「APOBEC3G」の版間の差分

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APOBEC3Gおよび同じファミリーの他のタンパク質は、活性化誘導（シチジン）デアミナーゼ（[[活性化誘導シチジンデアミナーゼ|AID]]）として機能できる。APOBEC3Gが逆転写を阻害する機序はHIV DNAへの無数の[[デオキシシチジン]]から[[デオキシウリジン]]への変異誘導によるもであるが、この反応は主に[[相補的DNA]](cDNA)の形で発現されるHIV DNAのマイナス鎖に対して3’→5’方向に起こる。<ref>{{Cite journal|last=Mbisa|first=Jean L.|last2=Barr|first2=Rebekah|last3=Thomas|first3=James A.|last4=Vandegraaff|first4=Nick|last5=Dorweiler|first5=Irene J.|last6=Svarovskaia|first6=Evguenia S.|last7=Brown|first7=William L.|last8=Mansky|first8=Louis M.|last9=Gorelick|first9=Robert J.|date=2007-07-01|title=Human Immunodeficiency Virus Type 1 cDNAs Produced in the Presence of APOBEC3G Exhibit Defects in Plus-Strand DNA Transfer and Integration|url=https://jvi.asm.org/content/81/13/7099|journal=Journal of Virology|volume=81|issue=13|pages=7099–7110|language=en|doi=10.1128/JVI.00272-07|issn=0022-538X|pmid=17428871|pmc=PMC1933301}}</ref>APOBEC3GはAPOBECスーパーファミリーに属しており、AIDとして機能するため、シチジン脱アミノ化のためにAPOBEC3Gによって媒介されるメカニズムは、[[大腸菌]]のシチジンデアミナーゼのメカニズムと類似しうる。大腸菌のシチジンデアミナーゼはヌクレオチドと亜鉛結合領域周辺でAPOBEC1やAIDと高い相同性を持つことが知られている。現在予測されてる脱アミノ化反応の機序は、亜鉛配位酵素によるシチジンピリミジン環の4位への直接求核的な攻撃によって引き起こされるものである。水は、[[水素原子]]とヒドロキシル基ドナーの両方の供給源として必要である。<ref name=":2">{{Cite journal|last=Neuberger|first=Michael S.|last2=Harris|first2=Reuben S.|last3=Di Noia|first3=Javier|last4=Petersen-Mahrt|first4=Svend K.|date=2003-06|title=Immunity through DNA deamination|url=https://doi.org/10.1016/S0968-0004(03)00111-7|journal=Trends in Biochemical Sciences|volume=28|issue=6|pages=305–312|doi=10.1016/s0968-0004(03)00111-7|issn=0968-0004}}</ref>(図2)4位での脱アミノ化（および結果として生じる酸化）により、[[カルボニル基]]が生成され、シチジンからウリジンへの変化が起こる。
APOBEC3Gおよび同じファミリーの他のタンパク質は、活性化誘導（シチジン）デアミナーゼ（[[活性化誘導シチジンデアミナーゼ|AID]]）として機能できる。APOBEC3Gが逆転写を阻害する機序はHIV DNAへの無数の[[デオキシシチジン]]から[[デオキシウリジン]]への変異誘導によるもであるが、この反応は主に[[相補的DNA]](cDNA)の形で発現されるHIV DNAのマイナス鎖に対して3’→5’方向に起こる。<ref>{{Cite journal|last=Mbisa|first=Jean L.|last2=Barr|first2=Rebekah|last3=Thomas|first3=James A.|last4=Vandegraaff|first4=Nick|last5=Dorweiler|first5=Irene J.|last6=Svarovskaia|first6=Evguenia S.|last7=Brown|first7=William L.|last8=Mansky|first8=Louis M.|last9=Gorelick|first9=Robert J.|date=2007-07-01|title=Human Immunodeficiency Virus Type 1 cDNAs Produced in the Presence of APOBEC3G Exhibit Defects in Plus-Strand DNA Transfer and Integration|url=https://jvi.asm.org/content/81/13/7099|journal=Journal of Virology|volume=81|issue=13|pages=7099–7110|language=en|doi=10.1128/JVI.00272-07|issn=0022-538X|pmid=17428871|pmc=PMC1933301}}</ref>APOBEC3GはAPOBECスーパーファミリーに属しており、AIDとして機能するため、シチジン脱アミノ化のためにAPOBEC3Gによって媒介されるメカニズムは、[[大腸菌]]のシチジンデアミナーゼのメカニズムと類似しうる。大腸菌のシチジンデアミナーゼはヌクレオチドと亜鉛結合領域周辺でAPOBEC1やAIDと高い相同性を持つことが知られている。現在予測されてる脱アミノ化反応の機序は、亜鉛配位酵素によるシチジンピリミジン環の4位への直接求核的な攻撃によって引き起こされるものである。水は、[[水素原子]]とヒドロキシル基ドナーの両方の供給源として必要である。<ref name=":2">{{Cite journal|last=Neuberger|first=Michael S.|last2=Harris|first2=Reuben S.|last3=Di Noia|first3=Javier|last4=Petersen-Mahrt|first4=Svend K.|date=2003-06|title=Immunity through DNA deamination|url=https://doi.org/10.1016/S0968-0004(03)00111-7|journal=Trends in Biochemical Sciences|volume=28|issue=6|pages=305–312|doi=10.1016/s0968-0004(03)00111-7|issn=0968-0004}}</ref>(図2)4位での脱アミノ化（および結果として生じる酸化）により、[[カルボニル基]]が生成され、シチジンからウリジンへの変化が起こる。


