「遺伝子オントロジー」の版間の差分
削除された内容 追加された内容
m ロボットによる 追加: ru:Генная Онтология |
|||
29行目: | 29行目: | ||
[[en:Gene Ontology]] |
[[en:Gene Ontology]] |
||
[[es:Ontología Génica]] |
[[es:Ontología Génica]] |
||
[[ru:Генная Онтология]] |
|||
[[zh:基因本体]] |
[[zh:基因本体]] |
2009年7月22日 (水) 18:35時点における版
遺伝子オントロジー(いでんしオントロジー、Gene Ontology; GO) とは、生物学的概念を記述するための、共通の語彙を策定しようとするプロジェクトである。
1990年代後半から、生物学における実験手法の革新(DNAシーケンサーやDNAマイクロアレイなど)や、バイオインフォマティクス的手法の発達により、様々な種の遺伝子関連情報がデータベース化されている。これらに蓄積された情報を有効に活用するためには、統一された語彙を用いて、機能情報などを記述する必要がある。統一された語彙を用いることで、異なった機関によって作成されたデータベース、更に異なった生物種のデータベース間で、データの結合や、横断比較を行うことが可能になる。
実際のデータ
GOで定義された用語は、GO Termと呼ばれる。Go Termは三つのカテゴリーに分かれる。
- biological process (生物学的プロセス)
- cellular component (細胞の構成要素)
- molecular function (分子機能)
計算機上でGOのデータは、非循環有向グラフ (Directed Acyclic Graph: DAG) と呼ばれるデータ構造を用いて記述することができる。DAGの性質上、非常にXMLとの親和性が高いため、アノテーションと共にXML-RDFフォーマットでも提供されている。