- ミッドウェー海戦に参加した兵力
第一航空艦隊（第一機動部隊） 司令長官：南雲忠一中将
- 第一航空戦隊 司令官：南雲忠一中将
- 航空母艦：赤城（零戦21 九九艦爆21 九七艦攻21）、加賀（零戦21 九九艦爆21 九七艦攻30）
- 第二航空戦隊 司令官：山口多聞少将
- 航空母艦：飛龍（零戦21 九九艦爆21 九七艦攻21）、蒼龍（零戦21 九九艦爆21 九七艦攻21）
- 第八戦隊 司令官：阿部弘毅少将
- 第三戦隊第二小隊
- 第十戦隊 司令官：木村進少将 軽巡洋艦：長良
- ミッドウェー作戦全体の兵力
連合艦隊（主力部隊） 司令長官：山本五十六大将
- 第一戦隊 連合艦隊司令長官直率
- 第三水雷戦隊 司令官：橋本信太郎少将
- 第一一駆逐隊
- 第一九駆逐隊
- 空母隊 司令：梅谷薫大佐
- 特務隊 司令：原田覚大佐
第一艦隊（主力部隊） 司令長官：高須四郎中将
- 第二戦隊
- 第九戦隊 司令官：岸福治少将
- 第二四駆逐隊
- 第二七駆逐隊
- 第二〇駆逐隊
第二艦隊（攻略部隊） 司令長官：近藤信竹中将
- 第四戦隊第一小隊 司令官：近藤信竹中将
- 第五戦隊 司令官：高木武雄中将
- 第三戦隊第一小隊 司令官：三川軍一中将
- 第四水雷戦隊 司令官：西村祥治少将
- 第二駆逐隊
- 第九駆逐隊 司令：佐藤康夫大佐
- 第七戦隊（支援隊） 司令官：栗田健男中将
- 第八駆逐隊
- 第二水雷戦隊（護衛隊） 司令官：田中頼三少将
- 第一五駆逐隊
- 第一六駆逐隊 司令：渋谷紫郎大佐
- 第一八駆逐隊
- 第一一航空戦隊 司令官：藤田類太郎少将
- ミッドウェー諸島占領隊
- 輸送船18隻
- 第二連合特別陸戦隊 司令官：大田実（海軍）大佐
- 横五特（横須賀第五特別陸戦隊）、呉五特、第一一設営隊、第一二設営隊、第四測量隊
- 陸軍一木支隊 支隊長：一木清直（陸軍）大佐
第一航空艦隊（第一機動部隊） 司令長官：南雲忠一中将
- 第一航空戦隊 司令官：南雲忠一中将
- 第二航空戦隊 司令官：山口多聞少将
- 航空母艦：飛龍（零戦 21機、九九艦爆 21機、九七艦攻 21機）、蒼龍（零戦 21機、九九艦爆 21機、九七艦攻 21機）
- 第八戦隊 司令官：阿部弘毅少将
- 第三戦隊第二小隊
- 第十戦隊 司令官：木村進少将
- 第四駆逐隊 司令：有賀幸作大佐
- 第十駆逐隊 司令：阿部俊雄大佐
- 第十七駆逐隊
第六艦隊（先遣部隊） 司令長官：小松輝久中将
- 本隊
- 第八潜水戦隊（先遣支隊）
- 第三潜水戦隊
- 第五潜水戦隊
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第17任務部隊司令官 フランク・J・フレッチャー少将
- 第2群 司令官：ウィリアム・W・スミス少将
- 第4群 司令官：ギルバート・C・フーバー大佐
- 駆逐艦 ハンマン - アンダーソン - グウィン - ヒューズ - モリス - ラッセル
- 第5群 司令官：エリオット・バックマスター大佐（兼「ヨークタウン」艦長）
※ヨークタウンの第5飛行隊は珊瑚海海戦で喪失、サラトガの第3飛行隊を搭載
第16任務部隊 司令官 レイモンド・A・スプルーアンス少将
- 第2群 司令官：トーマス・C・キンケイド少将
- 第4群 司令官：アレキサンダー・R・アーリー大佐
- 第1水雷戦隊
- 駆逐艦 フェルプス - ウォーデン - モナガン - エイルウィン
- 第6水雷戦隊
- 駆逐艦 バルク - コニンハム - ベンハム - エレット - マウリー
- 第5群 司令官：ジョージ・D・マーレ大佐（兼「エンタープライズ」艦長）
- 航空母艦 エンタープライズ
- 第6戦闘機隊（F4F 27機）、第6爆撃機隊（SBD 19機）、第6索敵爆撃機隊（SBD 19機）、第6雷撃機隊（TBD 14機）
- 航空母艦 ホーネット
- 第8戦闘機隊（F4F 27機）、第8爆撃機隊（SBD 19機）、第8索敵爆撃機隊（SBD 19機）、第8雷撃機隊（TBD 15機）
潜水艦部隊 司令官：ロバート・H・イングリッシュ少将
ミッドウェー島守備隊
- ミッドウェー基地海軍航空部隊 司令：シリル・T・シマード大佐
- 第22海兵航空群 司令：イラ・L・キムス海兵中佐
- 第7陸軍航空軍分遣隊 司令：ウイリス・P・ヘール陸軍少将
- 地上部隊 司令：シマード大佐（兼任）
- 第2急襲大隊
- 第6海兵大隊 司令：ハロルド・D・シャノン海兵大佐
- 第1魚雷艇戦隊
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