脱アミノ化活性は最終的に、プロウイルスDNAの「ホットスポット」でG→Aの超変異をもたらす。このような超変異は、最終的にウイルスの遺伝コードおよび複製能力を破壊し、結果として多くの不活化ウイルスをもたらす。<ref>{{Cite journal|last=Sadler|first=Holly A.|last2=Stenglein|first2=Mark D.|last3=Harris|first3=Reuben S.|last4=Mansky|first4=Louis M.|date=2010-07-15|title=APOBEC3G Contributes to HIV-1 Variation through Sublethal Mutagenesis|url=https://jvi.asm.org/content/84/14/7396|journal=Journal of Virology|volume=84|issue=14|pages=7396–7404|language=en|doi=10.1128/JVI.00056-10|issn=0022-538X|pmid=20463080|pmc=PMC2898230}}</ref> <ref name="pmid184992122">{{cite journal|date=July 2008|title=The HIV-1 Vif PPLP motif is necessary for human APOBEC3G binding and degradation|journal=Virology|volume=377|issue=1|pages=49–53|doi=10.1016/j.virol.2008.04.017|pmid=18499212|pmc=2474554|vauthors=Donahue JP, Vetter ML, Mukhtar NA, D'Aquila RT}}</ref>APOBEC3Gは、その活性部位が変異してもはやレトロウイルスDNAを変異誘導できなくなった場合には、抗ウイルス効果は激減する。<ref>{{Cite journal|last=Goila-Gaur|first=Ritu|last2=Strebel|first2=Klaus|date=2008-06-24|title=HIV-1 Vif, APOBEC, and Intrinsic Immunity|url=https://doi.org/10.1186/1742-4690-5-51|journal=Retrovirology|volume=5|issue=1|pages=51|doi=10.1186/1742-4690-5-51|issn=1742-4690|pmid=18577210|pmc=PMC2443170}}</ref>APOBEC3Gが介在する脱アミノ化は、変異した残基に引き付けられたDNA修復系によって、間接的にウイルスDNAの分解にもつながると、もともとは考えられていた。<ref name=":0">{{Cite journal|last=Guo|first=Fei|last2=Cen|first2=Shan|last3=Niu|first3=Meijuan|last4=Saadatmand|first4=Jenan|last5=Kleiman|first5=Lawrence|date=2006-12-01|title=<nowiki>Inhibition of \(\mathrm{tRNA}_{3}^{\mathrm{Lys}}\) -Primed Reverse Transcription by Human APOBEC3G during Human Immunodeficiency Virus Type 1 Replication</nowiki>|url=https://jvi.asm.org/content/80/23/11710|journal=Journal of Virology|volume=80|issue=23|pages=11710–11722|language=en|doi=10.1128/JVI.01038-06|issn=0022-538X|pmid=16971427|pmc=PMC1642613}}</ref>しかし、ヒトAPOBEC3Gは、DNA修復酵素[[:en:Uracil-DNA_glycosylase|UNG]]および[[:en:SMUG1|SMUG1]]とは独立してウイルスのcDNAレベルを低下させるため、この考えは誤りであると見なされるようになった<ref>{{Cite journal|last=Langlois|first=Marc-André|last2=Neuberger|first2=Michael S.|date=2008-05-01|title=Human APOBEC3G Can Restrict Retroviral Infection in Avian Cells and Acts Independently of both UNG and SMUG1|url=https://jvi.asm.org/content/82/9/4660|journal=Journal of Virology|volume=82|issue=9|pages=4660–4664|language=en|doi=10.1128/JVI.02469-07|issn=0022-538X|pmid=18272574|pmc=PMC2293047}}</ref>。
脱アミノ化活性は最終的に、プロウイルスDNAの「ホットスポット」でG→Aの超変異をもたらす。このような超変異は、最終的にウイルスの遺伝コードおよび複製能力を破壊し、結果として多くの不活化ウイルスをもたらす。<ref name=":4">{{Cite journal|last=Sadler|first=Holly A.|last2=Stenglein|first2=Mark D.|last3=Harris|first3=Reuben S.|last4=Mansky|first4=Louis M.|date=2010-07-15|title=APOBEC3G Contributes to HIV-1 Variation through Sublethal Mutagenesis|url=https://jvi.asm.org/content/84/14/7396|journal=Journal of Virology|volume=84|issue=14|pages=7396–7404|language=en|doi=10.1128/JVI.00056-10|issn=0022-538X|pmid=20463080|pmc=PMC2898230}}</ref> <ref name="pmid184992122">{{cite journal|date=July 2008|title=The HIV-1 Vif PPLP motif is necessary for human APOBEC3G binding and degradation|journal=Virology|volume=377|issue=1|pages=49–53|doi=10.1016/j.virol.2008.04.017|pmid=18499212|pmc=2474554|vauthors=Donahue JP, Vetter ML, Mukhtar NA, D'Aquila RT}}</ref>APOBEC3Gは、その活性部位が変異してもはやレトロウイルスDNAを変異誘導できなくなった場合には、抗ウイルス効果は激減する。<ref>{{Cite journal|last=Goila-Gaur|first=Ritu|last2=Strebel|first2=Klaus|date=2008-06-24|title=HIV-1 Vif, APOBEC, and Intrinsic Immunity|url=https://doi.org/10.1186/1742-4690-5-51|journal=Retrovirology|volume=5|issue=1|pages=51|doi=10.1186/1742-4690-5-51|issn=1742-4690|pmid=18577210|pmc=PMC2443170}}</ref>APOBEC3Gが介在する脱アミノ化は、変異した残基に引き付けられたDNA修復系によって、間接的にウイルスDNAの分解にもつながると、もともとは考えられていた。<ref name=":0">{{Cite journal|last=Guo|first=Fei|last2=Cen|first2=Shan|last3=Niu|first3=Meijuan|last4=Saadatmand|first4=Jenan|last5=Kleiman|first5=Lawrence|date=2006-12-01|title=<nowiki>Inhibition of \(\mathrm{tRNA}_{3}^{\mathrm{Lys}}\) -Primed Reverse Transcription by Human APOBEC3G during Human Immunodeficiency Virus Type 1 Replication</nowiki>|url=https://jvi.asm.org/content/80/23/11710|journal=Journal of Virology|volume=80|issue=23|pages=11710–11722|language=en|doi=10.1128/JVI.01038-06|issn=0022-538X|pmid=16971427|pmc=PMC1642613}}</ref>しかし、ヒトAPOBEC3Gは、DNA修復酵素[[:en:Uracil-DNA_glycosylase|UNG]]および[[:en:SMUG1|SMUG1]]とは独立してウイルスのcDNAレベルを低下させるため、この考えは誤りであると見なされるようになった<ref>{{Cite journal|last=Langlois|first=Marc-André|last2=Neuberger|first2=Michael S.|date=2008-05-01|title=Human APOBEC3G Can Restrict Retroviral Infection in Avian Cells and Acts Independently of both UNG and SMUG1|url=https://jvi.asm.org/content/82/9/4660|journal=Journal of Virology|volume=82|issue=9|pages=4660–4664|language=en|doi=10.1128/JVI.02469-07|issn=0022-538X|pmid=18272574|pmc=PMC2293047}}</ref>。


