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天然物は、抗菌療法の現代的な技術開発のための新しい化学構造の有用な源となる可能性がある<ref name="pmid16881035">{{cite journal|date=August 2006|title=Antibacterial natural products in medicinal chemistry--exodus or revival?|journal=Angewandte Chemie|volume=45|issue=31|pages=5072–129|doi=10.1002/anie.200600350|pmid=16881035|vauthors=von Nussbaum F, Brands M, Hinzen B, Weigand S, Häbich D|quote=The handling of natural products is cumbersome, requiring nonstandardized workflows and extended timelines. Revisiting natural products with modern chemistry and target-finding tools from biology (reversed genomics) is one option for their revival.}}</ref>。
天然物は、抗菌療法の現代的な技術開発のための新しい化学構造の有用な源となる可能性がある<ref name="pmid16881035">{{cite journal|date=August 2006|title=Antibacterial natural products in medicinal chemistry--exodus or revival?|journal=Angewandte Chemie|volume=45|issue=31|pages=5072–129|doi=10.1002/anie.200600350|pmid=16881035|vauthors=von Nussbaum F, Brands M, Hinzen B, Weigand S, Häbich D|quote=The handling of natural products is cumbersome, requiring nonstandardized workflows and extended timelines. Revisiting natural products with modern chemistry and target-finding tools from biology (reversed genomics) is one option for their revival.}}</ref>。

=== 植物由来 ===
　　詳細は「[[薬用植物]]」を参照

植物が産生する多くの[[二次代謝産物]]は、治療薬としての潜在的な薬効成分を持っている。これらの二次代謝産物は、タンパク質 (受容体、酵素など) に結合し、その機能を修飾する。そのため、植物由来の[[天然物化学|天然物]]は、創薬の出発点としてしばしば利用されてきた<ref>{{cite journal|date=July 2009|title=Drug discovery and natural products: end of an era or an endless frontier?|journal=Science|volume=325|issue=5937|pages=161–5|doi=10.1126/science.1168243|pmid=19589993|vauthors=Li JW, Vederas JC|s2cid=207777087|quote=With the current framework of HTS in major pharmaceutical industries and increasing government restrictions on drug approvals, it is possible that the number of new natural product–derived drugs could go to zero. However, this is likely to be temporary, as the potential for new discoveries in the longer term is enormous.}}</ref><ref>{{cite journal|year=2015|title=The re-emergence of natural products for drug discovery in the genomics era|url=https://strathprints.strath.ac.uk/51792/1/Harvey_etal_NRDD_2015_The_re_emergence_of_natural_products_for_drug_discovery.pdf|journal=Nature Reviews. Drug Discovery|volume=14|issue=2|pages=111–29|doi=10.1038/nrd4510|pmid=25614221|vauthors=Harvey AL, Edrada-Ebel R, Quinn RJ|hdl=10072/141449|quote=Here, we review strategies for natural product screening that harness the recent technical advances that have reduced [technical barriers to screening natural products in high-throughput assays]. The growing appreciation of functional assays and phenotypic screens may further contribute to a revival of interest in natural products for drug discovery.}}</ref><ref>{{cite journal|year=2016|title=Natural Products as Sources of New Drugs from 1981 to 2014|journal=Journal of Natural Products|volume=79|issue=3|pages=629–61|doi=10.1021/acs.jnatprod.5b01055|pmid=26852623|vauthors=Newman DJ, Cragg GM|quote=... the utilization of natural products and/or their novel structures, in order to discover and develop the final drug entity, is still alive and well. For example, in the area of cancer, over the time frame from around the 1940s to the end of 2014, of the 175 small molecules approved, 131, or 75%, are other than "S" (synthetic), with 85, or 49%, actually being either natural products or directly derived therefrom.|doi-access=free}}</ref><ref>{{cite journal|year=2017|title=The Pharmaceutical Industry in 2016. An Analysis of FDA Drug Approvals from a Perspective of the Molecule Type|journal=Molecules (Basel, Switzerland)|volume=22|issue=3|pages=368|doi=10.3390/molecules22030368|pmid=28264468|pmc=6155368|vauthors=Torre BG, Albericio F|quote=The outputs from 2016 indicate the so-called small molecules are losing ground against biologics, biomolecules, and other molecules inspired [by] natural products}}</ref>。

==== 歴史 ====
　　詳細は「[[薬学史]]」を参照

[[ルネサンス期]]までは、[[西洋医学]]における薬物の大部分は[[植物]]由来の抽出物であった<ref name=":5">{{cite book|title=The Great Naturalists|last=Sutton|first=David|name-list-format=vanc|publisher=[[Thames & Hudson]], with the [[Natural History Museum (London)|Natural History Museum]]|year=2007|isbn=978-0-500-25139-3|editor-last=Huxley|editor-first=Robert|location=London|pages=32–37|chapter=Pedanios Dioscorides: Recording the Medicinal Uses of Plants}}</ref>。その結果、創薬のための出発物質の重要な供給源としての植物種の可能性についての情報が蓄積されてきた<ref name="ahn2">{{cite journal|date=March 2017|title=The worldwide trend of using botanical drugs and strategies for developing global drugs|journal=BMB Reports|volume=50|issue=3|pages=111–116|doi=10.5483/BMBRep.2017.50.3.221|pmid=27998396|pmc=5422022|vauthors=Ahn K}}</ref>。

