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ジストロフィン

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DMD
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

1DXX, 1EG3, 1EG4, 3UUN

識別子
記号DMD, BMD, CMD3B, DXS142, DXS164, DXS206, DXS230, DXS239, DXS268, DXS269, DXS270, DXS272, MRX85, dystrophin
外部IDOMIM: 300377 MGI: 94909 HomoloGene: 20856 GeneCards: DMD
遺伝子の位置 (ヒト)
X染色体
染色体X染色体[1]
X染色体
DMD遺伝子の位置
DMD遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点31,097,677 bp[1]
終点33,339,609 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
X染色体 (マウス)
染色体X染色体 (マウス)[2]
X染色体 (マウス)
DMD遺伝子の位置
DMD遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点81,992,476 bp[2]
終点84,249,747 bp[2]
RNA発現パターン


さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 nitric-oxide synthase binding
dystroglycan binding
vinculin binding
myosin binding
zinc ion binding
金属イオン結合
血漿タンパク結合
actin binding
structural constituent of muscle
structural constituent of cytoskeleton
細胞の構成要素 細胞質
細胞質基質
postsynaptic membrane
lateral plasma membrane

糸状偽足
cell-substrate junction
細胞膜
シナプス
dystrophin-associated glycoprotein complex
cell surface
細胞結合
Z discdkac
actin cytoskeleton
脂質ラフト
筋鞘
コスタメア
syntrophin complex
neuron projection terminus
細胞骨格
細胞核
filopodium membrane
高分子複合体
生物学的プロセス response to muscle stretch
regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity
cardiac muscle cell action potential
regulation of voltage-gated calcium channel activity
心筋収縮
muscle cell cellular homeostasis
negative regulation of peptidyl-cysteine S-nitrosylation
regulation of cardiac muscle contraction by regulation of the release of sequestered calcium ion
ペプチド生合成プロセス
筋発生
regulation of heart rate
positive regulation of neuron differentiation
negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation
positive regulation of neuron projection development
muscle filament sliding
positive regulation of sodium ion transmembrane transporter activity
regulation of cellular response to growth factor stimulus
regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum
motile cilium assembly
regulation of skeletal muscle contraction
regulation of skeletal muscle contraction by regulation of release of sequestered calcium ion
cytoskeleton organization
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)
NM_000109
NM_004006
NM_004007
NM_004009
NM_004010

NM_004011
NM_004012
NM_004013
NM_004014
NM_004015
NM_004016
NM_004017
NM_004018
NM_004019
NM_004020
NM_004021
NM_004022
NM_004023

NM_007868
NM_001314034
NM_001314035
NM_001314036
NM_001314037

NM_001314038

RefSeq
(タンパク質)
NP_000100
NP_003997
NP_004000
NP_004001
NP_004002

NP_004003
NP_004004
NP_004005
NP_004006
NP_004007
NP_004008
NP_004009
NP_004010
NP_004011
NP_004012
NP_004013
NP_004014

NP_001300963
NP_001300964
NP_001300965
NP_001300966
NP_001300967

NP_031894

場所
(UCSC)
Chr X: 31.1 – 33.34 MbChr X: 81.99 – 84.25 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

ジストロフィン (dystrophin) は棒状の細胞質タンパク質で、コスタメアとして知られるタンパク質複合体の一部をなす。この複合体は細胞膜を越えて、筋繊維細胞骨格とその周囲の細胞外マトリックスを接続している。コスタメアには他にα-ジストロブレビンシンコイリンシネミンサルコグリカンジストログリカンサルコスパンなど多くのタンパク質がある。

ジストロフィン遺伝子はX染色体に存在する。この遺伝子ヒトの遺伝子としてDNAレベルで最も長く、220万塩基(ヒトゲノムの0.07%)もの長さがある。一次転写産物は約240万塩基になり、転写には16時間かかる[5]。成熟mRNAは約14,000塩基となる[6]。79のエクソンにコードされ[7]、3500以上のアミノ酸からなる[8]。だが、ヒト最大のタンパクはチチンである。

病理

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ジストロフィンの欠損は一部のミオパチーの原因となり、総称して筋ジストロフィーと呼ばれる。1986年に、ある遺伝子の変異がデュシェンヌ型筋ジストロフィー (DMD) を引き起こすことが明らかになり[9]、1987年にLouis M. Kunkelによって、その産物であるこの細胞質タンパク質が同定された[10]