=== 逆転写への干渉 ===
=== 逆転写への干渉 ===
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== 生物学的機能 ==
== 生物学的機能 ==
[[File:Mechanisms_of_encapsidation.png|左|サムネイル|図3：HIV-1ビリオンにおけるAPOBEC3Gキャプシド形成の4つの提案されたメカニズム。ウイルスRNAとの相互作用およびGagタンパク質との相互作用を含むメカニズムは広く確認されています。 <ref name="pmid18597677">{{Cite journal|date=July 2008|title=APOBEC3G encapsidation into HIV-1 virions: which RNA is it?|journal=Retrovirology|volume=5|issue=55|pages=55|DOI=10.1186/1742-4690-5-55|PMID=18597677|PMC=2491656}}<cite class="citation journal cs1" data-ve-ignore="true" id="CITEREFStrebelKhan2008">Strebel K, Khan MA (July 2008). [//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2491656 "APOBEC3G encapsidation into HIV-1 virions: which RNA is it?"]. ''Retrovirology''. '''5''' (55): 55. [[デジタルオブジェクト識別子|doi]]:[[doi:10.1186/1742-4690-5-55|10.1186/1742-4690-5-55]]. [[PMC (アーカイブ)|PMC]]&nbsp;<span class="cs1-lock-free" title="Freely accessible">[//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2491656 2491656]</span>. [[PubMed|PMID]]&nbsp;[//pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18597677 18597677].</cite></ref>|リンク=Special:FilePath/Mechanisms_of_encapsidation.png]]APOBEC3G mRNA が発現している細胞はnon-permissive (非感染許容性)であり、HIV-1はVifの機能なしには正常に感染複製できない。APOBEC3Gを発現する非感染許容性細胞としては生理的環境下における初代[[CD4陽性T細胞]]と[[マクロファージ]]が挙げられる。<ref>{{Cite journal|author=Wissing S, Galloway NL, Greene WC|year=2010|title=HIV-1 Vif Versus the APOBEC3 Cytidine Deaminases: An Intracellular Duel Between Pathogen and Host Restriction Factors|journal=Molecular Aspects of Medicine|volume=31|page=383-397|PMID=18597677}}</ref> APOBEC3GのHIV-1粒子内取り込みはAPOBEC3Gの拡散と抗ウイルス作用の発揮のために肝要である。 APOBEC3Gのウイルス粒子内取り込み機序としては '''1.''' APOBEC3Gの非特異的パッケージング、 '''2.''' APOBEC3Gと宿主RNAとの相互作用、 '''3.''' APOBEC3GとウイルスRNAとの相互作用、 '''4.''' APOBEC3G HIV-1 Gag蛋白との相互作用などが考えられるが、実験的に強く支持されるのは後者2つである。<ref name="pmid18597677" />
[[File:Mechanisms_of_encapsidation.png|左|サムネイル|図3：HIV-1ビリオンにおけるAPOBEC3Gキャプシド形成の4つの提案されたメカニズム。ウイルスRNAとの相互作用およびGagタンパク質との相互作用を含むメカニズムは広く確認されています。 <ref name="pmid18597677">{{Cite journal|date=July 2008|title=APOBEC3G encapsidation into HIV-1 virions: which RNA is it?|journal=Retrovirology|volume=5|issue=55|pages=55|DOI=10.1186/1742-4690-5-55|PMID=18597677|PMC=2491656}}<cite class="citation journal cs1" data-ve-ignore="true" id="CITEREFStrebelKhan2008">Strebel K, Khan MA (July 2008). [//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2491656 "APOBEC3G encapsidation into HIV-1 virions: which RNA is it?"]. ''Retrovirology''. '''5''' (55): 55. [[デジタルオブジェクト識別子|doi]]:[[doi:10.1186/1742-4690-5-55|10.1186/1742-4690-5-55]]. [[PMC (アーカイブ)|PMC]]&nbsp;<span class="cs1-lock-free" title="Freely accessible">[//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2491656 2491656]</span>. [[PubMed|PMID]]&nbsp;[//pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18597677 18597677].</cite></ref>|リンク=Special:FilePath/Mechanisms_of_encapsidation.png]]APOBEC3G mRNA が発現している細胞はnon-permissive (非感染許容性)であり、HIV-1はVifの機能なしには正常に感染複製できない。APOBEC3Gを発現する非感染許容性細胞としては生理的環境下における初代[[CD4陽性T細胞]]と[[マクロファージ]]が挙げられる。<ref name=":5">{{Cite journal|author=Wissing S, Galloway NL, Greene WC|year=2010|title=HIV-1 Vif Versus the APOBEC3 Cytidine Deaminases: An Intracellular Duel Between Pathogen and Host Restriction Factors|journal=Molecular Aspects of Medicine|volume=31|page=383-397|PMID=18597677}}</ref> APOBEC3GのHIV-1粒子内取り込みはAPOBEC3Gの拡散と抗ウイルス作用の発揮のために肝要である。 APOBEC3Gのウイルス粒子内取り込み機序としては '''1.''' APOBEC3Gの非特異的パッケージング、 '''2.''' APOBEC3Gと宿主RNAとの相互作用、 '''3.''' APOBEC3GとウイルスRNAとの相互作用、 '''4.''' APOBEC3G HIV-1 Gag蛋白との相互作用などが考えられるが、実験的に強く支持されるのは後者2つである。<ref name="pmid18597677" />


