EXO1

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EXO1
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PDBのIDコード一覧

3QE9, 3QEA, 3QEB

識別子
記号EXO1, HEX1, hExoI, exonuclease 1
外部IDOMIM: 606063 MGI: 1349427 HomoloGene: 31352 GeneCards: EXO1
遺伝子の位置 (ヒト)
1番染色体 (ヒト)
染色体1番染色体 (ヒト)[1]
1番染色体 (ヒト)
EXO1遺伝子の位置
EXO1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点241,847,967 bp[1]
終点241,895,148 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
1番染色体 (マウス)
染色体1番染色体 (マウス)[2]
1番染色体 (マウス)
EXO1遺伝子の位置
EXO1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点175,708,147 bp[2]
終点175,741,055 bp[2]
RNA発現パターン
さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 エンドヌクレアーゼ活性
double-stranded DNA 5'-3' exodeoxyribonuclease activity
single-stranded DNA 5'-3' exodeoxyribonuclease activity
DNA結合
5'-3' exonuclease activity
ヌクレアーゼ活性
RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
血漿タンパク結合
5'-3' exodeoxyribonuclease activity
flap endonuclease activity
クロマチン結合
エキソヌクレアーゼ活性
エステル結合に作用する加水分解酵素活性
触媒活性
加水分解酵素活性
金属イオン結合
二本鎖DNA結合
5'-flap endonuclease activity
細胞の構成要素 細胞核
核質
核内構造体
細胞膜
生物学的プロセス DNA recombination
免疫系プロセス
humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin
DNAミスマッチ修復
cellular response to DNA damage stimulus
somatic hypermutation of immunoglobulin genes
減数分裂
クラススイッチ
DNA修復
RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
核酸ホスホジエステル結合の加水分解
DNA複製
t-circle formation
meiotic DNA double-strand break processing
regulation of signal transduction by p53 class mediator
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_003686
NM_006027
NM_130398
NM_001319224

NM_012012

RefSeq
(タンパク質)

NP_001306153
NP_003677
NP_006018
NP_569082

NP_036142

場所
(UCSC)
Chr 1: 241.85 – 241.9 MbChr 1: 175.71 – 175.74 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

EXO1(exonuclease 1)は、ヒトではEXO1遺伝子にコードされる酵素である[5][6][7]

EXO1は5'→3'エキソヌクレアーゼ活性に加え、リボヌクレアーゼH活性(DNA/RNAハイブリッドのRNAを切断するエンドヌクレアーゼ活性)を持つタンパク質である[8]MSH2と相互作用し、DNAミスマッチ修復相同組換えに関与している。EXO1遺伝子からは選択的スプライシングにより、2種類のアイソフォームをコードする3種類の転写バリアントが生じる[7]

減数分裂[編集]

減数分裂時の組換えに関する現行のモデル。二本鎖切断(ギャップ)の形成によって開始され、続いて相同染色体との対合とstrand invasionによって組換え修復過程が開始される。ギャップの修復によって隣接領域に乗換えが生じる場合(CO)と生じない場合(NCO)がある。乗換え型組換えはダブルホリデイジャンクション(DHJ)モデルによって生じると考えられており、図の右側に示されている。非乗換え型組換えは主にSDSA(synthesis dependent strand annealing)モデルによって生じると考えられており、左側に示されている。組換えイベントの大部分はSDSA型のようである。

EXO1(Exo1、ExoI)は、出芽酵母とマウスにおいて、減数第一分裂中期の進行に必要不可欠であることが示されている[9][10]

減数分裂時の組換えは、DNAの二本鎖切断によって開始されることが多い。組換え時には、resectionと呼ばれる過程において切断部の5'末端のDNA断片が切断除去される。続いて起こるstrand invasionの段階では、切断されたDNA分子の3'末端オーバーハングが切断されていない相同染色体英語版のDNAへ「侵入」し、Dループ(displacement loop)が形成される。次に起こる一連のイベントは、乗換え(CO)型もしくは非乗換え(NCO)型の組換えという主要な2つの経路のいずれかである(遺伝的組換え相同組換えを参照)。乗換え型の組換えをもたらす経路は、ダブルホリデイジャンクション(DHJ)中間体の形成を伴う。乗換え型組換えが完了するためには、ホリデイジャンクション構造の解消が必要である。

