E2F
E2Fは、高等真核生物で転写因子ファミリーをコードする遺伝子ファミリーである。そのうち3つはアクチベーターであり（E2F1、E2F2、E2F3a）、他の6つはリプレッサーである（E2F3b、E2F4、E2F5、E2F6、E2F7、E2F8）。哺乳類の細胞でこれらは全て、細胞周期の調節とDNA合成に関与している。E2Fは転写因子として、標的プロモーター配列のTTTCCCGCコンセンサス配列（とそのバリエーション）に結合する。
E2Fファミリー[編集]
E2Fファミリーのメンバーのアミノ酸配列（N末端が左、C末端が右）、各メンバーの機能ドメインの相対的な位置関係の模式図を示す。
| ファミリーのメンバー | 凡例 |
|---|---|
|
構造[編集]
E2Fファミリーの転写因子はウィングドヘリックス転写因子のDNA結合モチーフと類似したフォールドを持つことがX線結晶構造解析によって示されている[1]。
細胞周期における役割[編集]
E2Fファミリーのメンバーは哺乳類と植物の細胞周期において、G1/S期の移行に大きな役割を果たす（KEGG cell cycle pathwayを参照）。DNAマイクロアレイ解析の結果からは、E2Fファミリーのメンバー間では標的となるプロモーターのセットが異なっていることが明らかにされており、各タンパク質が細胞周期において独自の役割を果たしていることが示唆されている[2]。E2Fの転写標的としては、サイクリン、CDK、細胞周期チェックポイント調節因子、DNA修復・複製タンパク質などが挙げられる。一方で、ファミリーメンバーの間には高い冗長性があり、E2F1、E2F2、そしてE2F3のアイソフォームの1つを欠くマウスの胚は、E2F3aまたはE2F3bのいずれかを発現させることで正常に成長する[3]。
E2Fファミリーは、機能によって転写アクチベーターとリプレッサーの2つのグループに大別される。E2F1、E2F2、E2F3aなどのアクチベーターは細胞周期の進行を促進・補助し、リプレッサーは細胞周期を阻害する。一方で、どちらのタイプのE2Fも類似したドメインを持っている。E2F1–6はDP1,2ヘテロ二量化ドメインを持ち、E2Fとは遠い関係にあるタンパク質、DP1、DP2と結合することができる。DP1またはDP2と結合することで第2のDNA結合部位が存在することとなり、E2Fの結合安定性は向上する[4]。ほとんどのE2Fは、ポケットタンパク質結合ドメインを持っている。Rbタンパク質（pRB）やその関連タンパク質であるp107やp130などのポケットタンパク質は、低リン酸化状態でE2Fに結合することができる。アクチベーター型のE2Fでは、E2FとpRBの結合は転写活性化を担うトランスアクチベーションドメインを覆い隠すことが示されている[5]。リプレッサー型のE2F4とE2F5では、ポケットタンパク質の結合（pRBよりもp107とp130が多い）は標的遺伝子をサイレンシングする抑制複合体のリクルートを媒介する[6]。E2F6、E2F7、E2F8はポケットタンパク質結合部位を持たず、その遺伝子サイレンシングの機構は未解明である。CDK4/6-サイクリンDやCDK2-サイクリンEはpRBや関連するポケットタンパク質をリン酸化し、E2Fから解離させる。その結果、アクチベーター型のE2Fタンパク質はS期を促進する遺伝子を転写することができるようになる。REF52細胞では、アクチベーターE2F1の過剰発現によって、静止期の細胞をS期に移行させることができる[7]。リプレッサー型のE2F4とE2F5は細胞の増殖には影響を与えないが、細胞周期のG1期での停止を媒介する[2]。
E2Fアクチベーターのレベルは周期的であり、G1/S期に発現は最大となる。対照的にE2Fリプレッサーの発現は一定であり、特に静止期の細胞で発現していることが多い。具体的には、マウスではE2F5は終末分化した細胞でのみ発現している[2]。リプレッサー型とアクチベーター型のE2Fの間でのバランスによって、細胞周期の進行は調節されている。アクチベーター型のE2Fファミリータンパク質がノックアウトされた場合には、リプレッサー型のE2Fが活性化されて要的遺伝子を阻害する[8]。
転写標的[編集]
- 細胞周期: CCNA1、CCNA2、CCND1、CCND2、CDK2、MYB、 E2F1、E2F2、E2F3、TFDP1、CDC25A
- 負の調節因子: E2F7、RB1、TP107、TP21
- 細胞周期チェックポイント: TP53、BRCA1、BRCA2、BUB1
- アポトーシス: TP73、APAF1、CASP3、CASP7、CASP8、MAP3K5、MAP3K14
- ヌクレオチド合成: チミジンキナーゼ（tk）、チミジル酸シンターゼ（ts）、DHFR
- DNA修復: BARD1、RAD51、UNG1,2、FANCA、FANCC、FANCJ
- DNA複製: PCNA、ヒストンH2A、DNAポリメラーゼα、DNAポリメラーゼδ、RPA1、RPA2、RPA3、CDC6、MCM2、MCM3、MCM4、MCM5、MCM6、MCM7
出典[編集]
- ^ “Structural basis of DNA recognition by the heterodimeric cell cycle transcription factor E2F-DP”. Genes & Development 13 (6): 666–74. (March 1999). doi:10.1101/gad.13.6.666. PMC 316551. PMID 10090723.
