの感染拡大防止対策と交通安全対策は、ことの性質はまったく異なるが、考慮すべき要素は似ている<ref>[https:// |
**新型ウイルスの感染拡大防止対策と交通安全対策は、ことの性質はまったく異なるが、考慮すべき要素は似ている<ref>岡村和子, 「[https://doi.org/10.24572/iatssreview.45.1_3 新型コロナウイルスと交通安全]」『IATSS Review（国際交通安全学会誌）』 2020年 45巻 1号 p.3, {{doi|10.24572/iatssreview.45.1_3}}。</ref>。 |
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*'''漢方薬を使用した例''' |
*'''漢方薬を使用した例''' |
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**COVID-19のセルフメディケーションとして、漢方薬にビタミンとハトムギを併用摂取した例がある<ref>[https:// |
**COVID-19のセルフメディケーションとして、漢方薬にビタミンとハトムギを併用摂取した例がある<ref>鈴木信孝, 「[https://doi.org/10.1625/jcam.17.93 ― 症例報告 ― 玉屏風散を使用した新型コロナウイルス感染症(COVID-19) の1 例}」『日本補完代替医療学会誌』 17巻 1号 2020年 p.93-94, {{doi|10.1625/jcam.17.93}}。</ref>。 |
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*'''仮想空間の活用''' |
*'''仮想空間の活用''' |
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**持続可能な価値提供を行う上で仮想空間の活用は避けて通ることはできない<ref>[https://www.ssocj.jp/wordpress/wp-content/uploads/2020/07/78-7_message.pdf 新型コロナウイルス感染症に対応した協会活動について]</ref>。 |
**持続可能な価値提供を行う上で仮想空間の活用は避けて通ることはできない<ref>[https://www.ssocj.jp/wordpress/wp-content/uploads/2020/07/78-7_message.pdf 新型コロナウイルス感染症に対応した協会活動について]</ref>。 |
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2020年8月3日 (月) 09:23時点における版
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 | このページのノートに、このページに関する注意があります。（2020年7月） 注意の要約：「ウイルス（SARS-CoV-2）が流行」と言うよりは「ウイルスによる感染症（COVID-19）が流行」であるため、各記事で影響等を記述する際は、本記事よりも新型コロナウイルス感染症 (2019年)へリンクすべき。 |
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| 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2） |
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| 分類 |
重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2型[注 1]（じゅうしょうきゅうせいこきゅうきしょうこうぐんコロナウイルス2がた、英: severe acute respiratory syndrome coronavirus 2、略称: SARS-CoV-2、中国語: 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2）は、新型コロナウイルス感染症（COVID-19）[2]の原因となる、SARS関連コロナウイルス（SARSr-CoV）に属するコロナウイルスである[3]。日本の国家機関や主要な報道機関は新型コロナウイルスと呼んでおり[4][5]、新型コロナと省略される場合もある[5][6][7][8]。
