リボソームタンパク質SA

RPSA
PDBに登録されている構造
PDB	オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧
	3BCH, 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4UJE, 4D5L, 4UJD, 5FLX, 4D61
識別子
記号	RPSA, 37LRP, 67LR, ICAS, LAMBR, LAMR1, LBP, LBP/p40, LRP, LRP/LR, NEM/1CHD4, SA, lamR, p40, Ribosomal protein SA
外部ID	OMIM: 150370 MGI: 105381 HomoloGene: 68249 GeneCards: RPSA
遺伝子の位置 (ヒト)
染色体	3番染色体 (ヒト)
終点	39,412,542 bp
遺伝子の位置 (マウス)
染色体	9番染色体 (マウス)
終点	119,961,435 bp
遺伝子オントロジー
分子機能	• virus receptor activity; • structural constituent of ribosome; • ribosome binding; • laminin receptor activity; • 血漿タンパク結合; • RNA結合; • laminin binding;
細胞の構成要素	• 細胞質; • 細胞質基質; • リボソーム; • 膜; • 細胞膜; • 細胞内; • small ribosomal subunit; • エキソソーム; • 細胞核; • 90S preribosome; • 核質; • cytosolic small ribosomal subunit;
生物学的プロセス	• endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); • endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA); • viral transcription; • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; • translational initiation; • rRNA export from nucleus; • ウイルス侵入; • ナンセンス変異依存mRNA分解機構; • タンパク質生合成; • viral process; • rRNA processing; • ribosomal small subunit assembly; • 細胞接着; • cytoplasmic translation;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	3921
	16785
	ENSG00000168028
	ENSMUSG00000032518
	P08865,F8WD59
	P14206
	NM_002295; NM_001304288
	NM_011029
	NP_001291217; NP_002286
	NP_035159
	ウィキデータ
閲覧/編集ヒト	閲覧/編集マウス

40Sリボソームタンパク質SA（40SリボソームタンパクしつSA、40S ribosomal protein SA）は、ヒトにおいてRPSA遺伝子にコードされるタンパク質である^[5]^[6]^[7]。

細胞外マトリックス糖タンパク質ファミリーであるラミニン類は、基底膜の主要な非コラーゲン性成分である。ラミニン類は、細胞の接着や分化、遊走、シグナル伝達、神経突起伸長、転移を含む多種多様な生物学的過程に関係している。ラミニンの効果の多くは、細胞表面受容体との相互作用によって媒介される。これらの受容体にはインテグリンファミリーや非インテグリン性ラミニン結合タンパク質がある。RPSA遺伝子は高親和性、非インテグリンファミリー、ラミニン受容体1 (laminin receptor 1) をコードしている。この受容体は67 kDラミニン受容体 (67LR)、37 kDラミニン受容体前駆体 (37LRP)、p40リボソーム関連タンパク質とさまざまに呼ばれてきている。ラミニン受容体1のアミノ酸配列は進化を通して高度に保存されており、重要な生物学的機能を有することが示唆されている。ラミニン受容体転写産物の量が正常細胞よりも大腸がん組織や肺がん細胞株において高いことが報告されている。また、がん細胞におけるこのポリペプチドの上方制御とそれらの侵襲性、転移性表現型との間に相関がある。この遺伝子には複数のコピーが存在するが、それらの多くはレトロポジショナル事象から生じたと考えられている偽遺伝子である。この遺伝子には2種類の選択的スプライシングによる転写変異体が見出されている^[7]。

相互作用[編集]

リボソームタンパク質SAはRPS21^[8]^[9]と相互作用することが明らかにされている。

脚注[編集]

