「グロムス門」の版間の差分
編集の要約なし |
m Category:土壌生物学を追加 (HotCat使用) |
||
| 175行目: | 175行目: | ||
{{デフォルトソート:くろむすもん}} |
{{デフォルトソート:くろむすもん}} |
||
[[Category:菌類]] |
[[Category:菌類]] |
||
[[Category:土壌生物学]] |
|||
2019年12月14日 (土) 02:42時点における版
| グロムス門 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||
| 分類 | |||||||||
| |||||||||
| 目 | |||||||||
|
|
グロムス門 (Glomeromycota) は菌界に属する門の一つ[3]。約230種が記載されている[4]。陸上植物の胞子体の根（シダ植物や種子植物といった維管束植物）や配偶体（コケ植物やシダ植物）の大半と共生してアーバスキュラー菌根を形成し、リン酸の吸収を助けていることで知られる。一般的には陸上植物に栄養を依存する（偏性生体栄養性）と考えられているが、いくつかの種は植物と共生せずに生存できる可能性も指摘されている[5]。
全世界の地中に生息し、陸上植物の8割以上と共生することができる。湿地・塩性湿地などにも生息するほか、着生植物などとも共生する。
また、ゲオシフォンは多細胞の陸上植物とではなく、原核生物であるネンジュモ属の藍藻と細胞内共生を営んでいる[6]。
生殖
まばらな隔壁で区切られた多核菌糸を持ち、その先端に直径80-500 μmの胞子 (Glomerospore) を形成して無性生殖する[1][7]。
ディバーシスポラ目の種では、小嚢内に胞子が形成される (acaurosporoid spore)、球根状の構造から形成される (gigasporoid spore) などの形態が見られる[1]。
分子生物学
生体栄養性であるために培養が難しく、生化学・遺伝子的な研究はかなり遅れていた。この問題は最終的に、植物の根の細胞と共に培養する（二員培養 Dual culture法）ことによって解決された。こうして胞子からリボソームRNAを分離することができ、16S rRNA系統解析を行うことが可能となった[8][9]。これにより、グロムス門は二核菌と共通祖先を持つことが示されている[1]。
また、この配列を分子時計の手法で解析したところ、他の菌類からの分岐は4億6200万-3億5300万年前の間であることが示された[7]。この結果は、グロムス門が植物の上陸に深く関わっていたという仮説を支持するものである[10]。
分類
初期の分類は、根の近傍で見つかる胞子嚢果の形態に基づいたものだった[11]。大きさ・形状・色・菌糸との接続・染色液との反応などの形質が用いられたが[12]、形態的な類似性から、グロムス属が別の系統であるアツギケカビ科 Endogonaceae に含められるなどの混乱を招く結果となった[13]。
この混乱の後、アカウロスポラ属・ギガスポラ属の2属によりグロムス綱が立てられ[14]、続いてグロムス科・アカウロスポラ科・ギガスポラ科の3科が立てられた[15]。
グロムス属に似た胞子 (glomoid spore) を形成する数種は、グロムス門の中で早くに分岐したことが分かり、パラグロムス目・アーケオスポラ目の2目に含められることとなった[16][1]。アーケオスポラ目には藍藻と共生するゲオシフォンが含まれる[17]。
また、グロムス属はいくつかの科・属に分割される可能性がある[18][7]。
現在の分類は以下のようになっている[19]。
- パラグロムス目 Paraglomerales
- パラグロムス科 Paraglomelaceae - 1属3種 パラグロムス属 Paraglomus
- アーケオスポラ目 Archaeosporales
- アーケオスポラ科 Archaeosporaceae - 1属2種 アーケオスポラ属 Archaeospora
- ゲオシフォン科 Geosiphonaceae - 1属1種 ゲオシフォン Geosiphon pyriformis
- アンビスポラ科 Ambisporaceae - 1属9種 アンビスポラ属 Ambispora
- グロムス目 Glomerales
- Claroideoglomeraceae - 約1属10種
- グロムス科 Glomeraceae - 約4属110種
- ディバーシスポラ目 Diversisporales
- アカウロスポラ科 Acaulosporaceae - 約1属40種
- ディバーシスポラ科 Diversisporaceae - 3属10種
- ギガスポラ科 Gigasporaceae - 約5属50種
- パシスポラ科 Pacisporaceae - 1属8種
- Entrophosporaceae - 1属3種
脚注
- ^ a b c d e Schüßler, A. et al. (December 2001). “A new fungal phylum, the Glomeromycota: phylogeny and evolution.”. Mycol. Res. 105 (12): 1413-1421. doi:10.1017/S0953756201005196.