2019年11月に中華人民共和国湖北省武漢市付近で発生が初めて確認され[9]、その後、COVID-19の世界的流行（パンデミック）を引き起こしている[10][11][12]。21世紀以降、自然破壊などの結果として新型ウイルスの流行が急増した[13][14]が、その中でも世界の殆どの国に感染が拡大した初めてのウイルスとなった。国によって異なる流行像がある[15]。
名称
このウイルスの国際的な公式名称は、severe acute respiratory syndrome coronavirus 2（略称: SARS-CoV-2）であり、疾病の名称は、coronavirus disease（略称: COVID-19）[1]である。
2020年1月7日、世界保健機関 (WHO) は、中国武漢で発生している疾患の原因であるウイルスを2019-nCoV（2019 novel coronavirus の略称）と暫定的に命名した[1][16][17][18][19][注 2]。この呼称は厚生労働省公式ウェブサイトのほか[20]、国立感染症研究所作成の「病原体検出マニュアル 2019-nCoV」と[21]、これを基にした「2019-nCoV 遺伝子検査方法」にも使用されているため[22]、体外医薬品の名称などにみられる[23][24][25]（詳細は後述）。
同年2月11日、国際ウイルス分類委員会 (ICTV) がSARS-CoV-2（Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 の略称）と正式命名した[3][26][27][28]。この日本語訳が重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2である[29][30]。また、SARSコロナウイルス-2[31][32]やSARSコロナウイルス2[33][34]、サーズコロナウイルス2[35]（読み: サーズコロナウイルス ツー[35]）などと呼称・表記される場合もある。
日本の国家機関や主要な報道機関は単に新型コロナウイルスと呼称している[4][5][6][19][36]。
WHOは2020年2月11日、新型コロナウイルスによる疾患をCOVID-19（Coronavirus disease 2019 の略称）と命名している[37]。
2019-nCoVという呼称
2019-nCoVは、正式名SARS-CoV-2が決定されるまでの暫定名称であるが、正式名称が出される前に発行された文書が、遡って修正されることはない[1]。
前述のとおり、ウイルスの名称と疾病の名称は異なる。国際ウイルス分類委員会 (ICTV) の命名によって新型コロナウイルスの正式な英語表記は severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) となり、また、その疾病の名称が coronavirus disease (COVID-19) となった。世界保健機関 (WHO) もこの名称を公式名称としている[1]。ただし、2019-nCoVという呼称を継続して使用する地域や公的機関[20]、分野なども存在する。
厚生労働省公式ウェブサイトの英語表記ページには「3.Q & A on 2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV)」などの表記が複数あり、公式の呼称として2019-nCoVを使用していた[20]。国立感染症研究所は同研究所作成の「2019-nCoV 遺伝子検査方法」で呼称するほか[22]、公文において「新型コロナウイルス 2019-nCoV（SARS-CoV-2）」とも併記している[38]。宮城県はこのウイルスに関する一般電話相談窓口開設の案内において「新型のコロナウイルス(2019-nCoV)」と併記[39]。同様に青森県は「週報青森県感染者発生情報」において、感染者の人数を「新型のコロナウイルス（2019-nCoV）：〇〇人」と表記している[40]。東京都は「新型コロナウイルス感染症FAQ」にて、国立感染症研究所「新型コロナウイルス（2019-nCoV）」をリンクしており[41]、愛知県の「新型コロナウイルス感染症対策サイト」にも同様のリンクがされている[42]。また体外医薬品においては、本体に2019-nCoVとだけ表示されている製品もある[23][24][25]。
呼称に関する論争
アメリカ合衆国などでは発生地の名前を付けて武漢ウイルス、中国ウイルスなどと呼称すべきだとする意見が出るなど論争となっている[43][44][45][46]。