ウイルス粒子へのAPOBEC3G取り込み量はウイルス産生細胞内でのAPOBEC3G発現レベルに依存する。ある[[末梢血単核球]]を用いた研究においては、Vif非存在下におけるAPOBEC3G取り込み量はウイルス粒子当たり平均7分子であり、それはHIV複製を阻止しうる量であった。<ref>{{Cite journal|author=Xu H, Chertova E, Chen J, Ott DE, Roser JD, Hu WS, Pathak VK|year=2007|title=Stoichiometry of the antiviral protein APOBEC3G in HIV-1 virions|journal=Virology|volume=360|page=247-256|PMID=17126871}}</ref>
ウイルス粒子へのAPOBEC3G取り込み量はウイルス産生細胞内でのAPOBEC3G発現レベルに依存する。ある[[末梢血単核球]]を用いた研究においては、Vif非存在下におけるAPOBEC3G取り込み量はウイルス粒子当たり平均7分子であり、それはHIV複製を阻止しうる量であった。<ref>{{Cite journal|author=Xu H, Chertova E, Chen J, Ott DE, Roser JD, Hu WS, Pathak VK|year=2007|title=Stoichiometry of the antiviral protein APOBEC3G in HIV-1 virions|journal=Virology|volume=360|page=247-256|PMID=17126871}}</ref>
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== 疾患との関連性 ==
== 疾患との関連性 ==
APOBEC3G は非感染許容性細胞におけるHIV-1複製と感染性の重要な阻害因子であるが、VifがAPOBEC3Gの抗ウイルス機能を阻害し、APOBEC3Gが発現している細胞においても感染性HIV-1粒子の形成を可能にしている。<ref name=":5" /><ref>{{Cite journal|author=Goncalves J, Santa-Marta M|year=2004|title=HIV-1 Vif and APOBEC3G: Multiple roads to one goal|journal=Retrovirology|volume=1|page=28|PMID=15383144}}</ref>Vifは他のあらゆるHIV-1蛋白から独立して機能し、単独でAPOBEC3GのHIV-1粒子内取り込みを防いでいる。<ref name=":6">{{Cite journal|author=Pillai SK, Wong JK, Barbour JD|year=2008|title=Turning up the volume on mutational pressure: Is more of a good thing always better? (A case study of HIV-1 Vif and APOBEC3)|journal=Retrovirology|volume=5|page=26|PMID=18339206}}</ref>

APOBEC3Gは一般にHIV-1に対する抗ウイルス因子として研究されてきているが、一部の最近の研究はAPOBEC3Gが誘導する変異がHIV-1の感染伝播の成立を助けている可能性を見いだしている。まず、APOBEC3Gの標的DNA領域において脱アミノ化される塩基数は1塩基から多数塩基まで様々であるが、APOBEC3Gに曝露される時間に依存する可能性がある。<ref name=":4" /> さらに、細胞内APOBEC3G濃度とウイルス超変異の程度との相関が報告されている。<ref name=":6" /> APOBEC3Gにより変異導入されたHIV-1プロウイルスの中には、ホットスポットおける変異数が少ないために感染性を失わずに生き残るものもあり、またAPOBEC3Gにより致命的変異を受けたプロウイルスと感染性のプロウイルスとの間の組換えが生じることにより生き残るものもある。<ref>{{Cite journal|author=Mulder LC, Harari A, Simon V|year=2008|title=Cytidine deamination induced HIV-1 drug resistance|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|volume=105|page=5501-5506|PMID=18391217}}</ref> その様なウイルス不活化に至らない程度の変異は逆にHIV-1全体の遺伝的多様性に貢献することになるため、APOBEC3Gが実はHIV-1の環境適応と感染伝播を促進している可能性が示されている。


== 出典 ==
== 出典 ==

2021年2月21日 (日) 06:30時点における版

APOBEC3G
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

2JYW, 2KBO, 2KEM, 3E1U, 3IQS, 3IR2, 3V4J, 3V4K, 4ROV, 4ROW

識別子
記号APOBEC3G, A3G, ARCD, ARP-9, ARP9, CEM-15, CEM15, MDS019, bK150C2.7, dJ494G10.1, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G
外部IDOMIM: 607113 MGI: 1933111 HomoloGene: 128348 GeneCards: APOBEC3G
遺伝子の位置 (マウス)
15番染色体 (マウス)
染色体15番染色体 (マウス)[1]
15番染色体 (マウス)
APOBEC3G遺伝子の位置
APOBEC3G遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点79,775,860 bp[1]
終点79,800,107 bp[1]
遺伝子オントロジー
分子機能• protein homodimerization activity
• cytidine deaminase activity
• 血漿タンパク結合
• 触媒活性
• 加水分解酵素活性
• hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines
• 金属イオン結合
• deoxycytidine deaminase activity
• RNA結合
• zinc ion binding
• dCTP deaminase activity
• identical protein binding
細胞の構成要素• 細胞核
• apolipoprotein B mRNA editing enzyme complex
• 細胞質基質
• 細胞質
• Pボディ
• リボ核タンパク質
生物学的プロセス• cytidine deamination
• negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate
• negative regulation of transposition
• base conversion or substitution editing
• 免疫系プロセス
• DNA cytosine deamination
• positive regulation of defense response to virus by host
• negative regulation of viral genome replication
• negative regulation of viral process
• defense response to virus
• 自然免疫
• viral process
• cytidine to uridine editing
• DNA脱メチル化
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種ヒトマウス
Entrez

60489

80287

Ensembl

ENSG00000239713

ENSMUSG00000009585

UniProt

Q9HC16

Q99J72

RefSeq
(mRNA)

NM_021822

NM_001160415
NM_030255
NM_001347041

RefSeq
(タンパク質)

NP_068594
NP_001336365
NP_001336366
NP_001336367

NP_001153887
NP_001333970
NP_084531

場所
(UCSC)		n/aChr : 79.78 – 79.8 Mb
PubMed検索[2][3]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

APOBEC3G （アポリポプロテインB mRNA編集酵素、触媒ポリペプチド様3G APOBEC3G(apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3G) は、ヒトのAPOBEC3G遺伝子によってコードされる酵素であり、APOBECファミリー蛋白の一種である[4]。APOBECファミリー蛋白は、自然免疫において重要な役割を果たすことが示唆されている[5]。APOBEC3Gはシチジンデアミナーゼの一種であり、一本鎖DNAに作用してシチジンをウリジンに変換(脱アミノ化)する反応を触媒する。APOBEC3GのC末端ドメインが触媒活性を付与しているが、これはNMR(核磁気共鳴)および結晶構造が基質特異性や触媒活性を示していることからも分かる[6][7][8][9][10][11][12][13]。

