アスティカカウリス属

アスティカカウリス属
分類
学名
	Asticcacaulis; Poindexter 1964; (IJSEMリストに掲載 1980)
タイプ種
	アスティカカウリス・エクスセントリカス; Asticcacaulis excentricus; Poindexter 1964; (IJSEMリストに掲載 1980)
下位分類（種）
	Asticcacaulis benevestitus; Vasilyeva et al. 2006; (IJSEMリストに掲載 2006); アスティカカウリス・ビプロスセシウム; Asticcacaulis biprosthecius; corrig. Pate et al. 1973; (IJSEMリストに掲載 1980); アスティカカウリス・エンドフィティカス; Asticcacaulis endophyticus; Zhu et al. 2014; (IJSEMリストに掲載 2015); アスティカカウリス・エクスセントリカス; Asticcacaulis excentricus; Poindexter 1964; (IJSEMリストに掲載 1980); Asticcacaulis solisilvae; Kim et al. 2013; (IJSEMリストに掲載 2014); アスティカカウリス・タイヒュエンシス; Asticcacaulis taihuensis; Liu et al. 2005; (IJSEMリストに掲載 2005); Asticcacaulis tiandongensis; Zhou et al. 2020; (IJSEMリストに掲載 2020);

アスティカカウリス属（Asticcacaulis）は真正細菌のプロテオバクテリア門アルファプロテオバクテリア綱カウロバクター目カウロバクター科の属の一つである。細胞分裂に置いて2つの異なる特徴的な形態の細胞を示すDimorphic Prosthecate Bacteria（DPB）であることで知られている^[3]。

概要[編集]

アスティカカウリス属の名称については、古代ギリシア語における否定の接頭辞”a”、新ラテン語の棒を意味する名詞”sticca”、ラテン語で茎を意味する男性名詞”caulis”、全て合わせて「棒ではない茎」を意味するラテン語の男性名詞となる^[14]。これは、同じカウロバクター科であり細胞分裂の際に特徴的な棒状の細胞"stalked cell"を形成するカウロバクター属と関連付けられた時、アスティカカウリス属細菌は細胞分裂でstalked cellを形成しないことに基づいて研究者が名付けたことに由来する^[15]。

単細胞の桿状無色のプロステーカ細菌である^[1]。プロステーカは細胞極ではない部位から生じ、接着物質は伴わない。増殖は、プロステーカを持つ細胞の分裂によって発生し、分裂後は、プロステーカを継承した有柄細胞（stalked cell）と、それよりも小さく、細胞極の中心に単一の鞭毛を持ち運動性を示すがプロステーカは持たない遊泳細胞（nonstalked cell）が生まれる。遊泳細胞は成長すると、プロステーカを発生させて運動性を示さなくなる栄養期に入る。接着物質は茎の発生部位とは異なる、細胞極又はその付近の部位から、遊泳時期と栄養期の両方に置いて分泌される。この接着物質により、細胞は環境中の物体表面に接着したり、他の細胞と結合してロゼットを形成したりできる。

歴史[編集]

1964年、アスティカカウリス・エクスセントリカス(Asticcacaulis excentricus)の発見とともに、アスティカカウリス属はPoindexterによって現在と同様カウロバクター科の細菌として提案された^[1]。
1973年にアスティカカウリス・ビプロスセシウム(Asticcacaulis biprosthecius)が発見された^[5]。
1999年にアスティカカウリス属とその近縁属と考えられていた属との系統学的関係について16S rRNA遺伝子配列解析によって調査が行われた。当時はその特徴的な細胞分裂形態からカウロバクター属(Caulobacter)やブレブンディモナス属(Brevundimonas)と同じグループであることは認識されていたが、その系統学的近縁が裏付けられた。2001年に16S rRNA遺伝子配列のほか、脂質分析を含んだ複合的な遺伝学的生理学的解析がなされ、これら3つの近縁属は細胞膜の極性脂質によっても区別できることが示され、カウロバクター属は1,2-ジアシル-3-O-[6'-ホスファチジル-α-D-グルコピラノシル]グリセロールを欠如している点で他2属と異なった^[16]。
2005年に、アスティカカウリス・タイヒュエンシス(Asticcacaulis taihuensis)が中国江蘇省の淡水湖の太湖湖底の堆積物から発見されたことが報告された^[10]。
2006年に、極地ウラルのヴォルクタのツンドラ湿地の泥炭からAsticcacaulis benevestitusが単離されたことが報告された^[3]。
2013年に韓国清渓山の森林土壌からAsticcacaulis solisilvaeが単離された^[8]。
2014年に、中国陝西省にある太白山のオオダイコンソウ(Geum aleppicum Jacq.)の表面滅菌された根から植物内生菌としてアスティカカウリス・エンドフィティカス(Asticcacaulis endophyticus)が単離されたことが報告された^[6]。
2020年に、カルスト土壌からAsticcacaulis tiandongensisが単離されたことが報告された^[12]。

