Template:ドッキング用語集

ドッキング用語集
• 受容体（レセプター）、ホスト、ロック（錠前） – 「受容」する分子、ほとんどの場合はタンパク質あるいはその他の生体高分子
• リガンド、 ゲスト、キー（鍵） – 受容体に結合する相補パートナー分子。リガンドはほとんど場合低分子(en:Small molecule)であるが、生体高分子の場合もある。
• ドッキング – 受容体への候補リガンドの結合の計算シミュレーション
• 結合様式 – 受容体に対する相対的なリガンドの方向や結合時のリガンドと受容体の立体配座（コンホメーション）(en:COnformational isomerism)。
• ポーズ – 結合様式の候補
• スコアリング – 水素結合や疎水接触といった有利な分子間相互作用を数えることによって特定のポーズを評価する過程。
• ランキング – 推定結合自由エネルギーに基づいてどのリガンドが特定の受容体と最も有利に相互作用しているかを分類する過程。