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{{生物分類表 |
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{{生物分類表|色=細菌|名称=リゾバクター属|ドメイン=[[細菌]]<br />{{sname||Bacteria}}|門=[[プロテオバクテリア門]]<br />{{sname||Proteobacteria}}|綱=[[ガンマプロテオバクテリア綱|γプロテオバクテリア綱]]<br />{{sname||Gammaproteobacteria}}|目=[[シュードモナス目]]<br />{{sname||Pseudomonadales}}|科=[[シュードモナス科]]<br />{{sname||Pseudomonadaceae}}|属='''リゾバクター属'''<br />{{snamei||Rhizobacter}}|学名='''''Rhizobacter'''''<br /><small>後藤正夫と桑田博隆 1988</small>|タイプ種='''[[リゾバクター・ダウシ]]'''<br />'''''Rhizobacter dauci'''''<br /><small>後藤正夫と桑田博隆 1988</small>|下位分類名=[[種 (分類学)|種]]<ref name=LPSN>{{Cite web |publisher=List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature |author=Jean P. Euzéby, Aidan C. Parte |url=https://lpsn.dsmz.de/genus/rhizobacter |title=Genus ''Rhizobacter'' |access-date=2024-04-30 }}</ref>|下位分類=* {{snamei||Rhizobacter bergeniae}}<br /><small>Wei et al. 2015</small> |
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|色=細菌 |
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|名称=リゾバクター属 |
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* {{snamei||Rhizobacter fulvus}}<br /><small>(Yoon et al. 2007)<br />Stackebrandt et al. 2009</small> |
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|ドメイン=[[細菌]]<br />{{sname||Bacteria}} |
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|門=[[プロテオバクテリア門]]<br />{{sname||Proteobacteria}} |
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[[Category:Articles with 'species' microformats]] |
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|綱=[[ガンマプロテオバクテリア綱|γプロテオバクテリア綱]]<br />{{sname||Gammaproteobacteria}} |
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|目=[[シュードモナス目]]<br />{{sname||Pseudomonadales}} |
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|科=[[シュードモナス科]]<br />{{sname||Pseudomonadaceae}} |
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|属='''リゾバクター属'''<br />{{snamei||Rhizobacter}}|学名='''''Rhizobacter'''''<br /><small>後藤正夫と桑田博隆 1988<ref name="10.1099/00207713-38-3-233">{{cite journal |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |doi=10.1099/00207713-38-3-233 |volume=38 |issue=3 |title=''Rhizobacter daucus'' gen. nov., sp. nov., the Causal Agent of Carrot Bacterial Gall |後藤正夫(Masao Goto)と桑田博隆(Hirotaka Kuwata) |date=01 July 1988 |pages=233-239 }}</ref><br />(Stackebrandt ''et al''. 2009<ref name="10.1099/ijs.0.008383-0">{{cite journal |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |doi=10.1099/ijs.0.008383-0 |volume=59 |issue=10 |title=Dissection of the genus ''Methylibium'': reclassification of ''Methylibium fulvum'' as ''Rhizobacter fulvus'' comb. nov., ''Methylibium aquaticum'' as ''Piscinibacter aquaticus'' gen. nov., comb. nov. and ''Methylibium subsaxonicum'' as ''Rivibacter subsaxonicus'' gen. nov., comb. nov. and emended descriptions of the genera ''Rhizobacter'' and ''Methylibium'' |author=Erko Stackebrandt, Susanne Verbarg, Anja Frühling, Hans-Jürgen Busse and Brian J. Tindall |date=01 October 2009 |pages=2552-60 |PMID=19622640 }}</ref>)<br />IJSEMリストに掲載 2010<ref name="10.1099/ijs.0.021097-0">{{cite journal |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |doi=10.1099/ijs.0.021097-0 |volume=60 |issue=1 |title=Notification that new names and new combinations have appeared in volume 59, part 10, of the IJSEM |date=01 January 2010 |pages=3-4 }}</ref><br />(今井俊輔 ''et al''. 