分類と系統
「オルトコロナウイルス亜科#分類」も参照
新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）は、ゲノムとして一本鎖プラス鎖RNAを持つ、コロナウイルスに属している。この仲間は哺乳類や鳥類に感染する非常に多数の種を含むが、人に感染症を引き起こすものだけでも、重篤な肺炎の原因となるSARSコロナウイルス (SARS-CoV) やMERSコロナウイルス (MERS-CoV) 、季節性の風邪を引き起こすヒトコロナウイルス229E (HCoV-229) やHCoV-OC43、HCoV-NL63、HCoV-HKU1などがある。SARS-CoV-2は、2019年にヒトに対して病原性を有する7番目のコロナウイルスとして出現したものである。
このウイルスは国際ウイルス分類委員会 (ICTV) により、SARSコロナウイルス (SARS-CoV) と同じ種（の姉妹系統）と見なされており、ベータコロナウイルス属のSARS関連コロナウイルス (SARSr-CoV) という種に属している[3]。ただし、SARSコロナウイルスの直接の子孫ではない[47]。元々コウモリなどの野生動物が保因していたものが、それぞれ独立してヒトに伝播、ヒトへの感染能力を獲得したと考えられている[47]。
2020年3月26日には、マレーセンザンコウからゲノムが85〜92%類似するコロナウイルスが発見されており、これらはよりSARS-CoV-2の祖先に近いと考えられる[48][49]。
ゲノム配列
 コロナウイルスのゲノム構成 | |
| NCBIゲノムID | MN908947 |
|---|---|
| ゲノムサイズ | 29,903 bases |
| 完了年 | 2020 |
このウイルスの完全ゲノム配列は上海公共衛生臨床センター、武漢市中心医院、華中科技大学、武漢市疾病予防控制中心、中国疾病預防控制中心感染症予防管理所、中国疾病管理予防センター、シドニー大学らの協力によって解読され、シドニー大学のエドワード・C・ホルムズ教授の協力の下、上海公共衛生臨床センターの張永振教授によって2020年1月11日にVirological.org上に公開された[50]。
その後、1月14日には国際核酸配列データベースGenBankで正式に公開されている[51]。他種のコロナウイルスと比較すると、中国浙江省舟山市のコウモリから発見されたSARSウイルスに一番近く、コウモリSARSウイルス、ヒトSARSウイルス、ジャコウネコSARSウイルスとも80%近くの類似度を持つことが、香港大学微生物学科感染症専門の袁国勇教授により報告されている[52]。
構造
黄色の付着物:エンベロープタンパク[53]。
ウイルス粒子（ビリオン）は、50〜200 nm（ナノメートル）ほどの大きさである[54]。一般的なコロナウイルスと同様に、S（スパイク）タンパク質、N（ヌクレオカプシド）タンパク質、M（膜）タンパク質、E（エンベロープ）タンパク質として知られる4つのたんぱく質と、RNAにより構成されている。このうち、Nタンパク質がRNAと結合してヌクレオカプシドを形成し、脂質と結合したS、EおよびMタンパク質がその周りを取り囲んでエンベロープを形成する。エンベロープの最も外側に位置するSタンパク質は、細胞表面のACE2受容体に結合して細胞への感染を可能とする[55]。ヒトへの感染にACE2受容体を利用する点はSARSコロナウイルス（SARS-CoV）と共通しており、DPP-4受容体を利用するMERSコロナウイルス（MERS-CoV）や、アミノペプチダーゼN (APN) を利用するヒトコロナウイルス229Eとは異なる[56]。ウイルスゲノムは29,903 塩基で、一本鎖プラス鎖RNAウイルスである[57]。
タンパク質やRNAのSARSコロナウイルスとの相同性は、Sタンパク質が76.0%、Nタンパク質が90.6%、Mタンパク質が90.1%、Eタンパク質が94.7%[58]、RNAが80%となっている[55][59]。一方で同じベータコロナウイルスの中でも別種[3]のMERSコロナウイルスとは、それぞれ4.6%、7.6%、6.3%、30.5%[58]、50%[55]しか一致していない。
SARS-CoV-2には、SARSコロナウイルスと異なり、Sタンパク質に感染力と病原性を高めるフーリン切断部位が存在する[60]。これはサルベコウイルスの中では他に例が無いが、コロナウイルス科全体で見れば珍しいものではなく、多くのマウス肝炎コロナウイルス（MHV-JHMやMHV-A59）やヒトコロナウイルス（MERS-CoV、HCoV-OC43）などが同様の部位を保有している[61]。
