ドメイン (分類学)
生物分類学におけるドメイン（英: domainドメイン、羅: regioレギオー）とは、界よりも上の、最も高いランクのタクソンである。日本語では中国語に由来する「域」あるいはregio/domainを直訳した「領域」と呼ばれることがある。英語では他にempire（エンパイアー）、superkingdom（スーパーキングダム）、またラテン語のimperium（インペリウム）やsuperregnum（スぺッレグヌム）も時に使用される。
この階級の新設は、これまでの分類の最も高い階層である界が本来は植物と動物を分けるために設定されたものであったことに由来する。様々な生物の発見により、この分類は改変を受けてきた（五界説を参照）が、原核生物と真核生物の差が、真核生物内部での植物と動物の差より大きいものと考えられるようになったこと、また古細菌の発見によって原核生物内の多様性が想像以上に大きいことがわかってきたことによって、界より上のランクを設定した方がよい、との判断が生まれてきたことによるものである。
タクソンへの分類は、基礎的なゲノムの進化の違いを反映して行われる。生物のドメイン分けはいくつかのやり方が提案されている。例えば次のようなものがある。
- 2帝説 - 最上位の分類を原核生物帝と真核生物帝の2つのインペリウム（帝国）に分ける。
- 3ドメイン説-最上位の分類を古細菌、真正細菌、真核生物の3つのドメインに分ける。
後者は1990年にカール・ウーズによって提案された最も新しい説であり、次第に支持されている。一部階級の新設に反対する研究者の中には、ドメインの代わりにインペリウムやエンパイアーを使用するものもいる。
これらの分類は、一義的には遺伝子配列の分析データと分岐学に基づくが、さらなる理由付けが期待されている。
ドメインより上の階級も提唱されているが、広く受け入れられているものは無い。例えば、リンネは動物界、植物界、鉱物界の上にImperium Naturae（自然帝）を置いた。3つのドメインの上にImperium Cellulata（細胞生物帝）を置く研究者もいる。
[編集] 3つのドメインの比較
| 特徴 | 真正細菌 Bacteria |
古細菌 Archaea |
真核生物 Eukarya |
|---|---|---|---|
| 大きさ | 小(1-10μ) | 大(10μ～) | |
| ペプチドグリカン | ○ | × | |
| 細胞膜 | ジエステル（sn-1,2） | ジエーテル（sn-2,3） | ジエステル（sn-1,2） |
| 核、細胞小器官の有無 | × | ○ | |
| 鞭毛 | フラジェリン | 独自 | チューブリン |
| DNA | 環状 | 線状 | |
| ヒストン | × | ○ | |
| 複製開始点 | 1つ | 1つまたは複数 | 複数 |
| RNAポリメラーゼ | 単純 | 複雑 | |
| プロモーター | プリブノーボックス | TATAボックス | |
| mRNAスプライシング | × | ○ | |
| リボソーム | 70S | 80S | |
| 翻訳開始アミノ酸 | フォルミルメチオニン | メチオニン | |
| アフィディコリン感受性 ジフテリア毒素感受性 アニソマイシン感受性 アンピシリン感受性 ストレプトマイシン感受性 キロマイシン感受性 テトラサイクリン感受性 |
× × × ○ ○ ○ ○ |
○ ○ ○ × × × × |
|
| エリスロマイシン感受性 | ○ | △ | × |
| クロラムフェニコール感受性 | ○ | × | |