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000168028 - Ensembl, May 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032518 - Ensembl, May 2017
^ Human PubMed Reference:
^ Mouse PubMed Reference:
^ Satoh K, Narumi K, Sakai T, Abe T, Kikuchi T, Matsushima K, Sindoh S, Motomiya M (Jul 1992). “Cloning of 67-kDa laminin receptor cDNA and gene expression in normal and malignant cell lines of the human lung”. Cancer Lett 62 (3): 199–203. doi:10.1016/0304-3835(92)90096-E. PMID 1534510.
^ Jackers P, Minoletti F, Belotti D, Clausse N, Sozzi G, Sobel ME, Castronovo V (Sep 1996). “Isolation from a multigene family of the active human gene of the metastasis-associated multifunctional protein 37LRP/p40 at chromosome 3p21.3”. Oncogene 13 (3): 495–503. PMID 8760291.
^ ^a ^b “Entrez Gene: RPSA ribosomal protein SA”. 2013年7月19日閲覧。
^ Stelzl, Ulrich; Worm Uwe, Lalowski Maciej, Haenig Christian, Brembeck Felix H, Goehler Heike, Stroedicke Martin, Zenkner Martina, Schoenherr Anke, Koeppen Susanne, Timm Jan, Mintzlaff Sascha, Abraham Claudia, Bock Nicole, Kietzmann Silvia, Goedde Astrid, Toksöz Engin, Droege Anja, Krobitsch Sylvia, Korn Bernhard, Birchmeier Walter, Lehrach Hans, Wanker Erich E (Sep. 2005). “A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome”. Cell (United States) 122 (6): 957–968. doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. ISSN 0092-8674. PMID 16169070.
^ Sato, M; Saeki Y, Tanaka K, Kaneda Y (Mar. 1999). “Ribosome-associated protein LBP/p40 binds to S21 protein of 40S ribosome: analysis using a yeast two-hybrid system”. Biochem. Biophys. Res. Commun. (UNITED STATES) 256 (2): 385–390. doi:10.1006/bbrc.1999.0343. ISSN 0006-291X. PMID 10079194.

参考文献[編集]

Belkin AM, Stepp MA (2000). “Integrins as receptors for laminins”. Microsc. Res. Tech. 51 (3): 280–301. doi:10.1002/1097-0029(20001101)51:3<280::AID-JEMT7>3.0.CO;2-O. PMID 11054877.
Wewer UM, Liotta LA, Jaye M et al. (1986). “Altered levels of laminin receptor mRNA in various human carcinoma cells that have different abilities to bind laminin”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83 (19): 7137–7141. doi:10.1073/pnas.83.19.7137. PMC 386670. PMID 2429301.
Van den Ouweland AM (1989). “Characteristics of a multicopy gene family predominantly consisting of processed pseudogenes”. Nucleic Acids Res. 17 (10): 3829–3843. doi:10.1093/nar/17.10.3829. PMC 317862. PMID 2543954.
Yow HK, Wong JM, Chen HS et al. (1988). “Increased mRNA expression of a laminin-binding protein in human colon carcinoma: complete sequence of a full-length cDNA encoding the protein”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85 (17): 6394–6398. doi:10.1073/pnas.85.17.6394. PMC 281978. PMID 2970639.
Gehlsen KR, Dillner L, Engvall E, Ruoslahti E (1988). “The human laminin receptor is a member of the integrin family of cell adhesion receptors”. Science 241 (4870): 1228–1229. doi:10.1126/science.2970671. PMID 2970671.
Selvamurugan N, Eliceiri GL (1996). “The gene for human E2 small nucleolar RNA resides in an intron of a laminin-binding protein gene”. Genomics 30 (2): 400–1. PMID 8586453.
Vladimirov SN, Ivanov AV, Karpova GG et al. (1996). “Characterization of the human small-ribosomal-subunit proteins by N-terminal and internal sequencing, and mass spectrometry”. Eur. J. Biochem. 239 (1): 144–149. doi:10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x. PMID 8706699.
Clausse N, Jackers P, Jarès P et al. (1997). “Identification of the active gene coding for the metastasis-associated 37LRP/p40 multifunctional protein”. DNA Cell Biol. 15 (12): 1009–1023. doi:10.1089/dna.1996.15.1009. PMID 8985115.
Daidone MG, Silvestrini R, Benini E et al. (1997). “Expression of high-affinity 67-kDa laminin receptors in primary breast cancers and metachronous metastatic lesions or contralateral cancers”. Br. J. Cancer 76 (1): 52–3. doi:10.1038/bjc.1997.335. PMC 2223804. PMID 9218732.
Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S et al. (1998). “A map of 75 human ribosomal protein genes”. Genome Res. 8 (5): 509–23. doi:10.1101/gr.8.5.509. PMID 9582194.
de Manzoni G, Guglielmi A, Verlato G et al. (1998). “Prognostic significance of 67-kDa laminin receptor expression in advanced gastric cancer”. Oncology 55 (5): 456–460. doi:10.1159/000011895. PMID 9732225.
Sato M, Saeki Y, Tanaka K, Kaneda Y (1999). “Ribosome-associated protein LBP/p40 binds to S21 protein of 40S ribosome: analysis using a yeast two-hybrid system”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 256 (2): 385–390. doi:10.1006/bbrc.1999.0343. PMID 10079194.
Canfield SM, Khakoo AY (1999). “The nonintegrin laminin binding protein (p67 LBP) is expressed on a subset of activated human T lymphocytes and, together with the integrin very late activation antigen-6, mediates avid cellular adherence to laminin”. J. Immunol. 163 (6): 3430–40. PMID 10477615.
Donaldson EA, McKenna DJ, McMullen CB et al. (2000). “The expression of membrane-associated 67-kDa laminin receptor (67LR) is modulated in vitro by cell-contact inhibition”. Mol. Cell Biol. Res. Commun. 3 (1): 53–59. doi:10.1006/mcbr.2000.0191. PMID 10683318.
Pedraza C, Geberhiwot T, Ingerpuu S et al. (2000). “Monocytic cells synthesize, adhere to, and migrate on laminin-8 (alpha 4 beta 1 gamma 1)”. J. Immunol. 165 (10): 5831–8. PMID 11067943.
Vande Broek I, Vanderkerken K, De Greef C et al. (2001). “Laminin-1-induced migration of multiple myeloma cells involves the high-affinity 67 kD laminin receptor”. Br. J. Cancer 85 (9): 1387–1395. doi:10.1054/bjoc.2001.2078. PMC 2375239. PMID 11720479.
Waltregny D, de Leval L, Coppens L et al. (2002). “Detection of the 67-kD laminin receptor in prostate cancer biopsies as a predictor of recurrence after radical prostatectomy”. Eur. Urol. 40 (5): 495–503. doi:10.1159/000049825. PMID 11752855.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000168028 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032518 - Ensembl, May 2017