系統樹[編集]

アスティカカウリス属の代表菌株の進化的関係を表す系統樹を下記に示す^[12]。

	ブレブンディモナス・メディテラネア(Brevundimonas mediterranea)

	ブレブンディモナス・ベシキュラリス(Brevundimonas vesicularis)

"Brevundimonas olei"

	Brevundimonas naejangsanensis

	ブレブンディモナス・ディミヌタ(Brevundimonas diminuta)

ブレブンディモナス・アビッサリス(Brevundimonas abyssalis)

Caulobacter ginsengisoli

カウロバクター・ヘンリシイ(Caulobacter henricii)

カウロバクター・ビブリオイデス(Caulobacter vibrioides)

	Caulobacter hibisci

	カウロバクター・フラバス(Caulobacter flavus)

Phenylobacterium conjunctum

	フェニロバクテリウム・イムモビレ(Phenylobacterium immobile)

	Phenylobacterium deserti

	Asticcacaulis tiandongensis

	アスティカカウリス・エクスセントリカス(Asticcacaulis excentricus)(タイプ種)

アスティカカウリス・エンドフィティカス(Asticcacaulis endophyticus)

Asticcacaulis solisilvae

アスティカカウリス・ビプロスセシウム(Asticcacaulis biprosthecius)

	アスティカカウリス・タイヒュエンシス(Asticcacaulis taihuensis)

	Asticcacaulis benevestitus

ハイフォモナス・ポリモルファ(Hyphomonas polymorpha)

脚注[編集]

[脚注の使い方]

^ ^a ^b ^c ^d ^e Jeanne Stove Poindexter (1 September 1964). “BIOLOGICAL PROPERTIES AND CLASSIFICATION OF THE CAULOBACTER GROUP”. Bacteriological Reviews 28 (3). doi:10.1128/br.28.3.231-295.1964. PMC 441226. PMID 14220656.
^ ^a ^b ^c ^d V. B. D. Skerman, Vicki. McGOWAN, P. H. A. Sneath (01 January 1980). “Approved Lists of Bacterial Names”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 30 (1). doi:10.1099/00207713-30-1-225.
^ ^a ^b ^c Lina V. Vasilyeva, Marina V. Omelchenko, Yulia Y. Berestovskaya, Anatolii M. Lysenko, Wolf-Rainer Abraham, Svetlana N. Dedysh, George A. Zavarzin (01 September 2006). “Asticcacaulis benevestitus sp. nov., a psychrotolerant, dimorphic, prosthecate bacterium from tundra wetland soil”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56 (9). doi:10.1099/ijs.0.64122-0.
^ “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 56, part 9, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56 (12). (01 December 2006). doi:10.1099/ijs.0.64814-0.
^ ^a ^b J. L. Pate, J. S. Porter & T. L. Jordan (December 1973). “Asticcacaulis biprosthecum sp.nov. Life cycle, morphology and cultural characteristics”. Antonie van Leeuwenhoek 39: 569–583. doi:10.1007/BF02578901.
^ ^a ^b Lingfang Zhu, Mingxiu Long, Meiru Si, Linfang Wei, Changfu Li, Liang Zhao, Xihui Shen, Yao Wang1, Lei Zhang (01 December 2014). “Asticcacaulis endophyticus sp. nov., a prosthecate bacterium isolated from the root of Geum aleppicum”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 64 (Pt_12). doi:10.1099/ijs.0.066605-0. PMID 25205798.
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^ “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 55, part 3, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 55 (5). (01 September 2005). doi:10.1099/ijs.0.63918-0.
^ ^a ^b ^c Xing-Kui Zhou, Ying Huang, Miao Li, Xiao-Fei Zhang, Yu-Qian Wei, Shi-Chun Qin, Ti-Kun Zhang, Xue-Jian Wang, Jian-Jin Liu, Liang Wang Mr., Zi-Yi Liu, Ming-He Mo (03 February 2020). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 (1). doi:10.1099/ijsem.0.003818. PMID 31778348.
^ Aharon Oren, George M. Garrity (30 April 2020). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 70, part 1 of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 (4). doi:10.1099/ijsem.0.004092.
^ ^a ^b “Genus Asticcacaulis”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. 2023年3月19日閲覧。
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^ W R Abraham, C Strömpl, M Vancanneyt, H Lünsdorf, E R Moore (01 January 2001). “Determination of the systematic position of the genus Asticcacaulis Poindexter by a polyphasic analysis”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 51 (1). doi:10.1099/00207713-51-1-27.

