放線菌

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放線菌
Bifidobacterium adolescentis Gram.jpg
Bifidobacterium adolescentis
分類
ドメ
イン
: 真正細菌 Bacteria
: 放線菌門 Actinobacteria
学名
Actinobacteria Stackebrandt et al. 1997
下位分類(綱)
  • アシディミクロビウム綱
  • コリオバクテリウム綱
  • ニトリリルプトル綱
  • ルブロバクター綱
  • サーモレオフィラム綱
  • アクチノバクテリア綱

放線菌(ほうせんきん、: Actinomycetes)は一般に、グラム陽性真正細菌のうち、細胞菌糸を形成して細長く増殖する形態的特徴を示すものを指していた。元来、菌糸が放射状に伸びるためこの名があるが、現在の放線菌の定義は16S rRNA遺伝子の塩基配列による分子系統学に基づいているため、桿菌球菌も放線菌に含められるようになり、もはやこのグループを菌糸形成という形態で特徴づけることは困難である。

学名のActinobacteria(放線菌門)は、ギリシア語光線放射を意味するακτίς(アクティース)とバクテリア合成したもの。また、放線菌類を意味するActinomycetesは、ακτίςに、菌類を意味する接尾語-mycetes(ミュケーテース、語源はギリシア語で菌を意味するμύκες(ミュケース))を合わせたものである。

Streptomycesなど典型的な放線菌では空気中に気菌糸を伸ばし胞子を形成するので、肉眼的には糸状菌のように見える。多くは絶対好気性土壌中に棲息するが、土壌以外にも様々な自然環境動植物病原菌としても棲息している。また病原放線菌として知られるActinomycesとその関連菌群などのように嫌気性を示す放線菌も一部存在する。放線菌のDNAはそのGC含量が高く(多くは70%前後)、それがこの菌群の大きな特徴である。

分類学的には下記に示す多くの属が放線菌綱に分類されるが、マイクロコッカス目(Order Micrococcales)の各属のように菌糸形態を示さないものは便宜的に放線菌として扱われないこともある。

利用[編集]

放線菌は特に抗生物質を生産する菌が多いので重要である。抗生物質生産菌の大部分が放線菌に属し、特にストレプトマイセス属Streptomycesストレプトマイシンの名の由来)に多い。

放線菌はカニ殻やエビ殻等の甲殻類に含まれるキチン質と呼ばれる物質を好むものもある。このキチンキチナーゼという酵素によって分解され、糸状菌等の病原菌の活性を抑制する効果があるとされる。 特になど寒い季節落葉の下の寒い場所を好む。竹林など多くの場所に生息している。このことから堆肥発酵にも関与していると考えられる。

フランキア属Frankia)はヤマモモグミなどの根に共生窒素固定を行う[1]。そのほか、上記の典型的な形態を示さないグループには、結核菌 Mycobacterium tuberculosisらい菌 Mycobacterium lepraeジフテリア菌 Corynebacterium diphtheriae や、BCG菌を含む Mycobacterium bovis のほか、グルタミン酸生産菌 Corynebacterium glutamicum のような工業的に重要な菌もある。また、ヒトなどの腸内細菌であるビフィズス菌も放線菌類に分類され、食品整腸剤に利用されている。

分類[編集]

2015年12月現在

以前はアクチノバクテリア綱の下に5亜綱が置かれていたが、2012年発行のBergey's Manual of Systematic Bacteriology 第2版 Vol. 5において6綱に再分類され、さらに放線菌目が分割されるなどの大幅な変更が行われた。

Acidimicrobiia

  • Acidimicrobiales
    • Acidimicrobiaceae科 - AcidimicrobiumAciditerrimonas属、Ferrimicrobium属、Ferrithrix属、Ilumatobacter
    • Iamiaceae科 - Iamia属、Aquihabitans

Coriobacteriia

  • Coriobacteriales
  • Eggerthellales
    • Eggerthellaceae - Eggerthella属、Adlercreutzia属、Asaccharobacter属、CryptobacteriumDenitrobacterium属、Enterorhabdus属、Gordonibacter属、Paraeggerthella属、Slackia

Nitriliruptoria

  • Nitriliruptorales
    • Nitriliruptoraceae科 - Nitriliruptor
  • Euzebyales
    • Euzebyaceae科 - Euzebya

Rubrobacteria

  • Rubrobacterales
    • Rubrobacteraceae科 - Rubrobacter
  • Gaiellales
    • Gaiellaceae 科 - Gaiella