植物のさまざまな解剖学的部分 (例えば、根、葉、花) で産生されるさまざまな[[代謝物質|代謝産物]]および[[ホルモン]]に関する植物学的知識は、生理活性および薬理学的な植物特性を正しく識別するために極めて重要である<ref name="ahn2" /><ref name=":4">{{cite journal|date=September 2015|title=Modes of Action of Herbal Medicines and Plant Secondary Metabolites|journal=Medicines|volume=2|issue=3|pages=251–286|doi=10.3390/medicines2030251|pmid=28930211|pmc=5456217|vauthors=Wink M}}</ref>。新薬を特定し、市場での承認を得ることは、国の薬事規制当局{{Enlink|Regulatory agency|英語版}}によって設定された規制により、厳しいプロセスであることが証明されている<ref name=":10">{{cite journal|date=January 2018|title=New scale-down methodology from commercial to lab scale to optimize plant-derived soft gel capsule formulations on a commercial scale|journal=International Journal of Pharmaceutics|volume=535|issue=1–2|pages=371–378|doi=10.1016/j.ijpharm.2017.11.029|pmid=29154803|vauthors=Oishi S, Kimura SI, Noguchi S, Kondo M, Kondo Y, Shimokawa Y, Iwao Y, Itai S}}</ref>。

==== ジャスモン酸 ====
[[ファイル:Methyl_jasmonate.svg|リンク=https://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%95%E3%82%A1%E3%82%A4%E3%83%AB:Methyl_jasmonate.svg|サムネイル|ジャスモン酸メチル (JA) の化学構造]]
[[ジャスモン酸]]は、傷害や細胞内シグナルへの応答に重要な役割を果たしている。それらは[[プロテアーゼ阻害剤 (生物学)|プロテアーゼ阻害剤]]<ref name=":0">{{cite journal|date=April 2002|title=Plant stress hormones suppress the proliferation and induce apoptosis in human cancer cells|journal=Leukemia|volume=16|issue=4|pages=608–16|language=En|doi=10.1038/sj.leu.2402419|pmid=11960340|vauthors=Fingrut O, Flescher E|doi-access=free}}</ref>を介してアポトーシス<ref name=":0" /><ref name=":3">{{cite journal|date=2015-07-24|title=Methyl jasmonate and its potential in cancer therapy|journal=Plant Signaling & Behavior|volume=10|issue=9|pages=e1062199|doi=10.1080/15592324.2015.1062199|pmid=26208889|pmc=4883903|vauthors=Zhang M, Zhang MW, Zhang L, Zhang L}}</ref>やタンパク質カスケードを誘導し、防御機能を持ち<ref name=":1">{{cite journal|date=2002|title=The jasmonate signal pathway|journal=The Plant Cell|volume=14 Suppl|issue=Suppl|pages=S153–64|doi=10.1105/tpc.000679|pmid=12045275|pmc=151253|vauthors=Turner JG, Ellis C, Devoto A}}</ref>、さまざまな生物学的・環境的ストレス{{Enlink|Plant stress measurement|英語版}}に対する植物の応答を調節する<ref name=":1" /><ref>{{cite journal|date=2016|title=Jasmonates: Multifunctional Roles in Stress Tolerance|journal=Frontiers in Plant Science|volume=7|pages=813|language=English|doi=10.3389/fpls.2016.00813|pmid=27379115|pmc=4908892|vauthors=Ahmad P, Rasool S, Gul A, Sheikh SA, Akram NA, Ashraf M, Kazi AM, Gucel S}}</ref>。ジャスモン酸はまた、[[代謝物質|代謝産物]]の放出を介して膜脱分極を誘導し、[[ミトコンドリア]]膜に直接作用する能力を持っている<ref name="pmid15753398">{{cite journal|date=March 2005|title=Jasmonates: novel anticancer agents acting directly and selectively on human cancer cell mitochondria|journal=Cancer Research|volume=65|issue=5|pages=1984–93|doi=10.1158/0008-5472.CAN-04-3091|pmid=15753398|vauthors=Rotem R, Heyfets A, Fingrut O, Blickstein D, Shaklai M, Flescher E|doi-access=free}}</ref>。