出芽酵母の減数分裂時には、Exo1遺伝子の転写が強力に誘導される[9]。減数分裂細胞では、Exo1の変異によって二本鎖切断のプロセシングや乗換え型組換えの頻度が低下する[9]。減数分裂時の組換えにおいて、Exo1は時期的、生化学的に異なる2つの機能を持つ[11]。まず、Exo1は二本鎖切断末端部のDNAを除去する5'→3'エキソヌクレアーゼとして機能する。組換え過程のより後期の段階では、Exo1は乗換え型組換えを行うためにDHJ構造の解消を促進する機能を果たす。この機能はヌクレアーゼ活性には依存しない。Exo1はDHJ構造の解消の際にはExo1はMLH1-MLH3ヘテロ二量体(MutLγ)やSgs1英語版BLM英語版オルソログ)と共に機能し、乗換えの大部分を生み出すjoint molecule resolution pathwayを構成している[12]

Exo1が欠損したオスのマウスは減数分裂のパキテン期を正常に進行することができるが、生殖細胞の大部分はキアズマ英語版の喪失のため第一分裂前期を正常に進行することができない[10]。このExo1の役割はヌクレアーゼ活性自体によって媒介されているわけではなく、Exo1のヌクレアーゼドメインに点変異を有するマウスでも減数分裂の欠陥は検出されない[13]

相互作用[編集]

EXO1は、MSH2[6][14][15]MLH1[15]と相互作用することが示されている。

出典s[編集]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000174371 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000039748 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ “Hex1: a new human Rad2 nuclease family member with homology to yeast exonuclease 1”. Nucleic Acids Res 26 (16): 3762–8. (September 1998). doi:10.1093/nar/26.16.3762. PMC 147753. PMID 9685493. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC147753/. 
  6. ^ a b “Human exonuclease I interacts with the mismatch repair protein hMSH2”. Cancer Res 58 (20): 4537–42. (November 1998). PMID 9788596. 
  7. ^ a b Entrez Gene: EXO1 exonuclease 1”. 2022年12月24日閲覧。
  8. ^ “Human exonuclease 1 functionally complements its yeast homologues in DNA recombination, RNA primer removal, and mutation avoidance.”. J. Biol. Chem. 274 (25): 17893–900. (June 1999). doi:10.1074/jbc.274.25.17893. PMID 10364235. 
  9. ^ a b c “Exo1 roles for repair of DNA double-strand breaks and meiotic crossing over in Saccharomyces cerevisiae”. Mol. Biol. Cell 11 (7): 2221–33. (2000). doi:10.1091/mbc.11.7.2221. PMC 14915. PMID 10888664. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC14915/. 
  10. ^ a b “Inactivation of Exonuclease 1 in mice results in DNA mismatch repair defects, increased cancer susceptibility, and male and female sterility”. Genes Dev. 17 (5): 603–14. (2003). doi:10.1101/gad.1060603. PMC 196005. PMID 12629043. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC196005/. 
  11. ^ “Temporally and biochemically distinct activities of Exo1 during meiosis: double-strand break resection and resolution of double Holliday junctions”. Mol. Cell 40 (6): 1001–15. (2010). doi:10.1016/j.molcel.2010.11.032. PMC 3061447. PMID 21172664. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3061447/. 
  12. ^ “Delineation of joint molecule resolution pathways in meiosis identifies a crossover-specific resolvase”. Cell 149 (2): 334–47. (2012). doi:10.1016/j.cell.2012.03.023. PMC 3377385. PMID 22500800. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3377385/. 
  13. ^ “Role of EXO1 nuclease activity in genome maintenance, the immune response and tumor suppression in Exo1D173A mice”. Nucleic Acids Res 50 (14): 8093–8106. (2022). doi:10.1093/nar/gkac616. PMC 9371890. PMID 35849338. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9371890/. 
  14. ^ Rasmussen, L J; Rasmussen M; Lee B; Rasmussen A K; Wilson D M; Nielsen F C; Bisgaard H C (June 2000). “Identification of factors interacting with hMSH2 in the fetal liver utilizing the yeast two-hybrid system. In vivo interaction through the C-terminal domains of hEXO1 and hMSH2 and comparative expression analysis”. Mutat. Res. 460 (1): 41–52. doi:10.1016/S0921-8777(00)00012-4. ISSN 0027-5107. PMID 10856833. 
  15. ^ a b Schmutte, C; Sadoff M M; Shim K S; Acharya S; Fishel R (August 2001). “The interaction of DNA mismatch repair proteins with human exonuclease I”. J. Biol. Chem. 276 (35): 33011–8. doi:10.1074/jbc.M102670200. ISSN 0021-9258. PMID 11427529. 

関連文献[編集]