病原体
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基本再生産数
SARS-CoV-2の基本再生産数（R0）の見積もりに関する未査読の多くの研究は、数字の差異があり、また評価が分かれているが、R0は1.4 - 3.9と推定されている[62][63][64][65]。これは無防備な状態では、SARS-CoV-2は通常、感染者1人当たり1.4から3.9人の新規感染者を生じさせるという意味である。これにより、SARS-CoV-2は少なくとも4人を連鎖的に感染させる事が確認されている[66]。
他の未査読の研究では、基本再生産数を3.30 - 5.47とするもの[67]、2.13[68] - 4.82[69][70]とするものがある。
動物への感染
ベルギー保健当局は感染者から猫にウイルスが伝染する事例があるとした[71]。その他、犬[72]やトラ[73]からもSARS-CoV-2が検出された事例がある。
中国の研究チームの報告によると、猫はSARS-CoV-2への感受性が高く、飛沫感染により猫から猫へ感染を起こすケースもあったという。猫のほかにはフェレットも感受性が高いが、犬や豚、ニワトリ、アヒルでは増殖しなかった[74]。ウイルス学者である河岡義裕は、マウスよりもハムスターへの感染症状が顕著に出るという結果を出している[75]。
複数型の存在
中国からの報告
2020年3月、このウイルス（中国内外の103例）を北京大学など中国の研究チームが遺伝子解析した結果、コウモリ由来のウイルスに近く古くからあるとみられるS型（全体の3割）と毒性の強弱は不明だが頻度が高いとみられるL型（全体の7割。武漢市の流行では大半を占めるが、市外の流行では現在は減少傾向にある）という塩基配列の異なる2つの型に分類できることが分かった[76][77][78][79]。
患者の多くは片方の型にしか感染していないものの両方の型に感染した例も確認されており、ウイルスに一度感染し症状が治っても別の型に「再感染する」と言う報道もあるが[76][78]。再感染の可能性および原因については議論があり今後の研究・検討を要する[80]。
2020年3月23日の時点では以下の事が判明している。本ウイルスの主要な株はL型（L亜型）とS型（S亜型）に分かれる[81][82]。ウイルスのRNAの第28,144番目の塩基の違いにより指定されるアミノ酸がロイシン（L型）かセリン（S型）かによって区別される[83]。
L型
中国武漢市での初期流行ではL型が支配的[83]。当初の報告ではL型はより攻撃的で、より急速に蔓延するとされていた[注 3]。そのため、流行対策による人的介入のため選択圧が掛かり割合的に減少したと見られている[82]。ただし、後に「感染力が強い」と言う点については修正され、「頻度が高い」に表現が改められている[84]。
S型
進化的に古く、変異前（先祖型）のものと見られている。攻撃性が低いため選択圧が弱く、相対的に割合が増加したと見られる[81][82]。
イギリス・ケンブリッジ大学などからの報告
2020年4月のイギリス・ケンブリッジ大学などによる報告では、このウイルスはA、B、Cの3つの型に分けられるとした。Aは中国のコウモリ由来のウイルスに近く、中国や日本の感染者でも見つかったが、米国やオーストラリアの感染者が多かった。Ａから変異したＢが武漢市を中心として中国や近隣諸国で爆発的に増えたとみられ、欧米などに飛び火した例は少なかった。Ｂから変異したＣはイタリア、フランス、英国など欧州で多かった[85][86]。
日本バイオデータからの報告
株式会社日本バイオデータによる査読前論文では、ウイルスのRNA配列のうち第8782番目、第28144番目、第29095番目の塩基に着目し、本ウイルスをTCC、TCT、CTCの3つの型に分類した[87]。TCCおよびTCTは中国のグループの示すS型、イギリスのグループが示すA型に相当する。またCTCは中国のグループが示すL型、イギリスのグループが示すB型およびC型に相当する。
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培養されたヒト細胞から放出されているSARS-CoV2ビリオン（黄色）のカラー化SEM写真。
免疫細胞への感染能力