2013<ref name="10.2323/jgam.59.199">{{cite journal |journal=The Journal of General and Applied Microbiology |doi=10.2323/jgam.59.199 |title=''Rhizobacter gummiphilus'' sp. nov., a rubber-degrading bacterium isolated from the soil of a botanical garden in Japan |volume=59 |issue=3 |pages=199-205 |PMID=23863290 |author=Shunsuke Imai, Reishi Yoshida, Yuki Endo, Yukiyo Fukunaga, Atsushi Yamazoe, Daisuke Kasai, Eiji Masai, Masao Fukuda }}</ref>)<br />IJSEMリストに掲載 2016<ref name="10.1099/ijsem.0.001150">{{cite journal |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |doi=10.1099/ijsem.0.001150 |volume=66 |issue=7 |title=Notification of changes in taxonomic opinion previously published outside the IJSEM |author=Aharon Oren and George M. Garrity |date=01 July 2016 |pages=2469-2470 }}</ref></small> |
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|下位分類名=[[種 (分類学)|種]]<ref name=LPSN>{{Cite web |publisher=List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature |author=Jean P. Euzéby, Aidan C. Parte |url=https://lpsn.dsmz.de/genus/rhizobacter |title=Genus ''Rhizobacter'' |access-date=2024-04-30 }}</ref> |
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|下位分類= |
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* {{snamei||Rhizobacter bergeniae}}<br /><small>Wei ''et al''. 2015<ref name="10.1099/ijs.0.070318-0">{{cite journal |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |doi=10.1099/ijs.0.070318-0 |volume=65 |issue=Pt_2 |title=''Rhizobacter bergeniae'' sp. nov., isolated from the root of ''Bergenia scopulosa'' |author=Linfang Wei, Meiru Si, Mingxiu Long, Lingfang Zhu, Changfu Li, Xihui Shen, Yao Wang, Liang Zhao, Lei Zhang |date=01 February 2015 |pages=479-484 |PMID=25389149 }}</ref><br />(IJSEMリストに掲載 2015<ref name="10.1099/ijs.0.000142">{{cite journal |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |doi=10.1099/ijs.0.000142 |volume=65 |issue=Pt_5 |title=Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 65, part 2, of the IJSEM |author=Aharon Oren and George M. Garrity |date=01 May 2015 |pages=1397-1399 }}</ref>)</small> |
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* {{snamei||Rhizobacter fulvus}}<br /><small>(corrig. Yoon ''et al''. 2007<ref name="10.1099/ijs.0.64909-0">{{cite journal |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |doi=10.1099/ijs.0.64909-0 |volume=57 |issue=9 |tilte=''Methylibium fulvum'' sp. nov., a member of the ''Betaproteobacteria'' isolated from ginseng field soil, and emended description of the genus ''Methylibium'' |author=Min-Ho Yoon, Leonid N. Ten, Wan-Taek Im and Sung-Taik Lee |date=01 September 2007 |pages=2062-2066 |PMID=17766872 }}</ref>)<br />Stackebrandt ''et al''. 2009<ref name="10.1099/ijs.0.008383-0" /><br />(IJSEMリストに掲載 2010<ref name="10.1099/ijs.0.021097-0" />)</small> |
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'''リゾバクター属'''（ーぞく、'''''Rhizobacter'''''）は[[真正細菌]]の[[プロテオバクテリア門]][[ガンマプロテオバクテリア綱]][[シュードモナス目]][[シュードモナス科]]の[[属 (分類学)|属]]の一つである。 |
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'''リゾバクター属'''（ーぞく、'''''Rhizobacter'''''）は真正細菌の[[プロテオバクテリア門]][[ガンマプロテオバクテリア綱]][[シュードモナス目]][[シュードモナス科]]の属の一つである。植物に対する病原性細菌であり、感染した植物にこぶ（[[虫こぶ]]）を発生させる。宿主範囲は非常に広く、少なくとも24科46種の植物に及び、その中には[[トマト]]（''Solanum lycopersicum''）や[[キャベツ]]（''Brassica oleracea''）も含まれる。タイプ種であるリゾバクター・ダウシー（''[[Rhizobacter dauci]]''）はニンジンこぶ病菌として知られており、ニンジンに発生した細菌性こぶの原因菌として1988年に後藤正夫と桑田博隆によって日本で初めて同定された。 |
