バイカル自然保護区(バイカルしぜんほごく、英語: Байка́льский запове́дник)はロシア連邦の国立自然保護区。
1969年9月26日創立[1]。バイカル湖南部の東岸、ブリヤート共和国内に位置する。大部分がハマル=ダバン山脈に重なる。面積165,724ha[1]。周囲は幅0.5~4kmの緩衝地帯に囲まれる。
最高地点は標高2316mのソホル山(г. Сохор)の頂上。
保護区内の約70%を占める森林には787種の植物がある。希少種、固有種、残存種の植物は約40種。哺乳類49種。鳥類251種。爬虫類および両生類6種。魚類12種。
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