Thermoleophilia

  • Thermoleophilales
    • Thermoleophilaceae科 - Thermoleophilum
  • Solirubrobacterales
    • Solirubrobacteraceae科 - Solirubrobacter
    • Conexibacteraceae科 - Conexibacter
    • Patulibacteraceae科 - Patulibacter

Actinobacteria

  • Actinomycetales
  • Acidothermales
    • Acidothermaceae科 - Acidothermus
  • Actinopolysporales
    • Actinopolysporaceae科 - Actinopolyspora属、Halopolyspora
  • Bifidobacteriales
    • Bifidobacteriaceae科 - Bifidobacterium属、Aeriscardovia属、Alloscardovia属、Bombiscardovia属、Gardnerella属、Parascardovia属、Pseudoscardovia属、Scardovia
  • Catenulisporales
    • Catenulisporaceae科 - Catenulispora
    • Actinospicaceae科 - Actinospica
  • Corynebacteriales
  • Frankiales
    • Frankiaceae - FrankiaJatrophihabitans
    • Cryptosporangiaceae科 - Cryptosporangium属、Fodinicola
    • Motilibacteraceae科 - Motilibacter
    • Sporichthyaceae科 - Sporichthya
    • 科不明 - Antricoccus
  • Geodermatophilales
    • Geodermatophilaceae科 - Geodermatophilus属、Blastococcus属、Modestobacter
  • Glycomycetales
  • Jiangellales
    • Jiangellaceae科 - Jiangella属、Haloactinopolyspora属、Phytoactinopolyspora
  • Kineosporiales
    • Kineosporiaceae科 - Kineosporia属、Angustibacter属、Kineococcus属、Pseudokineococcus属、Quadrisphaera
  • Micrococcales
    • Micrococcaceae - MicrococcusAcaricomes属、Arthrobacter属、Auritidibacter属、Citricoccus属、Enteractinococcus属、Garicola属、Kocuria属、Neomicrococcus属、Nesterenkonia属、Renibacterium属、Rothia属、Sinomonas属、Tersicoccus属、Yaniella属、Zhihengliuella
    • Beutenbergiaceae科 - Beutenbergia属、Miniimonas属、Salana属、Serinibacter
    • Bogoriellaceae科 - Bogoriella属、Georgenia属、Oceanitalea
    • Brevibacteriaceae科 - BrevibacteriumSpelaeicoccus
    • Cellulomonadaceae科 - Cellulomonas属、Actinotalea属、Oerskovia属、Paraoerskovia属、Sediminihabitans属、Tropheryma属、Tropicihabitans
    • Demequinaceae科 - Demequina属、Lysinimicrobium
    • Dermabacteraceae科 - Dermabacter属、Brachybacterium属、Devriesea属、Helcobacillus
    • Dermacoccaceae科 - Dermacoccus属、Barrientosiimonas属、Branchiibius属、Calidifontibacter属、Demetria属、Flexivirga属、Kytococcus属、Luteipulveratus属、Rudaeicoccus属、Tamlicoccus属、Yimella
    • Dermatophilaceae科 - Dermatophilus属、Austwickia属、Kineosphaera属、Mobilicoccus属、Piscicoccus属、Tonsilliphilus
    • Intrasporangiaceae科 - Intrasporangium属、Aquipuribacter属、Arsenicicoccus属、Fodinibacter属、Humibacillus属、Janibacter属、Knoellia属、Kribbia属、Lapillicoccus属、Marihabitans属、Ornithinibacter属、Ornithinicoccus属、Ornithinimicrobium属、Oryzihumus属、Oryzobacter属、Phycicoccus属、Serinicoccus属、Terrabacter属、Terracoccus属、Tetrasphaera
    • Jonesiaceae科 - Jonesia
    • Microbacteriaceae - MicrobacteriumAgreia属、AgrococcusAgromycesAlpinimonas属、Amnibacterium属、Aurantimicrobium属、Canibacter属、Chryseoglobus属、ClavibacterCompostimonas属、Conyzicola属、CryobacteriumCurtobacterium属、Diaminobutyricibacter属、Diaminobutyricimonas属、Frigoribacterium属、Frondihabitans属、Galbitalea属、Glaciibacter属、Glaciihabitans属、Gryllotalpicola属、Gulosibacter属、Herbiconiux属、Homoserinibacter属、Homoserinimonas属、Humibacter属、Klugiella属、Labedella属、Leifsonia属、Leucobacter属、Lysinibacter属、Lysinimonas属、Marisediminicola属、Microcella属、Microterricola属、Mycetocola属、Naasia属、Okibacterium属、Phycicola属、Plantibacter属、Pontimonas属、Pseudoclavibacter属、Rathayibacter属、Rhodoglobus属、Rhodoluna属、Rudaibacter属、Salinibacterium属、Schumannella属、Subtercola属、Yonghaparkia