新型コロナウイルスは、T細胞の細胞株であるMT-2細胞株およびA3.01細胞株それぞれに対し、SARSコロナウイルス（SARS-CoV）と新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）を感染させ比較したところ、SARS-CoVは細胞に感染しなかったのに対し、SARS-CoV-2は細胞へ感染したと報告された[88]。ただし細胞内でのウイルスの複製はできなかったと報告されている。2020年6月8日、本研究に用いた手法および結論に対する信頼性に懸念が生じたとして、本論文の編集者により現在この論文で用いられた手法および結論が正しかったかどうかを調査中である旨が発表された。その後の検証で、初代培養のT細胞ではなく細胞株を用いていたことやフローサイトメトリーの手法に瑕疵があったことを理由に、本論文は撤回された[88]。
発見
新型コロナウイルスは2019年11月に中国武漢で発生が確認され、同年12月31日に最初に世界保健機関 (WHO) に報告された[89]。その後2019年から翌2020年にかけて発生した中国武漢でのアウトブレイクにおいて肺炎患者の核酸検査陽性患者サンプルにより、ゲノム配列が決定された[90][91][92]。
2020年1月20日、病原体を調査している中国・国家衛生健康委員会 (NHC) 専門家の鍾南山グループ長は、広東省でヒトからヒトへの感染（ヒト - ヒト感染）が確認されたと発表した[93]。新しいコロナウイルスに対する特定の治療法はないが、既存の抗ウイルス薬を流用することはできるとしている[94]。
感染の拡大
詳細は「新型コロナウイルス感染症の流行 (2019年-)」および「国・地域毎の2019年コロナウイルス感染症流行状況」を参照
感染者1,000,000人以上
感染者100,000-999,999人
感染者10,000-99,999人
感染者1,000-9,999人
感染者100-999人
感染者1-99人
この株による最初の既知のヒトへの感染は2019年11月下旬に発生した[95][96]。新型コロナウイルス (SARS-CoV-2) の拡散は、2019年11月中旬に中国の湖北省武漢市で最初に発生。その後、中国の全ての省に蔓延し、またアジア、ヨーロッパ、北米、アフリカ、オセアニアなど他の160以上の国にも拡散した[97]。このウイルスのヒト - ヒト感染による拡散は、アフリカを除く[98]これらすべての地域で確認されている[99][100][101][102]。
2020年1月下旬時点での主要なアウトブレイクは中国大陸に限局されていたが[103][104][105][106][107][108][109][110][111][112][113]、その後は東アジア・ヨーロッパを中心とし世界各地に拡散した。
2020年1月31日、このウイルスの感染拡大が懸念されることから世界保健機関 (WHO) は「国際的に懸念される公衆衛生上の緊急事態」(PHEIC) を宣言した[114][115][116][注 4]。なお、季節性疾患としての自然終息や定着の可能性について議論が続いている。
3月7日現在も感染拡大が止まらず、世界で感染者数が100,000人を超えたと発表した。
3月11日にはこのウイルスの感染拡大について、WHOがパンデミック（世界的流行）相当との認識を初めて示した[10][11][12]。
4月2日には、世界全体の累計で100万人を超え死者も5万1,000人を上回った[119]。感染者が見つかった世界177カ国・地域のうちアメリカが16万人超と世界最多となり、続いてイタリアが10万人を突破した。 4月16日時点では、世界全体の累計で感染者数が200万人を超え、死者も13万3,000人を超えている。アメリカの感染者数は61万人を超え、次いでスペイン17万人超、イタリア16万人超となっている。
6月28日には、世界で感染者が1,000万人を超え、死者も50万人を超えている。アメリカの感染者数は251万人を超え、次いでブラジルが131万人、ロシア63万人、インド52万人と続き、上位4カ国の合計が世界全体の約半数を占めた。[120]
症状
無症状病原体保有者
当ウイルスに感染していても病気の症状が現れない者がいる。これを無症状病原体保有者と言う。無症状病原体保有者は、その保有する当ウイルスを他者に感染させる可能性がある[121]。
嗅覚・味覚の麻痺