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植物に対する病原性細菌であり、感染した植物にこぶ（[[虫こぶ]]）を発生させる<ref name="10.3389/fpls.2017.01089">{{cite journal |author=Caballo-Ponce E, Murillo J, Martínez-Gil M, Moreno-Pérez A, Pintado A and Ramos C |date=2017 |title=Knots Untie: Molecular Determinants Involved in Knot Formation Induced by ''Pseudomonas savastanoi'' in Woody Hosts |journal=Frontiers in Plant Science |volume=8 |pages=1089 |doi=10.3389/fpls.2017.01089 }}</ref>。宿主範囲は非常に広く、少なくとも24科46種の植物に及び、その中には[[トマト]]（''Solanum lycopersicum''）や[[キャベツ]]（''Brassica oleracea''）も含まれる<ref name="10.1007/s10327-009-0160-6">{{cite journal |author=Hideshi Kawarazaki, Masao Goto, Kotaro Kato, Toshio Kijima, Hiroshi Kawada, Keisuke Yamamoto & Yuichi Takikawa |date=2009 |title=Identification of a bacterium isolated from galls on carrot and weeds |journal=Journal of General Plant Pathology |volume=75 |pages=235–240 |doi=10.1007/s10327-009-0160-6 }}</ref><ref name="10.3186/jjphytopath.78.293">{{cite journal |author=河原崎 秀志, 後藤 正夫, 加藤 孝太郎, 木嶋 利男, 瀧川 雄一 |date=2012 |title=ニンジンこぶ病菌''Rhizobacter dauci''の各種植物からの分離と宿主範囲 Isolation and plant host range of ''Rhizobacter dauci'', causal agent of carrot bacterial gall |journal=Jpn. J. Phytopathol. |volume=78 |issue=4 |pages=293–300 |doi=10.3186/jjphytopath.78.293 }}</ref>。タイプ種である[[リゾバクター・ダウシ]]（''Rhizobacter dauci''）はニンジンこぶ病菌として知られており、ニンジンに発生した細菌性こぶの原因菌として1988年に[[静岡大学]]農学部の[[青森県畑作園芸試験場]]の後藤正夫と桑田博隆によって日本で初めて同定された<ref name="10.1099/00207713-38-3-233" />。 |
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== 脚注 == |
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2024年4月30日 (火) 12:19時点における版
| リゾバクター属 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 分類 | ||||||||||||||||||
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| 学名 | ||||||||||||||||||
| Rhizobacter 後藤正夫と桑田博隆 1988[1] (Stackebrandt et al. 2009[2]) IJSEMリストに掲載 2010[3] (今井俊輔 et al. 2013[4]) IJSEMリストに掲載 2016[5] | ||||||||||||||||||
| タイプ種 | ||||||||||||||||||
| リゾバクター・ダウシ Rhizobacter dauci 後藤正夫と桑田博隆 1988[1] (Stackebrandt et al. 2009[2]) IJSEMリストに掲載 2010[3] | ||||||||||||||||||
| 種[11] | ||||||||||||||||||
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リゾバクター属（ーぞく、Rhizobacter）は真正細菌のプロテオバクテリア門ガンマプロテオバクテリア綱シュードモナス目シュードモナス科の属の一つである。
概要
植物に対する病原性細菌であり、感染した植物にこぶ（虫こぶ）を発生させる[12]。宿主範囲は非常に広く、少なくとも24科46種の植物に及び、その中にはトマト（Solanum lycopersicum）やキャベツ（Brassica oleracea）も含まれる[13][14]。タイプ種であるリゾバクター・ダウシ（Rhizobacter dauci）はニンジンこぶ病菌として知られており、ニンジンに発生した細菌性こぶの原因菌として1988年に静岡大学農学部の青森県畑作園芸試験場の後藤正夫と桑田博隆によって日本で初めて同定された[1]。
グラム陰性で非胞子形成性の、直線からわずかに曲がった形状の桿菌である。極鞭毛または側鞭毛、あるいはその両方を持ち運動性を示す。ポリ-β-ヒドロキシ酪酸顆粒を形成する。化学有機栄養性であり、グルコースの呼吸代謝を伴う好気性である。d-グルコースを唯一の炭素源とエネルギー源として利用する。寒天プレート上では、白または黄白色のひだ状の、硬質または粘着性のコロニーを形成する。液体培地では、球状単位から構成される綿状のコロニーを形成し、指状突起は発生しない[1]。コロニーの色は培地によって白色または黄白色に変わる[2]。システインを与えたときのオキシダーゼ、及び硫化水素の生成は起こり、硝酸塩の還元、o-ニトロフェニル-p-d-ガラクトピラノシド試験及びシアン化カリウムによる増殖阻害について陽性を示す。脱窒、メチルレッド試験並びに、アルギニンジヒドロラーゼ、ニトロゲナーゼ、蛍光色素、インドール、アセトインの生成試験では陰性を示す[1]。カタラーゼ試験結果は可変である[2]。10 p-gのvibriostatic agent 0/129リン酸に感受性を示す。デンプン、デキストリン、グリコーゲンの加水分解能を持つ。ベンゼン誘導体を炭素源として利用することはできない。塩化ナトリウムや成長因子を必須としない[1]。主要なキノンはユビキノンQ8である[2]。主要な細胞脂肪酸はC16:0及びC16:1ω7c及び/又はiso-C15:0 2-OHである。C12:0 2-OH、C17:0シクロ、及びC18:0の有無はどちらもあり得る[4]。ポリアミンについては主要なものは2-ヒドロキシプトレシンとプトレシンであり、カダベリンとスペルミンは微量に存在し、スペルミジンが少量存在する場合がある。主な極性脂質は、ジホスファチジルグリセロール、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルエタノールアミンである。1つの未確認アミノ脂質と1つまたは2つの未確認アミノリン脂質も検出される[2]。キサントモナジンとは異なる黄色の色素を呈する[1]。DNAのGC含量は66～71mol%である[2]。
脚注
- ^ a b c d e f g h “Rhizobacter daucus gen. nov., sp. nov., the Causal Agent of Carrot Bacterial Gall”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 38 (3): 233-239. (01 July 1988). doi:10.1099/00207713-38-3-233.