- ^ a b c “E2F4 and E2F5 play an essential role in pocket protein-mediated G1 control”. Molecular Cell 6 (3): 729–35. (September 2000). doi:10.1016/S1097-2765(00)00071-X. PMID 11030352.
- ^ “Mouse development with a single E2F activator”. Nature 454 (7208): 1137–41. (August 2008). Bibcode: 2008Natur.454.1137T. doi:10.1038/nature07066. PMC 4288824. PMID 18594513.
- ^ “Interplay between Arabidopsis activating factors E2Fb and E2Fa in cell cycle progression and development”. Plant Physiology 140 (4): 1355–66. (April 2006). doi:10.1104/pp.106.077990. PMC 1435807. PMID 16514015.
- ^ “Cloning and characterization of mouse E2F8, a novel mammalian E2F family member capable of blocking cellular proliferation”. The Journal of Biological Chemistry 280 (18): 18211–20. (May 2005). doi:10.1074/jbc.M501410200. PMID 15722552.
- ^ “Emerging roles of E2Fs in cancer: an exit from cell cycle control”. Nature Reviews. Cancer 9 (11): 785–97. (November 2009). doi:10.1038/nrc2696. PMC 3616489. PMID 19851314.
- ^ “Expression of transcription factor E2F1 induces quiescent cells to enter S phase”. Nature 365 (6444): 349–52. (September 1993). Bibcode: 1993Natur.365..349J. doi:10.1038/365349a0. PMID 8377827.
- ^ “E2f1, E2f2, and E2f3 control E2F target expression and cellular proliferation via a p53-dependent negative feedback loop”. Molecular and Cellular Biology 27 (1): 65–78. (January 2007). doi:10.1128/MCB.02147-06. PMC 1800646. PMID 17167174.
- ^ “Pocket proteins and cell cycle control”. Oncogene 24 (17): 2796–809. (April 2005). doi:10.1038/sj.onc.1208619. PMID 15838516.
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- ^ “A complex with chromatin modifiers that occupies E2F- and Myc-responsive genes in G0 cells”. Science 296 (5570): 1132–6. (May 2002). Bibcode: 2002Sci...296.1132O. doi:10.1126/science.1069861. PMID 12004135.
- ^ “In vivo structure of the human cdc2 promoter: release of a p130-E2F-4 complex from sequences immediately upstream of the transcription initiation site coincides with induction of cdc2 expression”. Molecular and Cellular Biology 15 (12): 6901–13. (December 1995). doi:10.1128/mcb.15.12.6901. PMC 230945. PMID 8524257.
- ^ “Cell cycle regulation of E2F site occupation in vivo”. Science 271 (5255): 1595–7. (March 1996). Bibcode: 1996Sci...271.1595Z. doi:10.1126/science.271.5255.1595. PMID 8599118.
- ^ “Systems Biology-Based Identifi cation of Crosstalk between E2F Transcription Factors and the Fanconi Anemia Pathway”. Gene Regulation and Systems Biology 1 (1): 1–7. (2007). doi:10.1177/117762500700100001. PMC 2759144. PMID 19936073.