通常の骨格筋組織は少量の(全タンパク質の0.002%)ジストロフィンを含むのみだが、その欠損・変異は細胞内シグナル伝達系の異常をもたらし、不可逆的な筋繊維壊死・筋力低下・疲労などの症状を引き起こす。ほとんどの患者は車椅子を必要とし、心筋線維症による心臓肥大・呼吸不全の結果として20-30歳で死亡することになる。ジストロフィン遺伝子が突然変異しても部分的に機能を持つタンパクを生産できることがあり、そのような軽度の症例はベッカー型筋ジストロフィー (BMD) と呼ばれる。症状が中間的でDMDかBMDか判断しづらい場合もあるが、現在この判断にはフレームシフト突然変異の存在が用いられることが多い[11]

未だジストロフィンの役割はよく分かっていないが、気道平滑筋細胞においてジストロフィン-糖タンパク複合体 (DGC) がその収縮に不可欠であることを示した研究がある[12]

相互作用

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β1-シントロフィン[13]α1-シントロフィン[14][15][16]α-ジストロブレビン[17]タンパク質間相互作用する。

出典

[編集]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198947 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000045103 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ Tennyson CN, Klamut HJ, Worton RG (1995). “The human dystrophin gene requires 16 hours to be transcribed and is cotranscriptionally spliced”. Nature Genetics 9 (2): 184-90. doi:10.1038/ng0295-184. PMID 7719347. 
  6. ^ NCBI Sequence Viewer v2.0
  7. ^ Strachan T and Read AP, 1999. Human molecular genetics, BIOS Scientific, New York, USA
  8. ^ NCBI Sequence Viewer v2.0
  9. ^ Monaco A, Neve R, Colletti-Feener C et al. (1986). “Isolation of candidate cDNAs for portions of the Duchenne muscular dystrophy gene”. Nature 323 (6089): 646–50. doi:10.1038/323646a0. PMID 3773991. 
  10. ^ Hoffman E, Brown R, Kunkel L (1987). “Dystrophin: the protein product of the Duchenne muscular dystrophy locus”. Cell 51 (6): 919–28. doi:10.1016/0092-8674(87)90579-4. PMID 3319190. 
  11. ^ Aartsma-Rus A, et al. (2006). “Entries in the Leiden Duchenne muscular dystrophy mutation database: an overview of mutation types and paradoxical cases that confirm the reading-frame rule”. Muscle Nerve 34 (2): 135–44. doi:10.1002/mus.20586. PMID 16770791. 
  12. ^ Sharma P, Tran T, Stelmack GL, et al. (2008). “Expression of the dystrophin-glycoprotein complex is a marker for human airway smooth muscle phenotype maturation”. Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. 294 (1): L57–68. doi:10.1152/ajplung.00378.2007. PMID 17993586. 
  13. ^ Ahn, A H; Kunkel L M (Feb. 1995). “Syntrophin binds to an alternatively spliced exon of dystrophin”. J. Cell Biol. (UNITED STATES) 128 (3): 363–71. doi:10.1083/jcb.128.3.363. ISSN 0021-9525. PMC 2120343. PMID 7844150. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2120343/. 
  14. ^ Ahn, A H; Freener C A, Gussoni E, Yoshida M, Ozawa E, Kunkel L M (Feb. 1996). “The three human syntrophin genes are expressed in diverse tissues, have distinct chromosomal locations, and each bind to dystrophin and its relatives”. J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 271 (5): 2724–30. doi:10.1074/jbc.271.5.2724. ISSN 0021-9258. PMID 8576247. 
  15. ^ Yang, B; Jung D, Rafael J A, Chamberlain J S, Campbell K P (Mar. 1995). “Identification of alpha-syntrophin binding to syntrophin triplet, dystrophin, nNOS NOS1 ,and utrophin”. J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 270 (10): 4975–8. doi:10.1074/jbc.270.10.4975. ISSN 0021-9258. PMID 7890602. 
  16. ^ Gee, S H; Madhavan R, Levinson S R, Caldwell J H, Sealock R, Froehner S C (Jan. 1998). “Interaction of muscle and brain sodium channels with multiple members of the syntrophin family of dystrophin-associated proteins”. J. Neurosci. (UNITED STATES) 18 (1): 128–37. ISSN 0270-6474. PMID 9412493. 
  17. ^ Sadoulet-Puccio, H M; Rajala M, Kunkel L M (Nov. 1997). “Dystrobrevin and dystrophin: an interaction through coiled-coil motifs”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (UNITED STATES) 94 (23): 12413–8. doi:10.1073/pnas.94.23.12413. ISSN 0027-8424. PMC 24974. PMID 9356463. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC24974/. 

参考文献

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外部リンク

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