感染者が嗅覚や味覚を喪失したとの報告が世界各地で散見される。イギリスの耳鼻咽喉科学会は声明で韓国や中国、イタリアで新型コロナウイルス感染者の多くが嗅覚障害を訴え、ドイツでは感染確認者の3分の2以上に症状が出ていると指摘[122][123]。（発熱・咳などの）他の症状を伴わないのに嗅覚異常が出る場合もあり、イギリス、イラン、アメリカでも報告が増えている、という[122][123]。アメリカの耳鼻咽喉科学会も「嗅覚や味覚障害の報告が急激に増えている」と認めている[122][123]。アメリカ・イギリスの専門家からは感染予防のためにも（嗅覚異常者を）ウイルス検査の対象に加えるべきだ、との声が出ている。一方で日本の医師によると、普通感冒でも嗅覚や味覚が一時的に失われる事はあると言う[122][123]。新型コロナウイルス感染における嗅覚や味覚の麻痺が、ふつうの感冒とは異なる性質をもつのかどうか、世界の50か国にまたがる約600人の医師や科学者が国際コンソーシアムを結成し、日本を含む各国で調査を開始している[124]。
これに関連して、プロ野球・阪神タイガースの選手ら数名が、発熱やせきなどの症状がなかったのにもかかわらずにおいを感じなかったので、当ウイルスへの感染を疑い、PCR検査を受けたところ陽性で当ウイルスに感染していたことが判明した。阪神の藤浪晋太郎投手は発熱やせきなどの症状はないが、（3月26日の）数日前からトレーナーに「コーヒーやワインのにおいを感じない」[125]と嗅覚の異常を訴え、兵庫県内の病院で3月24日および25日に診察を受け、医師の判断で新型コロナウイルス感染を調べるPCR検査の受診が決まり、検査の結果、陽性反応が出たことを26日、関係者が公表した[126]。阪神では、他にも2名が「みそ汁の味がしない」と訴え、PCR検査を受けたところ陽性が判明した[125]。
急性呼吸器疾患
詳細は「新型コロナウイルス感染症 (2019年)」を参照
- 特徴
「重症急性呼吸器症候群#兆候と症状」も参照
主症状は2020年1月21日判明分で、40℃程度の高熱 (98%) 、乾いた咳 (76%) 、息切れ (55%) などである[127][128]。他に、全身倦怠感、吐き気、筋肉痛等を催すと報告されている[129][130]。顕著な合併症は肺炎である。しかし症状がないまま濃厚接触をしてしまう事が度々ある[131]。
2月20日までのWHOと中国の専門家による調査では、典型的な症状・徴候として発熱(87.9%)、咳(67.7%)、疲労(38.1%)、痰(33.4%)、息切れ (18.6%)、のどの痛み(13.9%)、頭痛(13.6%)、筋肉痛・関節痛(14.8%)、悪寒 (11.4%)などが報告されている[132]。
他のコロナウイルス科ウイルス感染症[注 5]との鑑別は外観所見上からは難しい。ただし、発熱せずに死亡した患者もいるので、発熱検知装置だけで検出できない可能性もある。また、無症候キャリアが感染能を持つ可能性もある[129][130]。
入院患者では呼吸困難や胸の圧迫感も多い。また、入院時のバイタルサインは比較的安定している[133]。
- 予後
詳細は「新型コロナウイルス感染症 (2019年)#予後」を参照
治療
詳細は「新型コロナウイルス感染症 (2019年)」および「#治療法」を参照
2020年7月現在日本では、レムデシビルとデキサメタゾンが治療薬となっている[134]。挙国体制で専用ワクチンの開発が行われている。
問題点
医療現場の抱える問題
感染症発生初期において医師などの医療従事者への罹患、及び長時間労働などによる疲弊といった問題も浮上してくる。局所的地域感染から広域に拡大するにつれ同定された問題も増加する傾向にあり、医療現場の過酷化する環境にも配慮が必要である。
感染症と社会構造
発達した情報通信環境において、ソーシャルメディアによる情報の拡散は情報確度を担保しうる反面、誤った情報も伝搬しうる二律背反を構築している。
感染経路
詳細は「新型コロナウイルス感染症 (2019年)#感染経路」を参照
このウイルスの感染経路は、飛沫感染、接触感染、エアロゾル感染などがあり[135]、ウイルスは（少なくとも）3時間程度は室内の空気中をエアロゾルとともに漂いつづけ感染力を持ち続けるということが確認された[135]。
接触感染の経路には、電車やバスのつり革、ドアノブ、エレベーターや電気機器のスイッチなどが挙げられる[136]。
2020年2月7日、武漢大学病院で検出された感染者数のうち4割は、同大学病院で院内感染したものだという論文が発表された[137]。
感染予防と拡散抑止
詳細は「新型コロナウイルス感染症 (2019年)#感染予防と拡散抑止」を参照
2020年1月10日、国立感染症研究所 (NIID) は特設サイトを設け[138]、院内感染対策、積極的疫学調査をはじめとする対応を行っている。
- 院内感染対策 - インフルエンザ等の一般的な呼吸器感染症の病原体の微生物学的な検査を行いつつ、疑似症サーベイランスの届出について保健所へ相談する[139]。