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[10.1128/br.28.3.231-295.1964-1] Jeanne Stove Poindexter (1 September 1964). “BIOLOGICAL PROPERTIES AND CLASSIFICATION OF THE CAULOBACTER GROUP”. Bacteriological Reviews 28 (3). doi:10.1128/br.28.3.231-295.1964. PMC 441226. PMID 14220656.

[10.1099/00207713-30-1-225-2] V. B. D. Skerman, Vicki. McGOWAN, P. H. A. Sneath (01 January 1980). “Approved Lists of Bacterial Names”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 30 (1). doi:10.1099/00207713-30-1-225.

[10.1099/ijs.0.64122-0-3] Lina V. Vasilyeva, Marina V. Omelchenko, Yulia Y. Berestovskaya, Anatolii M. Lysenko, Wolf-Rainer Abraham, Svetlana N. Dedysh, George A. Zavarzin (01 September 2006). “Asticcacaulis benevestitus sp. nov., a psychrotolerant, dimorphic, prosthecate bacterium from tundra wetland soil”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56 (9). doi:10.1099/ijs.0.64122-0.

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[10.1007/BF02578901-5] J. L. Pate, J. S. Porter & T. L. Jordan (December 1973). “Asticcacaulis biprosthecum sp.nov. Life cycle, morphology and cultural characteristics”. Antonie van Leeuwenhoek 39: 569–583. doi:10.1007/BF02578901.

[10.1099/ijs.0.066605-0-6] Lingfang Zhu, Mingxiu Long, Meiru Si, Linfang Wei, Changfu Li, Liang Zhao, Xihui Shen, Yao Wang1, Lei Zhang (01 December 2014). “Asticcacaulis endophyticus sp. nov., a prosthecate bacterium isolated from the root of Geum aleppicum”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 64 (Pt_12). doi:10.1099/ijs.0.066605-0. PMID 25205798.

[10.1099/ijs.0.000045-7] Aharon Oren, George M. Garrity (01 March 2015). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 64, part 12, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 65 (Pt_3). doi:10.1099/ijs.0.000045.

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[10.1099/ijs.0.63334-0-10] Zhi-Pei Liu, Bao-Jun Wang, Shuang-Jiang Liu, Ying-Hao Liu (01 May 2005). “Asticcacaulis taihuensis sp. nov., a novel stalked bacterium isolated from Taihu Lake, China”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 55 (3). doi:10.1099/ijs.0.63334-0. PMID 15879262.

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[10.1099/ijsem.0.004092-13] Aharon Oren, George M. Garrity (30 April 2020). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 70, part 1 of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 (4). doi:10.1099/ijsem.0.004092.

[LPSN-14] “Genus Asticcacaulis”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. 2023年3月19日閲覧。

[10.1111/j.1574-6976.1999.tb00397.x-15] Hans G. Trüper (01 April 1999). “How to name a prokaryote?: Etymological considerations, proposals and practical advice in prokaryote nomenclature”. FEMS Microbiology Reviews 23 (2): 231–249. doi:10.1111/j.1574-6976.1999.tb00397.x.

[10.1099/00207713-51-1-27-16] W R Abraham, C Strömpl, M Vancanneyt, H Lünsdorf, E R Moore (01 January 2001). “Determination of the systematic position of the genus Asticcacaulis Poindexter by a polyphasic analysis”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 51 (1). doi:10.1099/00207713-51-1-27.

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