APOBEC3Gは、ウイルス複製を阻害することにより、レトロウイルス(特にHIV)に対して自然免疫活性を示す。しかし、HIVなどのレンチウイルスは、この影響を打ち消すためにウイルス感染因子タンパク質（Vif）を進化させた。VifはAPOBEC3Gと相互作用し、プロテアソームを介したAPOBEC3Gのユビキチン化と分解を引き起こす[14]。一方、フォーミーウイルスは、アクセサリータンパク質のBet（P89873）を産生するが、それはAPOBEC3Gの細胞質溶解性を阻害する性質を持つ[15]。BetとVifは異なる分子機序であるがAPOBEC3Gを抑制するという点は同じである。そのため、フォーミーウイルスのBet遺伝子をVif遺伝子に置き換えたウイルスを作成すると、Betの代わりにVIfが働き、APOBEC3を抑制し、組み換えウイルスは感染複製能を維持する[16]。

発見

APOBEC3Gは2002年にJarmuzらによって初めて発見され、[17]22番染色体上のタンパク質APOBEC3A～Gのファミリーの仲間であることがわかった。その後ウイルスアクセサリータンパク質Vifを欠くHIV-1の複製を制限することができる細胞因子であると分かった。そしてその後すぐに、APOBEC3GはシチジンデアミナーゼのAPOBEC1との相同性が認められたため、同じAPOBECファミリー蛋白の仲間であることが明らかとなった。

構造

ファイル:N-terminal catalytic domain.jpg
図1：「[APOBEC3G]のN末端[触媒デアミナーゼドメイン]の構造モデル。亜鉛配位残基は円で示され、α-ヘリックスは黄色で、β-ストランドはピンクで示されています。残基D128の位置は、β4とα3の間の予測ループに示されています。」 [18]

APOBEC3Gは対称構造を持っており、2つの相同な触媒領域、すなわちN末端領域（CD1）とC末端領域（CD2）がある。CD1、CD2のそれぞれに亜鉛イオンが含まれている。[19]また、各領域は、シチジンデアミナーゼの典型的なHis / Cys-X-Glu-X23–28-Pro-Cys-X2-Cysモチーフを有している。しかし、典型的なシチジンデアミナーゼとは異なり、APOBEC3Gは触媒内の2つのベータシートの間に固有のアルファヘリックスを有している。このアルファヘリックスが補酵素結合部位となり得る。[20](図1)

CD2は触媒的としてアクティブであり、脱アミノ化と基質結合部位(モチーフ)の構造的特異性に不可欠である。CD1は触媒として非アクティブであるが、DNAおよびRNAへの結合にとって非常に重要であり、APOBEC3G脱アミノ化の5 '→ 3'の処理能力の原動力である。[21]また、CD2はCD1が存在しないとデアミナーゼ活性を持たない。[22]

生体内のAPOBEC3Gは、単量体、2量体、3量体、4量体、および高次のオリゴマーで構成されている。APOBEC3Gは2量体として機能すると考えられているが、実際には単量体とオリゴマーの混合物として機能する可能性がある。[21]


APOBEC3Gの128番目のアミノ酸残基はD(アスパラギン酸)であり、CD1 (図1)に含まれる。これが K (リシン)に変異 (D128K) した APOBEC3G が Vifによる変性を免れることが分かっており、両者の相互作用において特に重要であるらしい。[23][24]さらに、APOBEC3Gのアミノ酸残基128は、負に帯電したモチーフを形成する。そのモチーフはVifとの相互作用およびAPOBEC3G-Vif複合体の形成に重要である。また、残基124-127は、APOBEC3GのHIV-1粒子内への取り込みおよびその結果として生じる抗レトロウイルス活性にとって重要である[25]。

作用機序

APOBEC3Gは広く研究されており、HIV-1複製に悪影響を及ぼすいくつかのメカニズムが同定されている。

シチジンの脱アミノ化と超変異

ファイル:Predicted Mechanism of deamination.jpg
図2：「ピリミジン環の4位での直接求核攻撃によるシチジン脱アミノ化のメカニズム。このメカニズムは、APOBEC1およびヌクレオチドまたはZn2 +結合領域の近くの活性化誘導デアミナーゼ（AID）との相同性を示す酵素である細菌のシチジンデアミナーゼに対して提案されています。 [26] 」 [27] APOBEC3GはAIDとして機能し、APOBEC1と同様にAPOBECスーパーファミリーのメンバーであるため、同様のメカニズムがシチジン脱アミノ化のためにAPOBEC3Gによって媒介される可能性があります。

APOBEC3Gおよび同じファミリーの他のタンパク質は、活性化誘導（シチジン）デアミナーゼ（AID）として機能できる。APOBEC3Gが逆転写を阻害する機序はHIV DNAへの無数のデオキシシチジンからデオキシウリジンへの変異誘導によるもであるが、この反応は主に相補的DNA(cDNA)の形で発現されるHIV DNAのマイナス鎖に対して3’→5’方向に起こる。[28]APOBEC3GはAPOBECスーパーファミリーに属しており、AIDとして機能するため、シチジン脱アミノ化のためにAPOBEC3Gによって媒介されるメカニズムは、大腸菌のシチジンデアミナーゼのメカニズムと類似しうる。大腸菌のシチジンデアミナーゼはヌクレオチドと亜鉛結合領域周辺でAPOBEC1やAIDと高い相同性を持つことが知られている。現在予測されてる脱アミノ化反応の機序は、亜鉛配位酵素によるシチジンピリミジン環の4位への直接求核的な攻撃によって引き起こされるものである。水は、水素原子とヒドロキシル基ドナーの両方の供給源として必要である。[29](図2)4位での脱アミノ化（および結果として生じる酸化）により、カルボニル基が生成され、シチジンからウリジンへの変化が起こる。

脱アミノ化活性は最終的に、プロウイルスDNAの「ホットスポット」でG→Aの超変異をもたらす。このような超変異は、最終的にウイルスの遺伝コードおよび複製能力を破壊し、結果として多くの不活化ウイルスをもたらす。[30] [31]APOBEC3Gは、その活性部位が変異してもはやレトロウイルスDNAを変異誘導できなくなった場合には、抗ウイルス効果は激減する。[32]APOBEC3Gが介在する脱アミノ化は、変異した残基に引き付けられたDNA修復系によって、間接的にウイルスDNAの分解にもつながると、もともとは考えられていた。[33]しかし、ヒトAPOBEC3Gは、DNA修復酵素UNGおよびSMUG1とは独立してウイルスのcDNAレベルを低下させるため、この考えは誤りであると見なされるようになった[34]。