ジャスモン酸誘導体 (JAD) は、植物細胞の創傷反応や組織[[再生 (生物学)|再生]]にも重要な役割を果たしている。また、ヒトの[[表皮]]層にも[[抗老化医学|アンチエイジング]]効果があることが確認されている<ref name=":11">{{cite journal|date=May 2012|title=The anti-ageing potential of a new jasmonic acid derivative (LR2412): in vitro evaluation using reconstructed epidermis Episkin™|journal=Experimental Dermatology|volume=21|issue=5|pages=398–400|doi=10.1111/j.1600-0625.2012.01480.x|pmid=22509841|vauthors=Michelet JF, Olive C, Rieux E, Fagot D, Simonetti L, Galey JB, Dalko-Csiba M, Bernard BA, Pereira R}}</ref>。それは、[[細胞外マトリックス]] (ECM) の必須成分である[[プロテオグリカン]] (PG) や[[グリコサミノグリカン]] (GAG) [[多糖|多糖類]]と相互作用し、ECMの再構築を助けるものと思われている<ref>{{cite journal|date=September 2017|title=A jasmonic acid derivative improves skin healing and induces changes in proteoglycan expression and glycosaminoglycan structure|url=|journal=Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects|volume=1861|issue=9|pages=2250–2260|doi=10.1016/j.bbagen.2017.06.006|pmid=28602514|vauthors=Henriet E, Jäger S, Tran C, Bastien P, Michelet JF, Minondo AM, Formanek F, Dalko-Csiba M, Lortat-Jacob H, Breton L, Vivès RR}}</ref>。皮膚の修復に関する JADの発見は、これらの植物ホルモンの治療薬としての応用における効果に新たな関心をもたらした<ref name=":11" />。

==== サリチル酸塩 ====
[[ファイル:Aspirin.png|リンク=https://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%95%E3%82%A1%E3%82%A4%E3%83%AB:Aspirin.png|サムネイル|250x250ピクセル|アセチルサリチル酸の化学構造。一般的にアスピリンとして知られている。]]
[[植物ホルモン]]である[[サリチル酸]] (SA) は、最初は柳の樹皮に由来し、それ以来、多くの種で同定されてきた。その役割は科学者によってまだ完全には解明されていないが、植物免疫{{Enlink|Plant disease resistance|英語版}}の重要なプレーヤーを担っている<ref name=":8">{{cite journal|date=2016-05-26|title=Multiple Targets of Salicylic Acid and Its Derivatives in Plants and Animals|journal=Frontiers in Immunology|volume=7|pages=206|doi=10.3389/fimmu.2016.00206|pmid=27303403|pmc=4880560|vauthors=Klessig DF, Tian M, Choi HW}}</ref>。また植物や動物の組織における病気や免疫応答に関与しており、複数の動物組織に影響を与えることが示されているサリチル酸結合タンパク質 (SABP) を持っている<ref name=":8" />。単離された化合物の最初に発見された薬効は、痛みや熱の管理に関与していた。それらはまた、細胞増殖の抑制にも積極的な役割を果たしている<ref name=":0" />。[[リンパ芽球]]性[[白血病]]や他のヒトの癌細胞において死を誘導する能力を持っている<ref name=":0" />。サリチル酸塩に由来するの最も一般的な薬物の一つは、アセチルサリチル酸としても知られる[[アスピリン]]で、抗炎症作用や[[解熱薬|解熱作用]]を有している<ref name=":8" /><ref name=":9">{{cite book|vauthors=Pierpoint WS|chapter=Salicylic Acid and its Derivatives in Plants: Medicines, Metabolites and Messenger Molecules|veditors=Kuntz M|title=Advances in Botanical Research|volume=20|date=1994|pages=163–235|doi=10.1016/S0065-2296(08)60217-7|isbn=978-0-12-809447-1}}</ref>。

=== 微生物の代謝物 ===
微生物は、生活空間や養分をめぐって互いに競争している。これらの条件で生き残るために、多くの微生物は競合する種の増殖を防ぐ能力を発達させてきた。微生物は抗菌薬の主な供給源である。ストレプトマイセス分離株{{Enlink|Streptomyces isolates|英語版}}は、貴重な抗生物質の供給源であり、薬用カビと呼ばれている。他の微生物に対する防御機構として発見された抗生物質の古典的な例は、1928年に[[Penicillium|ペニシリウム]]真菌に汚染された細菌培養物中の[[ペニシリン]]である{{citation needed|date=March 2017}}。

=== 海洋無脊椎動物 ===
　　詳細は [[:en:Sponge isolates|Sponge isolates]] を参照

海洋環境は、新たな生理活性物質の源となる可能性を秘めている<ref name="pmid15039835">{{cite journal|date=February 2004|title=Investigations of the marine flora and fauna of the Islands of Palau|url=https://zenodo.org/record/1229990|journal=Natural Product Reports|volume=21|issue=1|pages=50–76|doi=10.1039/b300664f|pmid=15039835|vauthors=Faulkner DJ, Newman DJ, Cragg GM}}</ref>。1950年代に海洋無脊椎動物から発見された[[アラビノース]][[ヌクレオシド]]は、リボースとデオキシリボース以外の糖鎖から生理活性ヌクレオシド構造が得られることを初めて実証した。海洋由来の最初の医薬品が承認されたとき、2004年までかかった{{citation needed|date=March 2017}}{{dubious|date=March 2017}}。例えば、プリアルトとしても知られているイモガイの毒素{{仮リンク|ジコノチド|en|Ziconotide|label=}}は、重度の神経障害性疼痛を治療する。他にもいくつかの海洋由来の薬剤が、がん、抗炎症剤の使用、疼痛などの適応症を対象に臨床試験を行っている。これらの薬剤の一つに[[ブリオスタチン]]様化合物があり、抗がん剤として研究が進められている{{citation needed|date=March 2017}}。