- ^ Cavalier-Smith, T. (1998). “A revised six-kingdom system of Life”. Biol. Rev. Camb. Philos. Soc. 73: 246. (as "Glomomycetes")
- ^ Hibbett, D.S., et al. (March 2007). “A higher level phylogenetic classification of the Fungi”. Mycol. Res. 111 (5): 509-547. doi:10.1016/j.mycres.2007.03.004. PMID 17572334.
- ^ Glomeromycota PHYLOGENY
- ^ Hempel, S., Renker, C. & Buscot, F. (2007). “Differences in the species composition of arbuscular mycorrhizal fungi in spore, root and soil communities in a grassland ecosystem”. Environmental Microbiology 9 (8): 1930-1938. doi:10.1111/j.1462-2920.2007.01309.x. PMID 17635540.
- ^ The Geosiphon pyriformis symbiosis - fungus 'eats' cyanobacterium
- ^ a b c Simon, L., Bousquet, J., Levesque, C., Lalonde, M. (1993). “Origin and diversification of endomycorrhizal fungi and coincidence with vascular land plants”. Nature 363 (6424): 67-69. Bibcode: 1993Natur.363...67S. doi:10.1038/363067a0.
- ^ Simon, L. Lalonde, M. Bruns, T.D. (1992). “Specific Amplification of 18S Fungal Ribosomal Genes from Vesicular-Arbuscular Endomycorrhizal Fungi Colonizing Roots”. American Society of Microbiology 58: 291-295.
- ^ Schüßler, A. et al. (January 2001). “Analysis of partial Glomales SSU rRNA gene sequences: implications for primer design and phylogeny”. Mycol. Res. 105 (1): 5-15. doi:10.1017/S0953756200003725.
- ^ D.W. Malloch, K.A. Pirozynski & P.H. Raven (1980). “Ecological and evolutionary significance of mycorrhizal symbioses in vascular plants (A Review)”. Proc. Natl Acad. Sci. USA 77 (4): 2113-2118. Bibcode: 1980PNAS...77.2113M. doi:10.1073/pnas.77.4.2113. PMC 348662. PMID 16592806.
- ^ Tulasne, L.R., & C. Tulasne (1844). “Fungi nonnulli hipogaei, novi v. minus cogniti auct”. Giornale Botanico Italiano 2: 55-63.
- ^ Wright, S.F. Management of Arbuscular Mycorrhizal Fungi. 2005. In Roots and Soil Management: Interactions between roots and the soil. Ed. Zobel, R.W., Wright, S.F. USA: American Society of Agronomy. Pp 183-197.
- ^ Thaxter, R. (1922). “A revision of the Endogonaceae”. Proc. Am. Acad. Arts Sci. 57 (12): 291-341. doi:10.2307/20025921. JSTOR 20025921.
- ^ J.W. Gerdemann & J.M. Trappe (1974). “The Endogonaceae in the Pacific Northwest”. Mycologia Memoirs 5: 1-76.
- ^ J.B. Morton & G.L. Benny (1990). “Revised classification of arbuscular mycorrhizal fungi (Zygomycetes): a new order, Glomales, two new suborders, Glomineae and Gigasporineae, and two new families, Acaulosporaceae and Gigasporaceae, with an emendation of Glomaceae”. Mycotaxon 37: 471-491.
- ^ Redeker, D. (2002). “Molecular identification and phylogeny of arbuscular mycorrhizal fungi”. Plant and Soil 244: 67-73. doi:10.1023/A:1020283832275.
- ^ Schüßler, A. (2002). “Molecular phylogeny, taxonomy, and evolution of Geosiphon pyriformis and arbuscular mycorrhizal fungi”. Plant and Soil 224: 75-83. doi:10.1023/A:1020238728910.
- ^ Walker, C. (1992). “Systematics and taxonomy of the arbuscular mycorrhizal fungi (Glomales) - a possible way forward”. Agronomie 12 (10): 887-897. doi:10.1051/agro:19921026.
- ^ Arthur Schüßler, Christopher Walker. “The Glomeromycota: A species list with new families and new genera”. 2012年10月12日閲覧。
外部リンク
- Tree of Life Glomeromycota
- Glomeromycota at the International Culture Collection of VA Mycorrhizal Fungi (INVAM)
- Glomeromycota at the University of Sydney Fungal Biology s|ite
- 'AMF-phylogeny' - 'Glomeromycota database' web-site at the University of Munich
- Glomeromycota - MeSH・アメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス（英語）