逆転写への干渉

APOBEC3GはDNA脱アミノ化とは無関係にHIV-1の逆転写を阻害する。tRNA 3Lysは通常、HIV-1のプライマーに結合して逆転写を開始する。APOBEC3GはtRNA3Lysのプライミングを阻害し、それによってウイルスのssDNA産生およびウイルス感染を妨げることができる。[35]逆転写は、APOBEC3GがウイルスRNAに結合し、立体変化を引き起こすことによっても悪影響を受けると予測されている[36]。

ウイルスDNA統合への干渉

APOBEC3Gは、機能的な触媒領域とデアミナーゼ活性に依存する形で、ウイルスDNAの宿主ゲノムへの組み込みの干渉と関連していた。Mbisaらは、APOBEC3GがDNAマイナス鎖からのプライマーtRNAの処理と除去を妨害し、その結果として異常なウイルスの3' LTR（long terminal repeat）DNA末端につながることを発見した。これらのウイルスDNA末端は、統合やプラス鎖DNA転移をするのには非効率的な基質である。その結果、HIV-1プロウイルスの形成が阻害される[37]。

生物学的機能

図3：HIV-1ビリオンにおけるAPOBEC3Gキャプシド形成の4つの提案されたメカニズム。ウイルスRNAとの相互作用およびGagタンパク質との相互作用を含むメカニズムは広く確認されています。 [27]

APOBEC3G mRNA が発現している細胞はnon-permissive (非感染許容性)であり、HIV-1はVifの機能なしには正常に感染複製できない。APOBEC3Gを発現する非感染許容性細胞としては生理的環境下における初代CD4陽性T細胞とマクロファージが挙げられる。[38] APOBEC3GのHIV-1粒子内取り込みはAPOBEC3Gの拡散と抗ウイルス作用の発揮のために肝要である。 APOBEC3Gのウイルス粒子内取り込み機序としては 1. APOBEC3Gの非特異的パッケージング、 2. APOBEC3Gと宿主RNAとの相互作用、 3. APOBEC3GとウイルスRNAとの相互作用、 4. APOBEC3G HIV-1 Gag蛋白との相互作用などが考えられるが、実験的に強く支持されるのは後者2つである。[27]

ウイルス粒子へのAPOBEC3G取り込み量はウイルス産生細胞内でのAPOBEC3G発現レベルに依存する。ある末梢血単核球を用いた研究においては、Vif非存在下におけるAPOBEC3G取り込み量はウイルス粒子当たり平均7分子であり、それはHIV複製を阻止しうる量であった。[39]

APOBEC3Gの役割は外因性レトロウイルスの複製阻害にとどまらず、ヒト内在性レトロウイルスにも作用しうることが、内在性レトロウイルスのDNA配列に残る超変異の形跡から分かる。[40][41]

疾患との関連性

APOBEC3G は非感染許容性細胞におけるHIV-1複製と感染性の重要な阻害因子であるが、VifがAPOBEC3Gの抗ウイルス機能を阻害し、APOBEC3Gが発現している細胞においても感染性HIV-1粒子の形成を可能にしている。[38][42]Vifは他のあらゆるHIV-1蛋白から独立して機能し、単独でAPOBEC3GのHIV-1粒子内取り込みを防いでいる。[43]

APOBEC3Gは一般にHIV-1に対する抗ウイルス因子として研究されてきているが、一部の最近の研究はAPOBEC3Gが誘導する変異がHIV-1の感染伝播の成立を助けている可能性を見いだしている。まず、APOBEC3Gの標的DNA領域において脱アミノ化される塩基数は1塩基から多数塩基まで様々であるが、APOBEC3Gに曝露される時間に依存する可能性がある。[30] さらに、細胞内APOBEC3G濃度とウイルス超変異の程度との相関が報告されている。[43] APOBEC3Gにより変異導入されたHIV-1プロウイルスの中には、ホットスポットおける変異数が少ないために感染性を失わずに生き残るものもあり、またAPOBEC3Gにより致命的変異を受けたプロウイルスと感染性のプロウイルスとの間の組換えが生じることにより生き残るものもある。[44] その様なウイルス不活化に至らない程度の変異は逆にHIV-1全体の遺伝的多様性に貢献することになるため、APOBEC3Gが実はHIV-1の環境適応と感染伝播を促進している可能性が示されている。