=== 化学的多様性 ===
上記のように、コンビナトリアル・ケミストリーは、ハイスループットスクリーニングのニーズに対応した大規模なスクリーニングライブラリーを効率的に生成することを可能にする重要な技術であった。しかし、現在、コンビナトリアル・ケミストリーの20年の歴史を経て、化学合成が効率化したにもかかわらず、リードや薬物候補の増加には至っていないことが指摘されている<ref name="pmid173093022">{{cite journal|date=March 2007|title=Natural products as sources of new drugs over the last 25 years|journal=Journal of Natural Products|volume=70|issue=3|pages=461–77|doi=10.1021/np068054v|pmid=17309302|vauthors=Newman DJ, Cragg GM}}</ref>。そのため、コンビナトリアル・ケミストリー製品の化学的特性を、既存の医薬品や天然物と比較して分析することが求められている。それらの物理化学的特性に基づいて[[化学空間]]における化合物の分布として描かれる[[ケモインフォマティクス]]の概念「化学的多様性」(chemical diversity) は、コンビナトリアル・ケミストリー・ライブラリー化合物と天然物との違いを説明するためにしばしば用いられている。合成コンビナトリアル・ライブラリーの化合物は、限られた非常に均一な化学空間しかカバーしていないように見えるが、既存の薬物、特に天然物は化学的多様性が大きく、化学空間により均等に分布している<ref name="pmid125465562">{{cite journal|year=2003|title=Property distributions: differences between drugs, natural products, and molecules from combinatorial chemistry|journal=Journal of Chemical Information and Computer Sciences|volume=43|issue=1|pages=218–27|doi=10.1021/ci0200467|pmid=12546556|vauthors=Feher M, Schmidt JM}}</ref>。天然物とコンビナトリアル・ケミストリー・ライブラリーの化合物の間の最も顕著な違いは、キラル中心の数 (天然化合物の方がはるかに多い)、構造剛性 (天然化合物の方が高い)、および芳香族部位の数 (コンビナトリアル・ケミストリー・ライブラリーの方が高い) である。これら2つのグループ間の他の化学的な違いは、ヘテロ原子の性質 (天然物ではOとNに富み、合成化合物ではSとハロゲン原子が多く存在する)、非芳香族性不飽和度 (天然物では高い) などである。構造の剛性と[[キラリティー]]の両方が、化合物の特異性と薬剤としての有効性を高めることが知られている[[医薬品化学]]において確立された要因であることから、天然物は潜在的なリード分子として、今日のコンビナトリアル・ケミストリー・ライブラリーに匹敵することが示唆されている。


== 新薬申請 ==
== 新薬申請 ==

2020年8月23日 (日) 10:41時点における版

創薬サイクルの概略図

創薬（そうやく、drug discovery）[1]とは医学、生物工学および薬学において薬剤を発見したり設計したりするプロセスのことである[2]。

歴史的に、大半の薬剤は、伝統治療薬（生薬）の有効性成分が同定されたり、ペニシリンのように偶然によって発見されたものであった。今日における創薬アプローチは、疾病や感作が分子生物学や生理学の見地で解明された制御機序や、その見地において見出された創薬対象の特性を理解することで薬剤を発見する手法である。

さらに最近は、古典的薬理学で治療効果があった物質を同定するために、合成低分子、天然物、または抽出物の化学ライブラリーを無傷細胞または全生物でスクリーニング(選別)している。ヒトゲノムの配列決定により、大量の精製タンパク質の迅速なクローニングと合成が可能になったので、逆薬理学として知られているプロセスで、病気を引き起こすと仮定された生物学的標的に対する大規模化合物ライブラリのハイスループットスクリーニングも一般的になってきた。これらのスクリーニングから得られたヒット(薬物候補)は、細胞内でテストされ、その後、動物で効能が評価される[3]。

現代の創薬のプロセスは、スクリーニングヒット化合物の同定、合成、およびそれらのヒット化合物の最適化により、親和性、選択性（英語版） (副作用の可能性を低減する)、有効性/効力 (英語版) 、代謝安定性 (半減期を長くする)、および経口バイオアベイラビリティーを高めるための最適化などを行う。これらの試験で有用な化合物を見出すと、前臨床試験の医薬品開発プロセスが行われる[4]。

