スーパーオキシドディスムターゼ
| スーパーオキシドディスムターゼ | |||||||||
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 ヒトのMnのスーパーオキシドディスムターゼの単量体の構造。[1] | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 1.15.1.1 | ||||||||
| CAS登録番号 | 9054-89-1 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| IntEnz | IntEnz view | ||||||||
| BRENDA | BRENDA entry | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme view | ||||||||
| KEGG | KEGG entry | ||||||||
| MetaCyc | metabolic pathway | ||||||||
| PRIAM | profile | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | AmiGO / QuickGO | ||||||||
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スーパーオキシドディスムターゼ (Superoxide dismutase, SOD) は、細胞内に発生した活性酸素を分解する酵素である[2]。酸素消費量に対するSODの活性の強さと、寿命に相関があると言われるが、これは体重に対して消費する酸素の量が多い動物種ほど寿命が短くなるはずのところを、SODが活性酸素を分解することで寿命を延ばしているとするものであり、動物の中でも霊長類、とくにヒトはSODの活性の高さが際立ち、ヒトが長寿である原因のひとつとされている[3]。
SODは、スーパーオキシドアニオン（・O2-）を酸素と過酸化水素へ不均化する酸化還元酵素である。活性中心に銅(II)イオンと亜鉛(II)イオン(Cu, ZnSOD)、またはマンガン(III)イオン(MnSOD)や鉄(III) イオン(FeSOD)のように二価または三価の金属イオンを持った酵素で、細胞質（Cu, ZnSOD) やミトコンドリア（MnSOD)に多く局在している。酸化ストレスを減少させる役割を持つ。最近、ニッケルを持つ酵素(NiSOD)も発見されている。生成した過酸化水素はカタラーゼやペルオキシダーゼなどによって分解される。
がん細胞では活性酸素が高頻度に産生されており、SODの阻害に感受性を示す場合があるため、抗がん剤の標的として研究が行われている。
反応
[編集]SODの触媒機能による活性酸素の分解反応の半反応式は以下の通りである。
![{\displaystyle {\mathrm {M} {\vphantom {A}}^{({\mathit {n}}{+}1)+}{\text{-}}\mathrm {SOD} ~{\text{+}}\mathrm {O} {\vphantom {A}}_{\smash[{t}]{2}}{\vphantom {A}}^{-}{}\mathrel {\longrightarrow } {}\mathrm {M} {\vphantom {A}}^{{\mathit {n}}+}{\text{-}}\mathrm {SOD} ~{\text{+}}~\mathrm {O} {\vphantom {A}}_{\smash[{t}]{2}}}}](https://wikimedia.org/api/rest_v1/media/math/render/svg/8c929002b686d9d595704b377db7a16d630a2a28)
![{\displaystyle {\mathrm {M} {\vphantom {A}}^{{\mathit {n}}+}{\text{-}}\mathrm {SOD} \ {}+{}\mathrm {O} {\vphantom {A}}_{\smash[{t}]{2}}{\vphantom {A}}^{-}~{\text{+}}~2\,\mathrm {H} {\vphantom {A}}^{+}{}\mathrel {\longrightarrow } {}\mathrm {M} {\vphantom {A}}^{({\mathit {n}}{+}1)+}{\text{-}}\mathrm {SOD} ~{\text{+}}~\mathrm {H} {\vphantom {A}}_{\smash[{t}]{2}}\mathrm {O} {\vphantom {A}}_{\smash[{t}]{2}}}}](https://wikimedia.org/api/rest_v1/media/math/render/svg/54a653cd1e7d6f85b3f048eea6e84f279451c360)
ここで言うMは次のとおり。M = Cu (n=1) ; Mn (n=2) ; Fe (n=2) ; Ni (n=2)
この反応で、金属カチオンの酸化状態はnとn+1の間を変動している。
これらの半反応式をまとめると、以下の反応式で表される。
![{\displaystyle {2\,\mathrm {O} {\vphantom {A}}_{\smash[{t}]{2}}{\vphantom {A}}^{-}~{\text{+}}~2\,\mathrm {H} {\vphantom {A}}^{+}{}\mathrel {\longrightarrow } {}\mathrm {O} {\vphantom {A}}_{\smash[{t}]{2}}~{\text{+}}~\mathrm {H} {\vphantom {A}}_{\smash[{t}]{2}}\mathrm {O} {\vphantom {A}}_{\smash[{t}]{2}}}}](https://wikimedia.org/api/rest_v1/media/math/render/svg/7202f0cb2f78c32ead905ed062dff64e27425e50)
類型
[編集]一般
[編集]Irwin FridovichとJoe M. McCordによって発見されたSOD酵素群は以前、未知の機能をもつ金属タンパク質と考えられていた[4]。SODにはいくつかの類型があり、それらタンパク質には銅や亜鉛、マンガン、鉄またはニッケルが補因子として含まれる。
SODには金属補因子の種類により、Cu/Znタイプ（CuとZnの両方と結合する）、Fe・Mnタイプ（FeとMnのどちらかと結合する）、Niタイプ（Niと結合する）の3つのタイプに大別される。