- 積極的疫学調査 - 「患者（確定例）」と「濃厚接触者」について、基本情報・臨床情報・推定感染源・接触者等必要な情報を収集[140]。患者（確定例）対面調査を行う際は、眼の防護具[注 6]、長袖ガウン、必要に応じてサージカルマスクではなく N95マスクを着用するとしている[140]。
- 検体採取・輸送マニュアル - SARS・MERSに対する病原体診断を参考に、鳥インフルエンザ A (H5N1 / H7N9) に準じた検体の採取を行い、「病毒を移しやすい物質カテゴリーB」を取り扱う輸送業者を利用して送付[141]。
2020年3月18日、世界保健機関 (WHO) は感染予防と拡散抑止の方策として、「こまめに水と石鹸による手洗い」「公共の場などで1mほどの間隔をとる」「目、口、鼻などにできるだけ触れない」「他者のため肘やティッシュや布などで鼻と口を覆う」「発熱や咳（せき）、呼吸困難の症状が出ている場合、医療機関に相談する」「最新で確実な情報にもとづき判断し、また地域の医療従事者等の助言に従う」などがあると助言した[142]。
予防法
 | ここでは新型コロナウイルス感染症の症状の（対症療法的な）治療法は説明しないようにして下さい。 |
手など皮膚の消毒を行う場合には、消毒用アルコール (70%) が、物の表面の消毒には次亜塩素酸ナトリウム (0.1%) が有効であることが分かっているほか[143]、エタノールや次亜塩素酸ナトリウム、オキシドール（0.5%）により、残存するウイルスの数を1万分の1にすることができる[144]。
物の表面に付着したウイルスがどの程度の期間生存できるかについては、各機関で意見が分かれており、WHOは数時間[注 7]、ドイツ研究は4〜5日間[注 8]、中国人民銀行は14日間[注 9]とした。アメリカ疾病管理予防センター (CDC) は、2020年1月時点では「中国からの輸入品において新型コロナウイルスに感染するリスクは非常に低い」との見解を発表[149]するにとどめていたが、2020年3月に日本の横浜港に検疫のため停泊していたクルーズ船ダイヤモンドプリンセスの船内調査を行い、その調査報告書において「全乗客を下船させてから最長17日後まで微量のウイルスが残存していた」としている[150]。
このウイルスは、通常のインフルエンザウイルスと同様の感染予防法が有効であると考えられており、手指や顔を石鹸で洗う[136]、粘膜を護るために室内の湿度を50〜60%に保つ[136]、などが有効である。また室内換気の励行[136]、人の多い場所に行かない[136]、咳や発熱などの症状のある人に近づかない[136]なども重要である。3密といわれる密閉・密集・密接を避けることが推奨される。
マスクの着用については、組織によって見解が異なり、「マスクをしないと感染者が咳をする時に自分の口をつい手で覆ってしまい、その手で様々な物に触れることが感染の原因となる」、「マスクをすることで他者への感染を減らす」という意味で感染予防となる[136]。
研究事例
- 川崎病発症との関連
- 二次被害
- 家庭内暴力・子ども虐待、子どもの貧困問題、性的虐待、ストレスによる過食・肥満などの女性の心身への2次被害、健康被害が増加することが予想される[152]。
- 栄養学
- 感染予防能は肥満者と十分な栄養を摂っている人で高いことが判っている[153]。
- 視点
- ウイルスに意図や道徳的視野を与えることは妥当ではない[154]。
- ソーシャルメディアの感情分析
- 新型コロナウイルスが日本に上陸し、北海道で緊急事態宣言がなされて以降、ツイートを行ったユーザの偏りがほぼ無くなり、新型コロナウイルスが一般的な話題になった[155]。
- 交通事故対策との関係
- 新型ウイルスの感染拡大防止対策と交通安全対策は、ことの性質はまったく異なるが、考慮すべき要素は似ている[156]。
- 漢方薬を使用した例
- COVID-19のセルフメディケーションとして、漢方薬にビタミンとハトムギを併用摂取した例がある[157]。
- 仮想空間の活用
- 持続可能な価値提供を行う上で仮想空間の活用は避けて通ることはできない[158]。
脚注
注釈
- ^ 和名には表記ゆれがあり定まっていない。表記の例は#名称を参照。
- ^ 後述のとおりICTVによって「SARS-CoV-2」と正式命名されているが、混乱を避けるため、それ以前に公開されたWHOの資料は「2019-nCoV」のまま変更しないとしている。また、“SARS”という呼称はアジアなどで2003年に流行した重症急性呼吸器症候群をイメージさせるため、WHOでは便宜的に「COVID-19の原因となるウイルス」または「COVID-19ウイルス（COVID-19 virus）」という呼称も使用している[1]。