[3] Human PubMed Reference:

[4] Mouse PubMed Reference:

[pmid1534510-5] Satoh K, Narumi K, Sakai T, Abe T, Kikuchi T, Matsushima K, Sindoh S, Motomiya M (Jul 1992). “Cloning of 67-kDa laminin receptor cDNA and gene expression in normal and malignant cell lines of the human lung”. Cancer Lett 62 (3): 199–203. doi:10.1016/0304-3835(92)90096-E. PMID 1534510.

[pmid8760291-6] Jackers P, Minoletti F, Belotti D, Clausse N, Sozzi G, Sobel ME, Castronovo V (Sep 1996). “Isolation from a multigene family of the active human gene of the metastasis-associated multifunctional protein 37LRP/p40 at chromosome 3p21.3”. Oncogene 13 (3): 495–503. PMID 8760291.

[entrez-7] “Entrez Gene: RPSA ribosomal protein SA”. 2013年7月19日閲覧。

[pmid16169070-8] Stelzl, Ulrich; Worm Uwe, Lalowski Maciej, Haenig Christian, Brembeck Felix H, Goehler Heike, Stroedicke Martin, Zenkner Martina, Schoenherr Anke, Koeppen Susanne, Timm Jan, Mintzlaff Sascha, Abraham Claudia, Bock Nicole, Kietzmann Silvia, Goedde Astrid, Toksöz Engin, Droege Anja, Krobitsch Sylvia, Korn Bernhard, Birchmeier Walter, Lehrach Hans, Wanker Erich E (Sep. 2005). “A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome”. Cell (United States) 122 (6): 957–968. doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. ISSN 0092-8674. PMID 16169070.

[pmid10079194-9] Sato, M; Saeki Y, Tanaka K, Kaneda Y (Mar. 1999). “Ribosome-associated protein LBP/p40 binds to S21 protein of 40S ribosome: analysis using a yeast two-hybrid system”. Biochem. Biophys. Res. Commun. (UNITED STATES) 256 (2): 385–390. doi:10.1006/bbrc.1999.0343. ISSN 0006-291X. PMID 10079194.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]