このように、現代の創薬は通常、資本集約的なプロセスであり、製薬企業や政府 (助成金や融資保証) による多額の投資を伴う。技術の進歩や生物システムの解明が進んでいるのにもかかわらず、創薬は長期間を要す上に新薬発見の成功率は低い[5]。2010年には、1つの新規化合物の研究開発費は約18億米ドルであった[6]。21世紀に入り、基礎的な創薬研究は主に政府や慈善団体が資金を提供し、後期開発は主に製薬会社やベンチャーキャピタルが資金を提供するようになっている[7]。医薬品が市場に出回るためには、いくつかの臨床試験段階を経て、新薬申請と呼ばれる承認プロセスを経る必要がある。

商業的あるいは公衆衛生上の成功をもたらす医薬品を発見するには、投資家、産業界、学術界、特許法、規制上の独占権、マーケティング、そして秘密とコミュニケーションのバランスをとる必要性など、複雑な相互作用が必要となる[8]。一方、希少性が高いために商業的成功や公衆衛生上の効果が期待できない疾患については、希少疾病用医薬品の資金提供プロセスにより、患者が薬物治療の進歩に希望を持つことができるようになる。

歴史

→詳細は「薬学史」を参照

人体における薬物の効果は、薬物分子と生体高分子 (多くの場合、タンパク質や核酸) との特異的な相互作用によって媒介されるという考えから、科学者は、個々の化学物質が薬物の生物学的活性には必要であるという結論に達した。これが薬理学の近代時代の始まりであり、薬用植物の粗抽出物ではなく、純粋な化学物質が標準的な医薬品となった。粗製製剤(生薬)から単離された化合物の例としては、アヘンの活性剤であるモルヒネや、ジギタリス(Digitalis lanata)由来の心臓刺激剤であるジゴキシンがある。有機化学はまた、生物源から単離された多くの天然産物の合成をもたらした。

歴史的には、ある物質が粗抽出物であっても精製された化学物質であっても、生物学的標的が不明のままで生物学的活性のスクリーニングが行われてきた。活性物質が特定されて初めて標的を特定する努力がなされた。このアプローチは古典的薬理学、フォワード薬理学[9]、または表現型創薬として知られている[10]。

その後、既知の生理学的/病理学的経路を特異的に標的とする低分子が合成され、保存された化合物バンクの大量スクリーニングを回避した。これにより、プリン代謝に関するGertrude ElionとGeorge H. H. Hitchingsの研究[11][12]、β遮断薬とシメチジンに関するJames Blackの研究[13]、遠藤章によるスタチンの発見など[14]、大きな成功がもたらさせた。既知の活性物質の化学的類似体を開発するアプローチのもう一人の成功者は、Allen and Hanbury's (後のGlaxo)のDavid Jack卿 (英語版) で、彼は喘息用の最初の吸入選択的β2アドレナリン作動薬、喘息用の最初の吸入ステロイド、シメチジンの後継としてのラニチジンを開拓し、トリプタンの開発を支援した[15]。

Gertrude Elionは、主に50人未満のグループでプリン類似体の研究に取り組み、最初の抗ウイルス剤、ヒト臓器移植を可能にした最初の免疫抑制剤 (アザチオプリン)、小児白血病の寛解を誘導した最初の医薬品、重要な抗がん剤、抗マラリア剤、抗菌剤、痛風の治療薬の発見に貢献した。

ヒトタンパク質のクローニングにより、特定の疾患に関連すると考えられる特定の標的に対する化合物の大規模なライブラリーのスクリーニングが可能になった。このアプローチは逆薬理学として知られており、今日では最も頻繁に使用されているアプローチである[16]。

創薬標的: 新規および既存

一般に「標的」とは、開発中の薬物が作用することを意図した、病理学的に関心のある天然の細胞や分子構造を指す[7]。「標的」の定義づけ自体は製薬企業内で行われた議論によって形成される[7]。しかしながら、 新規と既存との標的の区分は標的がどのようなものであるかを完全に把握しなくても判別されている。このようにして判別された区分は典型的には製薬企業が創薬や開発に従事している低分子治療薬の区分になっている。2011年からの推計では、435点のヒトゲノム製品がFDA承認薬の治療薬標的として同定された[17]。

「既存標的」は健常な状態の生理学的な標的機能も、ヒトの病理学的な標的機能も科学的な理解が良くなされており、長期にわたる発表履歴に裏打ちされている[3]。既存であるということは、薬剤の作用機序が標的の完全に把握された詳細を通じて作用が考察されることをほのめかすわけではない[3]。むしろ、「既存である」ということは直接的にはそれぞれの機能に関する情報について標的を取り巻く情報の量の多い少ないに関連している。

多くのこの種の情報は利用可能であるが、それに対して（通常は）各標的に対して臨床的な開発を施すための資金には限りがある。この種の機能情報を集約するプロセスは、製薬業界用語で「ターゲットバリデーション」（target validation）と呼ばれる。製薬企業が内部的に所有しているものも含めて、既存の標的は過去に医薬品開発の活動の積み重ねに経験付けられている。たとえばこのような経験の積み重ねは標的に対して低分子治療薬の化学的開発実現性に関する情報を提供する。そして他社へのライセンス供与の機会を提供し、低分子治療薬候補を考慮する際にその経験が選択の幅を提供する。