出典

  1. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009585 - Ensembl, May 2017
  2. ^ Human PubMed Reference:
  3. ^ Mouse PubMed Reference:
  4. ^ “Isolation of a human gene that inhibits HIV-1 infection and is suppressed by the viral Vif protein”. Nature 418 (6898): 646–50. (August 2002). Bibcode: 2002Natur.418..646S. doi:10.1038/nature00939. PMID 12167863. 
  5. ^ 高折晃史「APOBEC3ファミリー蛋白」『ウイルス』第55巻第2号、2005年12月、267–72頁、doi:10.2222/jsv.55.267、PMID 16557012。 
  6. ^ “Structural features of antiviral DNA cytidine deaminases”. Biological Chemistry 394 (11): 1357–70. (November 2013). doi:10.1515/hsz-2013-0165. PMID 23787464. http://juser.fz-juelich.de/record/139785/files/FZJ-2013-05757.pdf. 
  7. ^ “Structure of the DNA deaminase domain of the HIV-1 restriction factor APOBEC3G”. Nature 452 (7183): 116–9. (March 2008). Bibcode: 2008Natur.452..116C. doi:10.1038/nature06638. PMID 18288108. 
  8. ^ “Crystal structure of the APOBEC3G catalytic domain reveals potential oligomerization interfaces”. Structure 18 (1): 28–38. (January 2010). doi:10.1016/j.str.2009.10.016. PMC 2913127. PMID 20152150. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2913127/. 
  9. ^ “Crystal structure of the anti-viral APOBEC3G catalytic domain and functional implications”. Nature 456 (7218): 121–4. (November 2008). Bibcode: 2008Natur.456..121H. doi:10.1038/nature07357. PMC 2714533. PMID 18849968. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2714533/. 
  10. ^ “Structure, interaction and real-time monitoring of the enzymatic reaction of wild-type APOBEC3G”. The EMBO Journal 28 (4): 440–51. (February 2009). doi:10.1038/emboj.2008.290. PMC 2646150. PMID 19153609. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2646150/. 
  11. ^ “An extended structure of the APOBEC3G catalytic domain suggests a unique holoenzyme model”. Journal of Molecular Biology 389 (5): 819–32. (June 2009). doi:10.1016/j.jmb.2009.04.031. PMC 2700007. PMID 19389408. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2700007/. 
  12. ^ “First-in-class small molecule inhibitors of the single-strand DNA cytosine deaminase APOBEC3G”. ACS Chemical Biology 7 (3): 506–17. (March 2012). doi:10.1021/cb200440y. PMC 3306499. PMID 22181350. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3306499/. 
  13. ^ “Retroviral restriction by APOBEC proteins”. Nature Reviews. Immunology 4 (11): 868–77. (November 2004). doi:10.1038/nri1489. PMID 15516966. 
  14. ^ “The HIV-1 Vif PPLP motif is necessary for human APOBEC3G binding and degradation”. Virology 377 (1): 49–53. (July 2008). doi:10.1016/j.virol.2008.04.017. PMC 2474554. PMID 18499212. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2474554/. 
  15. ^ “Prototype foamy virus Bet impairs the dimerization and cytosolic solubility of human APOBEC3G”. Journal of Virology 87 (16): 9030–40. (August 2013). doi:10.1128/JVI.03385-12. PMC 3754047. PMID 23760237. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3754047/. 
  16. ^ “Replacement of feline foamy virus bet by feline immunodeficiency virus vif yields replicative virus with novel vaccine candidate potential”. Retrovirology 15 (1): 38. (May 2018). doi:10.1186/s12977-018-0419-0. PMC 5956581. PMID 29769087. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5956581/. 
  17. ^ Jarmuz, Adam; Chester, Ann; Bayliss, Jayne; Gisbourne, Jane; Dunham, Ian; Scott, James; Navaratnam, Naveenan (2002-03-01). “An Anthropoid-Specific Locus of Orphan C to U RNA-Editing Enzymes on Chromosome 22” (英語). Genomics 79 (3): 285–296. doi:10.1006/geno.2002.6718. ISSN 0888-7543. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754302967182. 
  18. ^ “Identification of amino acid residues in APOBEC3G required for regulation by human immunodeficiency virus type 1 Vif and Virion encapsidation”. Journal of Virology 81 (8): 3807–15. (April 2007). doi:10.1128/JVI.02795-06. PMC 1866099. PMID 17267497. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1866099/. 
  19. ^ Greene, Warner C.; Debyser, Zeger; Ikeda, Yasuhiro; Freed, Eric O.; Stephens, Edward; Yonemoto, Wes; Buckheit, Robert W.; Esté, José A. et al. (2008-12-01). “Novel targets for HIV therapy” (英語). Antiviral Research 80 (3): 251–265. doi:10.1016/j.antiviral.2008.08.003. ISSN 0166-3542. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166354208003823. 
  20. ^ “Cytidine deamination and resistance to retroviral infection: towards a structural understanding of the APOBEC proteins” (英語). Virology 334 (2): 147–153. (2005-04-10). doi:10.1016/j.virol.2005.01.038. ISSN 0042-6822. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0042682205000693. 
  21. ^ a b Chelico, Linda; Prochnow, Courtney; Erie, Dorothy A.; Chen, Xiaojiang S.; Goodman, Myron F. (2010-05). “Structural Model for Deoxycytidine Deamination Mechanisms of the HIV-1 Inactivation Enzyme APOBEC3G”. Journal of Biological Chemistry 285 (21): 16195–16205. doi:10.1074/jbc.m110.107987. ISSN 0021-9258. PMC PMC2871487. PMID 20212048. https://doi.org/10.1074/jbc.M110.107987. 
  22. ^ Li X, Ma J, Zhang Q, Zhou J, Yin X, Zhai C, et al. (2011-06-05). “Functional analysis of the two cytidine deaminase domains in APOBEC3G” (英語). Virology 414 (2): 130–136. doi:10.1016/j.virol.2011.03.014. ISSN 0042-6822. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0042682211001395. 
  23. ^ Mariani, Roberto; Chen, Darlene; Schröfelbauer, Bärbel; Navarro, Francisco; König, Renate; Bollman, Brooke; Münk, Carsten; Nymark-McMahon, Henrietta et al. (2003-07). “Species-Specific Exclusion of APOBEC3G from HIV-1 Virions by Vif”. Cell 114 (1): 21–31. doi:10.1016/s0092-8674(03)00515-4. ISSN 0092-8674. https://doi.org/10.1016/S0092-8674(03)00515-4. 