    • Promicromonosporaceae科 - Promicromonospora属、Cellulosimicrobium属、Isoptericola属、Myceligenerans属、Xylanibacterium属、Xylanimicrobium属、Xylanimonas
    • Rarobacteraceae科 - Rarobacter
    • Ruaniaceae科 - Ruania属、Haloactinobacterium
    • Sanguibacteraceae科 - Sanguibacter
    • 科不明 - Luteimicrobium
  • Nakamurellales
    • Nakamurellaceae科 - Nakamurella
  • Micromonosporales
    • Micromonosporaceae科 - MicromonosporaActinocatenispora属、Actinoplanes属、Allocatelliglobosispora属、Asanoa属、Catellatospora属、Catelliglobosispora属、Catenuloplanes属、Couchioplanes属、Dactylosporangium属、Hamadaea属、Jishengella属、Krasilnikovia属、Longispora属、Luedemannella属、Phytohabitans属、Phytomonospora属、Pilimelia属、Planosporangium属、Plantactinospora属、Polymorphospora属、Pseudosporangium属、Rhizocola属、Rugosimonospora属、Salinispora属、Spirilliplanes属、Verrucosispora属、Virgisporangium属、Xiangella
  • Propionibacteriales
    • Propionibacteriaceae科 - Propionibacterium属、Aestuariimicrobium属、Auraticoccus属、Brooklawnia属、Friedmanniella属、Granulicoccus属、Luteococcus属、Mariniluteicoccus属、Microlunatus属、Micropruina属、Naumannella属、Propionicicella属、Propioniciclava属、Propionicimonas属、Propioniferax属、Propionimicrobium属、Tessaracoccus
    • Nocardioidaceae科 - Nocardioides属、Actinopolymorpha属、Aeromicrobium属、FlindersiellaKribbella属、Marmoricola属、Mumia属、Tenggerimyces属、Thermasporomyces
  • Pseudonocardiales
    • Pseudonocardiaceae科 - Pseudonocardia属、Actinoalloteichus属、ActinokineosporaActinomycetospora属、Actinophytocola属、ActinosynnemaAlloactinosynnema属、Allokutzneria属、AmycolatopsisCrossiella属、Goodfellowiella属、Haloechinothrix属、Kibdelosporangium属、Kutzneria属、Labedaea属、Lechevalieria属、Lentzea属、Longimycelium属、Prauserella属、Saccharomonospora属、Saccharopolyspora属、Saccharothrix属、Sciscionella属、Streptoalloteichus属、Tamaricihabitans属、Thermobispora属、Thermocrispum属、Thermotunica属、Umezawaea属、Yuhushiella
  • Streptomycetales
  • Streptosporangiales
    • Streptosporangiaceae科 - Streptosporangium属、Acrocarpospora属、Herbidospora属、Microbispora属、Microtetraspora属、Nonomuraea属、Planobispora属、Planomonospora属、Planotetraspora属、Sinosporangium属、Sphaerisporangium属、Thermoactinospora属、Thermocatellispora属、Thermopolyspora
    • Nocardiopsaceae科 - Nocardiopsis属、Actinorugispora属、Allosalinactinospora属、Haloactinospora属、Marinactinospora属、Murinocardiopsis属、Salinactinospora属、Spinactinospora属、Streptomonospora属、Thermobifida
    • Thermomonosporaceae科 - Thermomonospora属、Actinoallomurus属、Actinocorallia属、Actinomadura属、Spirillospora
    • 科不明 - Allonocardiopsis
  • 目不明
    • Mzabimycetaceae科 - Mzabimyces
  • 目不明
    • 科不明 - Bounagaea

脚注[編集]

  1. ^ 山中高史、岡部宏秋「ヤマハンノキの根粒から分離されたフランキア菌」、『日本林學會誌』第77巻第3号、一般社団法人日本森林学会、1995年5月1日、 269-271頁、 NAID 110002830676

外部リンク[編集]