一般には、「新規標的」は創薬活動の主題としてなった標的のうち「既存標的」以外のものすべてである。典型的には新規標的は、新規に発見された蛋白質であったり、基礎研究により新たに機能が判明した蛋白質などが含まれる。創薬において今日選択される主な標的は蛋白質である。それらの蛋白質クラスの2つの主流は次のものである:Gタンパク質共役受容体（GPCR）とプロテインキナーゼである[18]。

スクリーニングとデザイン

個々の疾病毎に選択された標的に対する新薬発見のプロセスはハイスループットスクリーニング（High-throughput screening; HTS）により進展するが、それは膨大な化学物質ライブラリーに対して試験を実施し、その過程で標的に変更を促す働きも有している。例えば、標的が新規GPCRであれば試験化合物は受容体を阻害あるいは刺激する性質[19]でスクリーニングされる。プロテインキナーゼの場合、化合物はキナーゼの酵素阻害作用で試験される。

HTSのもう一つの重要な機能に選択された標的に対して選択性を示すかどうかを見るという点がある。理想的には発見された化合物は選択された標的ただ一つに影響し関連した他の標的には影響しないというものである。最終的にはスクリーニングの実施により、選択された標的対するヒット化合物は関連する他の標的に対する影響を試験される。このプロセスをクロススクリーニング（Cross-screening）と呼ぶ。クロススクリーニングは重要である。なぜならば関連性のない多くの標的に対してヒットする化合物は的外れの毒性を臨床段階で化合物が示すことを引き起こすからである。

早期のスクリーニングで完璧な候補化合物が出現することはほとんど起こりそうもないことである。最初のステップの一つは、医薬品として開発される可能性が低い化合物をスクリーニングすることである。例えば、ほとんどすべてのアッセイ(試験)でヒットした化合物で、医薬化学者によって「pan-assay interference compounds」 (英語版) (PAINS)と分類されている化合物は、この段階で化学ライブラリから削除される[20][21][22]。たいていは、ある程度の薬理活性をもったいくつかの化合物が発見される。そしてそれらが共通の化学構造を持つ場合は、単一かあるいは複数のファーマコフォア（Pharmacophore）が見出されることがある。この時点で、医薬品化学者は構造活性相関（Structure-activity relationship; SAR）を試みて幾つかの性質を改善してリード化合物を仕立てるのである。その改善とは次のようなものである:

  • 選択された標的に対する活性を増大する。
  • 無関係の標的に対する活性の低減させる。
  • 分子特性のドラッグライクネス (薬に適した性質) やADME(薬物動態)の改良を行う。

このプロセスは幾つかの試行錯誤的なスクリーニングの実施が必要となることがある。その過程において、望ましくは、新しい分子の性質が改良され、In vitro試験や In vivo試験を実施する上で採用された病理モデルの活性の点で好ましい化合物になっていることである。

「リピンスキーのルールオブファイブ」で提案されているように、化合物または一連の化合物の品質を評価するために、さまざまな指標が使用される。そのような指標には、脂溶性、分子量、極性表面積を推定するためのcLogPのような計算された特性、および力価、酵素クリアランスの in vitro 測定のような計測された特性が含まれる。リガンド効率（英語版）[23] (LE) や脂溶性効率（英語版）[24][25] (LiPE) のような指標を組み合わせて、ドラッグライクネスを評価する。

概してHTSは、一般には新規な創薬の為の手法であるが、その目的だけに使用されるわけではない。HTSが幾つかの望ましい特性を持つ分子から出発することもある。その場合の分子は天然物（Natural product）から抽出されたり、改良された上市されている薬（「ゾロ新」、"me too" drugと呼ばれる）からであったりする。HTS以外の方法としてはバーチャルスクリーニング（Virtual screening）と呼ばれる手法があり、コンピューターが機械的に発生させた分子モデル（バーチャルライブラリー）を使い創薬標的にバーチャルライブラリーをドッキングスタディを施すことでスクリーニングとすることがしばしば行われる。

他の重要な手法は、標的の生物学的、物理的特性に関して研究し、一連の化合物が活性部位（Active site）に適合するか否かを予測する de novo 医薬品設計（Drug design）である。例えば、バーチャルスクリーニングやコンピュータ支援型の薬物設計は、標的タンパク質と相互作用する可能性のある新しい化学部位を特定するためにしばしば使用される[26][27]。分子モデリング[28]と分子動力学シミュレーションは、新薬リードの効力と特性を改善するためのガイドとなる[29][30][31]。

また、創薬コミュニティでは、高価で限られた化学空間しかカバーできないHTSから、より小さなライブラリ (最大数千化合物) へのスクリーニングへと移行するパラダイムシフトがある。これらのアプローチ例には、フラグメントベースリードディスカバリー（英語版） (FBDD) [32][33][34][35]やタンパク質指向の動的コンビナトリアルケミストリー（英語版）が含まれる[36][37][38][39][40]。これらのアプローチにおけるリガンドは通常はるかに小さく、HTSから同定されたヒット化合物よりも弱い結合親和性で標的タンパク質に結合する。有機合成によるリード化合物へのさらなる修飾が必要となることがよくある。このような修飾は、タンパク質-断片複合体のタンパク質X線結晶構造解析によってしばしば導かれる[41][42][43]。こうしたアプローチの利点は、より効率的なスクリーニングが可能なことで、化合物ライブラリーは小規模でも、HTSと比較して一般的には大きな化学空間を網羅できる。