- ^ "L type, which might be more aggressive and spread more quickly." doi:10.1093/nsr/nwaa036 の"ABSTRACT"より。
- ^ WHOは同年1月23日の緊急委員会でPHEICに該当するかどうかの判断を先送りしていた[117]。
状況推移（エピデミック記事「新型コロナウイルス感染症の流行 (2019年-)」も参照）- 2019年12月31日、カナダの健康モニタリングプラットフォーム「BlueDot」がアウトブレイクの可能性を警告[118]。
- 2020年1月6日、アメリカの疾病予防管理センター (CDC) が下記同様の情報を発表。
- 1月9日、WHOが中国でインフルエンザに似た症状が相次いで発生していることを公表。
- 1月20日、中国・国家衛生健康委員長の鍾南山が人から人への感染（ヒト - ヒト感染）の確認を報告。
- 1月23日、WHOが新型肺炎の感染は中国では緊急事態だとしながらも「国際的な公衆衛生上の緊急事態 (PHEIC) と判断するには時期尚早」と判断した。
- 1月31日、WHOが新型肺炎について中国国外にも感染拡大の懸念が出てきていることから、一転して「国際的な公衆衛生上の緊急事態」(PHEIC) を宣言。
- ^ SARS、MERSほか
- ^ ゴーグルまたはフェイスシールド
- ^ WHOでは、「物の表面で数時間生き残る事が示唆されている。単純な消毒剤で失活させることができる[145]。」としている。
- ^ ドイツの研究グループでは、「表面についたウイルスを消毒しないままでいると、平均4〜5日間生存する可能性がある[146]」としている。
- ^ 中国では、紙幣を14日間密閉し長期間の生存を視野に入れて消毒対策をしている[147]（住宅街にも消毒剤を散布[148]）。
出典
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関連項目
- 新型コロナウイルス感染症 (COVID-19)
- 新型コロナウイルス感染症の世界的流行
- 武漢華南海鮮卸売市場 - 発生源とされる市場。
- 同じコロナウイルス科のウイルスによって引き起こされる重疾患
- 重症急性呼吸器症候群 (SARS)
- 中東呼吸器症候群 (MERS)
- 国立国際医療研究センター
- パンデミック
- 2020年の株価大暴落（コロナ・ショック）
- 社会的スティグマ#社会的スティグマの事例
外部リンク
ウィキメディア・コモンズには、SARSコロナウイルス2に関するカテゴリがあります。- 新型コロナウイルス感染症対策 - 内閣官房
- 新型コロナウイルス感染症について - 厚生労働省
- Coronavirus disease 2019（英語） - 世界保健機関 (WHO)
- Coronavirus (COVID-19)（英語） - 国立衛生研究所（NIH）
- Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)（英語） - アメリカ疾病予防管理センター (CDC)
- Modeling 2019-nCoV（英語） - ジョンズ・ホプキンス大学エンジニアリングホワイティング校（Johns Hopkins University Whiting School of Engineering）公衆衛生学
- 新型コロナウイルス感染症（COVID-19）WHO公式情報特設ページ - WHO神戸センター
- 新型コロナウイルス感染症（COVID-19）関連情報について - 国立感染症研究所
- コロナウイルスに関する解説及び中国湖北省武漢市等で報告されている新型コロナウイルスに関連する情報 - 国立感染症研究所感染症疫学センター
- 新型コロナウイルス感染症 - 日本医師会
- 新型コロナウイルス感染症 - 日本感染症学会
- 新型コロナウイルス感染症（COVID-19）への対応について - 日本環境感染学会
- 新型コロナウイルス関連情報特設サイト - 日本疫学会
- 新型コロナウイルス関連情報特設サイト - 日本公衆衛生学会
- 特設サイト 新型コロナウイルス - NHK NEWS WEB
- 山中伸弥による新型コロナウイルス情報発信
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