  24. ^ Xu, Hongzhan; Svarovskaia, Evguenia S.; Barr, Rebekah; Zhang, Yijun; Khan, Mohammad A.; Strebel, Klaus; Pathak, Vinay K. (2004-04-13). “A single amino acid substitution in human APOBEC3G antiretroviral enzyme confers resistance to HIV-1 virion infectivity factor-induced depletion” (英語). Proceedings of the National Academy of Sciences 101 (15): 5652–5657. doi:10.1073/pnas.0400830101. ISSN 0027-8424. PMC PMC397464. PMID 15054139. https://www.pnas.org/content/101/15/5652. 
  25. ^ Huthoff, Hendrik; Malim, Michael H. (2007-04-15). “Identification of Amino Acid Residues in APOBEC3G Required for Regulation by Human Immunodeficiency Virus Type 1 Vif and Virion Encapsidation” (英語). Journal of Virology 81 (8): 3807–3815. doi:10.1128/JVI.02795-06. ISSN 0022-538X. PMC PMC1866099. PMID 17267497. https://jvi.asm.org/content/81/8/3807. 
  26. ^ “Retroviral restriction by APOBEC proteins”. Nature Reviews. Immunology 4 (11): 868–77. (November 2004). doi:10.1038/nri1489. PMID 15516966. 
  27. ^ a b c Strebel K, Khan MA (July 2008). “APOBEC3G encapsidation into HIV-1 virions: which RNA is it?”. Retrovirology 5 (55): 55. doi:10.1186/1742-4690-5-55. PMC 2491656. PMID 18597677. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2491656/.  引用エラー: 無効な <ref> タグ; name "pmid18597677"が異なる内容で複数回定義されています
  28. ^ Mbisa, Jean L.; Barr, Rebekah; Thomas, James A.; Vandegraaff, Nick; Dorweiler, Irene J.; Svarovskaia, Evguenia S.; Brown, William L.; Mansky, Louis M. et al. (2007-07-01). “Human Immunodeficiency Virus Type 1 cDNAs Produced in the Presence of APOBEC3G Exhibit Defects in Plus-Strand DNA Transfer and Integration” (英語). Journal of Virology 81 (13): 7099–7110. doi:10.1128/JVI.00272-07. ISSN 0022-538X. PMC PMC1933301. PMID 17428871. https://jvi.asm.org/content/81/13/7099. 
  29. ^ Neuberger, Michael S.; Harris, Reuben S.; Di Noia, Javier; Petersen-Mahrt, Svend K. (2003-06). “Immunity through DNA deamination”. Trends in Biochemical Sciences 28 (6): 305–312. doi:10.1016/s0968-0004(03)00111-7. ISSN 0968-0004. https://doi.org/10.1016/S0968-0004(03)00111-7. 
  30. ^ a b Sadler, Holly A.; Stenglein, Mark D.; Harris, Reuben S.; Mansky, Louis M. (2010-07-15). “APOBEC3G Contributes to HIV-1 Variation through Sublethal Mutagenesis” (英語). Journal of Virology 84 (14): 7396–7404. doi:10.1128/JVI.00056-10. ISSN 0022-538X. PMC PMC2898230. PMID 20463080. https://jvi.asm.org/content/84/14/7396. 
  31. ^ “The HIV-1 Vif PPLP motif is necessary for human APOBEC3G binding and degradation”. Virology 377 (1): 49–53. (July 2008). doi:10.1016/j.virol.2008.04.017. PMC 2474554. PMID 18499212. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2474554/. 
  32. ^ Goila-Gaur, Ritu; Strebel, Klaus (2008-06-24). “HIV-1 Vif, APOBEC, and Intrinsic Immunity”. Retrovirology 5 (1): 51. doi:10.1186/1742-4690-5-51. ISSN 1742-4690. PMC PMC2443170. PMID 18577210. https://doi.org/10.1186/1742-4690-5-51. 
  33. ^ Guo, Fei; Cen, Shan; Niu, Meijuan; Saadatmand, Jenan; Kleiman, Lawrence (2006-12-01). “Inhibition of \(\mathrm{tRNA}_{3}^{\mathrm{Lys}}\) -Primed Reverse Transcription by Human APOBEC3G during Human Immunodeficiency Virus Type 1 Replication” (英語). Journal of Virology 80 (23): 11710–11722. doi:10.1128/JVI.01038-06. ISSN 0022-538X. PMC PMC1642613. PMID 16971427. https://jvi.asm.org/content/80/23/11710. 
  34. ^ Langlois, Marc-André; Neuberger, Michael S. (2008-05-01). “Human APOBEC3G Can Restrict Retroviral Infection in Avian Cells and Acts Independently of both UNG and SMUG1” (英語). Journal of Virology 82 (9): 4660–4664. doi:10.1128/JVI.02469-07. ISSN 0022-538X. PMC PMC2293047. PMID 18272574. https://jvi.asm.org/content/82/9/4660. 
  35. ^ Guo, Fei; Cen, Shan; Niu, Meijuan; Saadatmand, Jenan; Kleiman, Lawrence (2006-12-01). “Inhibition of \(\mathrm{tRNA}_{3}^{\mathrm{Lys}}\) -Primed Reverse Transcription by Human APOBEC3G during Human Immunodeficiency Virus Type 1 Replication” (英語). Journal of Virology 80 (23): 11710–11722. doi:10.1128/JVI.01038-06. ISSN 0022-538X. PMC PMC1642613. PMID 16971427. https://jvi.asm.org/content/80/23/11710. 
  36. ^ “Cytidine deamination and resistance to retroviral infection: towards a structural understanding of the APOBEC proteins” (英語). Virology 334 (2): 147–153. (2005-04-10). doi:10.1016/j.virol.2005.01.038. ISSN 0042-6822. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0042682205000693. 
  37. ^ Neuberger, Michael S.; Harris, Reuben S.; Di Noia, Javier; Petersen-Mahrt, Svend K. (2003-06). “Immunity through DNA deamination”. Trends in Biochemical Sciences 28 (6): 305–312. doi:10.1016/s0968-0004(03)00111-7. ISSN 0968-0004. https://doi.org/10.1016/S0968-0004(03)00111-7. 
  38. ^ a b Wissing S, Galloway NL, Greene WC (2010). “HIV-1 Vif Versus the APOBEC3 Cytidine Deaminases: An Intracellular Duel Between Pathogen and Host Restriction Factors”. Molecular Aspects of Medicine 31: 383-397. PMID 18597677. 
  39. ^ Xu H, Chertova E, Chen J, Ott DE, Roser JD, Hu WS, Pathak VK (2007). “Stoichiometry of the antiviral protein APOBEC3G in HIV-1 virions”. Virology 360: 247-256. PMID 17126871. 
  40. ^ Armitage AE, Katzourakis A, de Oliveira T, Welch JJ, Belshaw R, Bishop KN, et al. (2008). “Conserved Footprints of APOBEC3G on Hypermutated Human Immunodeficiency Virus Type 1 and Human Endogenous Retrovirus HERV-K(HML2) Sequences”. Journal of Virology 82: 8743-8761. PMID 18562517. 
  41. ^ Lee YN, Malim MH, Bieniasz PD (2008). “Hypermutation of an Ancient Human Retrovirus by APOBEC3G”. Journal of Virology 82: 8762–8770. PMID 15383144. 
  42. ^ Goncalves J, Santa-Marta M (2004). “HIV-1 Vif and APOBEC3G: Multiple roads to one goal”. Retrovirology 1: 28. PMID 15383144. 
  43. ^ a b Pillai SK, Wong JK, Barbour JD (2008). “Turning up the volume on mutational pressure: Is more of a good thing always better? (A case study of HIV-1 Vif and APOBEC3)”. Retrovirology 5: 26. PMID 18339206. 
  44. ^ Mulder LC, Harari A, Simon V (2008). “Cytidine deamination induced HIV-1 drug resistance”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 105: 5501-5506. PMID 18391217. 

外部リンク

参考文献

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