殺菌剤(さっきんざい)は、一般に、病原性あるいは有害性を有する微生物を殺すための薬剤をいう。
医薬品、農薬や工業用品などがあるが、呼び方や内容が異なるので以下のように分けて記載する。それぞれの項目を参照。