表現型スクリーニングはまた、創薬における新たな化学的出発点を提供している[44][45]。 酵母、ゼブラフィッシュ、ワーム、不死化細胞株、初代細胞株、患者由来の細胞株、全動物モデルなど、さまざまなモデルが使用されている。これらのスクリーニングは、より包括的な細胞モデルまたは生物の例として、死、タンパク質凝集、変異タンパク質発現、または細胞増殖などの疾患表現型を逆転させる化合物を見つけるように設計されている。特にモデルが高価であったり、実行するのに時間がかかる場合は、こうしたスクリーニングにより小さなスクリーニングセットが使用されることが多い[46]。多くの場合、このようなスクリーニングから得られたヒットの正確な作用機序は不明であり、確認するためには広範なターゲットデコンボリューション実験を必要とすることがある。

能力や選択性やドラッグライクネス特性の面で十分標的を満足しうる一連のリード化合物が見つかると、一つないしは二つの化合物が医薬品開発の段階に供せられる。一連のなかでの最も適した化合物は一般には「リード化合物」と呼ばれる。そしてリード化合物以外の設計された化合物は「バックアップ(化合物)」になる。このような重要な決定は、一般的に計算モデリングの革新によって支えられている[47][48][49]。

薬物源としての自然

従来、多くの医薬品や生物活性を持つ化学物質は、生物が生存のために他の生物の活性に影響を与えるように作り出す化学物質を研究して発見してきた[50]。

コンビナトリアルケミストリーがリード発見プロセスに不可欠な要素として台頭してきているにもかかわらず、天然物が創薬の出発材料として大きな役割を果たしていることに変わりはない[51]。2007年の報告書によると[52]、1981年から2006年の間に開発された974の低分子新規化学物質のうち、63％が天然物由来または天然物の半合成誘導体 (英語版) であった。抗菌剤、抗悪性腫瘍剤、降圧剤、抗炎症剤などの特定の治療分野では、さらに大きな数値であった[要出典]。多くの場合、これらの製品は長年にわたり伝統的に使用されてきたものである[要出典]。

天然物は、抗菌療法の現代的な技術開発のための新しい化学構造の有用な源となる可能性がある[53]。

植物由来

　　詳細は「薬用植物」を参照

植物が産生する多くの二次代謝産物は、治療薬としての潜在的な薬効成分を持っている。これらの二次代謝産物は、タンパク質 (受容体、酵素など) に結合し、その機能を修飾する。そのため、植物由来の天然物は、創薬の出発点としてしばしば利用されてきた[54][55][56][57]。

歴史

　　詳細は「薬学史」を参照

ルネサンス期までは、西洋医学における薬物の大部分は植物由来の抽出物であった[58]。その結果、創薬のための出発物質の重要な供給源としての植物種の可能性についての情報が蓄積されてきた[59]。

植物のさまざまな解剖学的部分 (例えば、根、葉、花) で産生されるさまざまな代謝産物およびホルモンに関する植物学的知識は、生理活性および薬理学的な植物特性を正しく識別するために極めて重要である[59][60]。新薬を特定し、市場での承認を得ることは、国の薬事規制当局 (英語版) によって設定された規制により、厳しいプロセスであることが証明されている[61]。

ジャスモン酸

ジャスモン酸メチル (JA) の化学構造

ジャスモン酸は、傷害や細胞内シグナルへの応答に重要な役割を果たしている。それらはプロテアーゼ阻害剤[62]を介してアポトーシス[62][63]やタンパク質カスケードを誘導し、防御機能を持ち[64]、さまざまな生物学的・環境的ストレス (英語版) に対する植物の応答を調節する[64][65]。ジャスモン酸はまた、代謝産物の放出を介して膜脱分極を誘導し、ミトコンドリア膜に直接作用する能力を持っている[66]。

ジャスモン酸誘導体 (JAD) は、植物細胞の創傷反応や組織再生にも重要な役割を果たしている。また、ヒトの表皮層にもアンチエイジング効果があることが確認されている[67]。それは、細胞外マトリックス (ECM) の必須成分であるプロテオグリカン (PG) やグリコサミノグリカン (GAG) 多糖類と相互作用し、ECMの再構築を助けるものと思われている[68]。皮膚の修復に関する JADの発見は、これらの植物ホルモンの治療薬としての応用における効果に新たな関心をもたらした[67]。