- 銅/亜鉛 - 主に真核生物に使われるタイプ。事実上すべての真核細胞の細胞質基質はCu-Zn-SODを含む。市販されているCu-Zn-SODは通常はウシ亜科の細胞から精製されているものである。Cu-Zn-SODは分子量32,500のホモ二量体である。ウシ亜科のCu-Zn-SODは1975年に初めて構造が解明されたSODである[6]。8本のストランドがグリークキーでβバレルを形成した構造をしており、活性部位はバレルと表面ループとの間にある。2つのサブユニットは主に疎水的、静電気的相互作用により背中合わせに強く結合している。銅および亜鉛は6個のヒスチジンと1個アスパラギン酸側鎖に配位しており、1つのヒスチジンは2つの金属原子の間で共有されている[7]。
- ニッケル - 原核生物に含まれる。右巻きの4-ヘリックスバンドルからなる六量体構造で、それぞれニッケルイオンをキレートするN末端フックを含む。
ヒト
[編集]ヒト（すべての哺乳動物と大部分の脊椎動物も）では3種のSODが存在する。SOD1は細胞質、SOD2はミトコンドリア、SOD3は細胞外空間に存在する。SOD1は2つのユニットからなる二量体であるが、他の2種は4つのユニットからなる四量体である。SOD1とSOD3は銅と亜鉛を含むのに対し、SOD2はマンガンを活性中心に持つ。
経口補充に関する研究
[編集]Bacillus amyloliquefaciens由来のSODの経口補充効果が、 無作為化対照試験によって評価されている。健康な成人80名を 対象とした8週間のプラセボ対照試験では、急性有酸素運動に よって誘発された酸化ストレスが軽減され、内因性抗酸化酵素 活性が向上することが示された。[9] また、体外受精を受ける女性を対象とした別の無作為化対照試験 では、経口SOD補充により12週間にわたって血清カタラーゼ 活性が有意に増加し、抗酸化防御機能の改善が示唆された。 [10]
脚注
[編集]- ↑ PDB: 1VAR; Borgstahl GE, Parge HE, Hickey MJ, Johnson MJ, Boissinot M, Hallewell RA, Lepock JR, Cabelli DE, Tainer JA (April 1996). “Human mitochondrial manganese superoxide dismutase polymorphic variant Ile58Thr reduces activity by destabilizing the tetrameric interface”. Biochemistry 35 (14): 4287–97. doi:10.1021/bi951892w. PMID 8605177.
- ↑ 伊藤 2007, p.79
- ↑ 伊藤 2007, p.80
- ↑ McCord JM, Fridovich I (1988). “Superoxide dismutase: the first twenty years (1968-1988)”. Free Radic. Biol. Med. 5 (5-6): 363–9. doi:10.1016/0891-5849(88)90109-8. PMID 2855736.
- ↑ PDB: 2SOD;Tainer JA, Getzoff ED, Beem KM, Richardson JS, Richardson DC (September 1982). “Determination and analysis of the 2 A-structure of copper, zinc superoxide dismutase”. J. Mol. Biol. 160 (2): 181–217. PMID 7175933.
- ↑ Richardson JS, Thomas KA, Rubin BH, Richardson DC (1975). “Crystal Structure of Bovine Cu,Zn Superoxide Dismutase at 3Å Resolution: Chain Tracing and Metal Ligands.”. Proc Nat Acad Sci USA 72 (4): 1349–53. doi:10.1073/pnas.72.4.1349. PMC 432531. PMID 1055410..
- ↑ Tainer JA, Getzoff ED, Richardson JS, Richardson DC (1983). “Structure and mechanism of copper, zinc superoxide dismutase.”. Nature 306 (5940): 284–7. doi:10.1038/306284a0. PMID 6316150..
- ↑ PDB: 1N0J; Borgstahl GE, Parge HE, Hickey MJ, Beyer WF Jr, Hallewell RA, Tainer JA (1992). “The structure of human mitochondrial manganese superoxide dismutase reveals a novel tetrameric interface of two 4-helix bundles.”. Cell 71 (1): 107–18. doi:10.1016/0092-8674(92)90270-M. PMID 1394426.
- ↑ Nam, Yea-eun; Kwon, Oran (2024). “Acute and prolonged effects of Bacillus amyloliquefaciens GF424-derived SOD on antioxidant defense in healthy individuals challenged with intense aerobic exercise”. Free Radical Biology and Medicine 224: 484–493. doi:10.1016/j.freeradbiomed.2024.09.015.
- ↑ Shin, So Yeon; Yoon, Hye Kyung (2024). “The Efficacy and Safety of GF101 and Its Antioxidant Effect on In Vitro Fertilization Outcomes”. Antioxidants 13: 321. doi:10.3390/antiox13030321.
参考文献
[編集]- 伊藤明夫『細胞のはたらきがかわる本』株式会社 岩波書店〈岩波ジュニア新書〉、2007年。ISBN 978-4-00-500575-8。
関連項目
[編集]外部リンク
[編集]- 研究最前線、Superoxide dismutaseとその役割 （放射線医学総合研究所）[リンク切れ] Archived 2016-05-31 at the Wayback Machine.
- 銅・亜鉛-スーパーオキシドディスムターゼ - 脳科学辞典
| 典拠管理データベース: 国立図書館 |
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