- ^ a b c d e f g h i Erko Stackebrandt, Susanne Verbarg, Anja Frühling, Hans-Jürgen Busse and Brian J. Tindall (01 October 2009). “Dissection of the genus Methylibium: reclassification of Methylibium fulvum as Rhizobacter fulvus comb. nov., Methylibium aquaticum as Piscinibacter aquaticus gen. nov., comb. nov. and Methylibium subsaxonicum as Rivibacter subsaxonicus gen. nov., comb. nov. and emended descriptions of the genera Rhizobacter and Methylibium”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 59 (10): 2552-60. doi:10.1099/ijs.0.008383-0. PMID 19622640.
- ^ a b c d “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 59, part 10, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 60 (1): 3-4. (01 January 2010). doi:10.1099/ijs.0.021097-0.
- ^ a b Shunsuke Imai, Reishi Yoshida, Yuki Endo, Yukiyo Fukunaga, Atsushi Yamazoe, Daisuke Kasai, Eiji Masai, Masao Fukuda. “Rhizobacter gummiphilus sp. nov., a rubber-degrading bacterium isolated from the soil of a botanical garden in Japan”. The Journal of General and Applied Microbiology 59 (3): 199-205. doi:10.2323/jgam.59.199. PMID 23863290.
- ^ Aharon Oren and George M. Garrity (01 July 2016). “Notification of changes in taxonomic opinion previously published outside the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 66 (7): 2469-2470. doi:10.1099/ijsem.0.001150.
- ^ Linfang Wei, Meiru Si, Mingxiu Long, Lingfang Zhu, Changfu Li, Xihui Shen, Yao Wang, Liang Zhao, Lei Zhang (01 February 2015). “Rhizobacter bergeniae sp. nov., isolated from the root of Bergenia scopulosa”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 65 (Pt_2): 479-484. doi:10.1099/ijs.0.070318-0. PMID 25389149.
- ^ Aharon Oren and George M. Garrity (01 May 2015). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 65, part 2, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 65 (Pt_5): 1397-1399. doi:10.1099/ijs.0.000142.
- ^ Min-Ho Yoon, Leonid N. Ten, Wan-Taek Im and Sung-Taik Lee (01 September 2007). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 57 (9): 2062-2066. doi:10.1099/ijs.0.64909-0. PMID 17766872.
- ^ Long Jin, So-Ra Ko, Chi-Yong Ahn, Hyung-Gwan Lee and Hee-Mock Oh (01 May 2016). “Rhizobacter profundi sp. nov., isolated from freshwater sediment”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 66 (5): 1926-1931. doi:10.1099/ijsem.0.000962. PMID 26868002.
- ^ Aharon Oren and George M. Garrity (01 August 2016). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations and new taxonomic opinions have appeared in volume 66, part 5, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 66 (8): 2767-2768. doi:10.1099/ijsem.0.001168.
- ^ Jean P. Euzéby, Aidan C. Parte. “Genus Rhizobacter”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. 2024年4月30日閲覧。
- ^ Caballo-Ponce E, Murillo J, Martínez-Gil M, Moreno-Pérez A, Pintado A and Ramos C (2017). “Knots Untie: Molecular Determinants Involved in Knot Formation Induced by Pseudomonas savastanoi in Woody Hosts”. Frontiers in Plant Science 8: 1089. doi:10.3389/fpls.2017.01089.
- ^ Hideshi Kawarazaki, Masao Goto, Kotaro Kato, Toshio Kijima, Hiroshi Kawada, Keisuke Yamamoto & Yuichi Takikawa (2009). “Identification of a bacterium isolated from galls on carrot and weeds”. Journal of General Plant Pathology 75: 235–240. doi:10.1007/s10327-009-0160-6.
- ^ 河原崎 秀志, 後藤 正夫, 加藤 孝太郎, 木嶋 利男, 瀧川 雄一 (2012). “ニンジンこぶ病菌Rhizobacter dauciの各種植物からの分離と宿主範囲 Isolation and plant host range of Rhizobacter dauci, causal agent of carrot bacterial gall”. Jpn. J. Phytopathol. 78 (4): 293–300. doi:10.3186/jjphytopath.78.293.