Nkx2.5

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NKX2-5
PDBに登録されている構造
PDB オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子
記号 NKX2-5, CHNG5, CSX, CSX1, HLHS2, NKX2.5, NKX2E, NKX4-1, VSD3, NK2 homeobox 5
外部ID MGI: 97350 HomoloGene: 3230 GeneCards: NKX2-5
遺伝子の位置 (ヒト)
5番染色体 (ヒト)
染色体 5番染色体 (ヒト)[1]
5番染色体 (ヒト)
NKX2-5遺伝子の位置
NKX2-5遺伝子の位置
バンド データ無し 開始点 173,232,109 bp[1]
終点 173,235,357 bp[1]
RNA発現パターン
PBB GE NKX2-5 206578 at fs.png
さらなる参照発現データ
オルソログ
ヒト マウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_004387
NM_001166175
NM_001166176

NM_008700

RefSeq
(タンパク質)

NP_001159647
NP_001159648
NP_004378

NP_032726

場所
(UCSC)
Chr 5: 173.23 – 173.24 Mb Chr 5: 26.84 – 26.84 Mb
PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト 閲覧/編集 マウス

Nkx2.5またはNkx2-5NK-2 transcription factor related, locus 5)はホメオボックス配列を持ち、NK-2ファミリーに属する転写因子の1つで、心臓の発生に大きく関わっている。Csxcardiac-specific homeobox)とも呼ばれる。発生初期の心筋前駆細胞に発現するとともに、出生後から成体に至るまで心筋細胞に発現が認められる。NK-2ファミリーの転写因子はショウジョウバエの背側管(dorsal vessel)の発生に関わるtinmanと相同性がある。

配列と構造[編集]

NK-2のホメオドメインとDNAの結合の様子。

Nkx2.5は主としてTN(tinman)ドメイン、ホメオドメイン(ホメオボックス)、NK2(NK-2-SD)ドメインの3つのドメインから構成される。TNドメインは10アミノ酸残基の長さで、他のタンパク質との相互作用に利用されるとされる。ホメオドメインは60アミノ酸残基の長さがありヘリックス・ターン・ヘリックス構造を有するDNAへの結合部位である。NK2ドメインはtinmanにはないドメインで、これも他のタンパク質との相互作用に役立つと考えられている。

誘導[編集]

Nkx2.5は心原基(cardiac crescent)の形成期にBMP(下流の転写因子はSmad)やGATAFGFなどによって誘導されることが知られる。実際の心臓の発生では側板中胚葉の細胞が隣接する内胚葉からBMP2、FGFなどの傍分泌を受けて、Nkx2.5やGata4を発現する心筋前駆細胞へと分化する。一方で、Nkx2.5はSmadに働きかけてフィードバック的にBMPシグナルを抑制することで心筋細胞の数を制限している[5]。Nkx2.5はGata4と同様、心房心室に均一に発現する。Nkx2.5は他の転写因子とヘテロ二量体を形成することが出来る。例えば心房性ナトリウム利尿ペプチドをコードするANF遺伝子はNkx2.5とGata4の二量体によって活性化され[6]、Nkx2.5とTbx2の二量体によって抑制される[7]

参考文献[編集]

  • 山岸 敬幸、白石 公、先天性心疾患を理解するための臨床心臓発生学 ISBN 978-4-7583-0148-0
  • Heather Bartlett, Gert Jan C. Veenstra, Daniel L. Weeks, Examining Cardiac NK-2 Genes in Early Heart Development.Pediatr Cardiol. 2010 Apr;31(3):335-41. Epub 2009 Dec 5.PMID 19967350

出典[編集]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000183072 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015579 - Ensembl, May 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". 
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". 
  5. ^ Prall OW, Watanabe Y et al. An Nkx2-5/Bmp2/Smad1 negative feedback loop controls heart progenitor specification and proliferation. Cell.2007;128:947-959,PMID 17350578
  6. ^ D. Durocher et al, The atrial natriuretic factor promoter is a downstream target for Nkx-2.5 in the myocardium. Mol Cell Biol. 1996 Sep;16(9):4648-55.PMID 8756621
  7. ^ Petra Habets et al,Cooperative action of Tbx2 and Nkx2.5 inhibits ANF expression in the atrioventricular canal: implications for cardiac chamber formation.Genes Dev. 2002 May 15; 16(10): 1234–1246. PMID 12023302