サリチル酸塩

ファイル:Aspirin.png
アセチルサリチル酸の化学構造。一般的にアスピリンとして知られている。

植物ホルモンであるサリチル酸 (SA) は、最初は柳の樹皮に由来し、それ以来、多くの種で同定されてきた。その役割は科学者によってまだ完全には解明されていないが、植物免疫 (英語版) の重要なプレーヤーを担っている[69]。また植物や動物の組織における病気や免疫応答に関与しており、複数の動物組織に影響を与えることが示されているサリチル酸結合タンパク質 (SABP) を持っている[69]。単離された化合物の最初に発見された薬効は、痛みや熱の管理に関与していた。それらはまた、細胞増殖の抑制にも積極的な役割を果たしている[62]。リンパ芽球性白血病や他のヒトの癌細胞において死を誘導する能力を持っている[62]。サリチル酸塩に由来するの最も一般的な薬物の一つは、アセチルサリチル酸としても知られるアスピリンで、抗炎症作用や解熱作用を有している[69][70]。

微生物の代謝物

微生物は、生活空間や養分をめぐって互いに競争している。これらの条件で生き残るために、多くの微生物は競合する種の増殖を防ぐ能力を発達させてきた。微生物は抗菌薬の主な供給源である。ストレプトマイセス分離株 (英語版) は、貴重な抗生物質の供給源であり、薬用カビと呼ばれている。他の微生物に対する防御機構として発見された抗生物質の古典的な例は、1928年にペニシリウム真菌に汚染された細菌培養物中のペニシリンである[要出典]。

海洋無脊椎動物

　　詳細は Sponge isolates を参照

海洋環境は、新たな生理活性物質の源となる可能性を秘めている[71]。1950年代に海洋無脊椎動物から発見されたアラビノースヌクレオシドは、リボースとデオキシリボース以外の糖鎖から生理活性ヌクレオシド構造が得られることを初めて実証した。海洋由来の最初の医薬品が承認されたとき、2004年までかかった[要出典][疑問点 – ノート]。例えば、プリアルトとしても知られているイモガイの毒素ジコノチド（英語版）は、重度の神経障害性疼痛を治療する。他にもいくつかの海洋由来の薬剤が、がん、抗炎症剤の使用、疼痛などの適応症を対象に臨床試験を行っている。これらの薬剤の一つにブリオスタチン様化合物があり、抗がん剤として研究が進められている[要出典]。

化学的多様性

上記のように、コンビナトリアル・ケミストリーは、ハイスループットスクリーニングのニーズに対応した大規模なスクリーニングライブラリーを効率的に生成することを可能にする重要な技術であった。しかし、現在、コンビナトリアル・ケミストリーの20年の歴史を経て、化学合成が効率化したにもかかわらず、リードや薬物候補の増加には至っていないことが指摘されている[72]。そのため、コンビナトリアル・ケミストリー製品の化学的特性を、既存の医薬品や天然物と比較して分析することが求められている。それらの物理化学的特性に基づいて化学空間における化合物の分布として描かれるケモインフォマティクスの概念「化学的多様性」(chemical diversity) は、コンビナトリアル・ケミストリー・ライブラリー化合物と天然物との違いを説明するためにしばしば用いられている。合成コンビナトリアル・ライブラリーの化合物は、限られた非常に均一な化学空間しかカバーしていないように見えるが、既存の薬物、特に天然物は化学的多様性が大きく、化学空間により均等に分布している[73]。天然物とコンビナトリアル・ケミストリー・ライブラリーの化合物の間の最も顕著な違いは、キラル中心の数 (天然化合物の方がはるかに多い)、構造剛性 (天然化合物の方が高い)、および芳香族部位の数 (コンビナトリアル・ケミストリー・ライブラリーの方が高い) である。これら2つのグループ間の他の化学的な違いは、ヘテロ原子の性質 (天然物ではOとNに富み、合成化合物ではSとハロゲン原子が多く存在する)、非芳香族性不飽和度 (天然物では高い) などである。構造の剛性とキラリティーの両方が、化合物の特異性と薬剤としての有効性を高めることが知られている医薬品化学において確立された要因であることから、天然物は潜在的なリード分子として、今日のコンビナトリアル・ケミストリー・ライブラリーに匹敵することが示唆されている。

新薬申請

研究の歴史を通じて、米国での使用目的に対して安全で効果的であることを示すエビデンス(証拠)を持って開発された医薬品の場合、企業はその医薬品を商品化して臨床応用できるようにするために薬事規制当局 (厚生労働省、米国FDAなど)に対して新薬承認申請 (英語版) (NDA) を提出できる[74]。薬事規制当局は、薬物に関するすべての提出データを審査し、その安全性、効果の特異性、および用量の有効性に基づいて、その薬物候補を承認するかどうかを決定する[74]。

関連項目

脚注

[脚注の使い方]
  1. ^ 日本において「創薬」という造語ができたのは1964年(薬学白書、野口照久による、[1]）であるが、一般に使われ始めたのは1990年代からである。それ以前はプロセスを細分化することなく、臨床開発まで含めた一連のプロセスを医薬品開発と呼ぶのが通常であった。
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参考文献

外部リンク

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