Template:2009年のセ・パ交流戦順位表
| 順位 | 球団 | 勝 | 敗 | 分 | 勝率 | 差 |
| 優勝 | 福岡ソフトバンクホークス | 18 | 5 | 1 | .783 | --- |
| 2位 | 東京ヤクルトスワローズ | 15 | 9 | 0 | .625 | 3.5 |
| 3位 | 広島東洋カープ | 14 | 9 | 1 | .609 | 4.0 |
| 4位 | 中日ドラゴンズ | 14 | 9 | 1 | .609 | 4.0 |
| 5位 | 読売ジャイアンツ | 12 | 9 | 3 | .571 | 5.0 |
| 6位 | 北海道日本ハムファイターズ | 12 | 11 | 1 | .522 | 6.0 |
| 7位 | 埼玉西武ライオンズ | 11 | 11 | 2 | .500 | 6.5 |
| 8位 | 千葉ロッテマリーンズ | 9 | 12 | 3 | .429 | 8.0 |
| 9位 | 阪神タイガース | 9 | 13 | 2 | .409 | 8.5 |
| 10位 | 東北楽天ゴールデンイーグルス | 9 | 15 | 0 | .375 | 9.5 |
| 11位 | オリックス・バファローズ | 8 | 16 | 0 | .333 | 10.5 |
| 12位 | 横浜ベイスターズ | 6 | 18 | 0 | .250 | 12.5 |
- 同率の場合は前年の順位で上位のチームが上位にランクされる