PDX1

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PDX1
識別子
記号PDX1, GSF, IDX-1, IPF1, IUF1, MODY4, PAGEN1, PDX-1, STF-1, pancreatic and duodenal homeobox 1
外部IDOMIM: 600733 MGI: 102851 HomoloGene: 175 GeneCards: PDX1
遺伝子の位置 (ヒト)
13番染色体 (ヒト)
染色体13番染色体 (ヒト)[1]
13番染色体 (ヒト)
PDX1遺伝子の位置
PDX1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点27,920,000 bp[1]
終点27,926,313 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
5番染色体 (マウス)
染色体5番染色体 (マウス)[2]
5番染色体 (マウス)
PDX1遺伝子の位置
PDX1遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点147,206,769 bp[2]
終点147,212,658 bp[2]
RNA発現パターン


さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 DNA結合
sequence-specific DNA binding
DNA-binding transcription factor activity
クロマチン結合
RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
転写因子結合
protein-containing complex binding
protein heterodimerization activity
promoter-specific chromatin binding
細胞の構成要素 細胞質
細胞質基質
nuclear speck
細胞内
細胞核
核質
生物学的プロセス 膵外分泌発生
negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway
細胞分化
regulation of transcription, DNA-templated
glucose homeostasis
regulation of transcription by RNA polymerase II
insulin secretion
negative regulation of transcription by RNA polymerase II
generation of precursor metabolites and energy
transcription, DNA-templated
多細胞個体の発生
positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of cell population proliferation
positive regulation of cell population proliferation
nitric oxide mediated signal transduction
glucose metabolic process
animal organ morphogenesis
膵臓発生
肝臓発生
positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus
morphogenesis of embryonic epithelium
消化管発生
negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process
negative regulation of cell population proliferation
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
膵内分泌発生
type B pancreatic cell differentiation
transcription by RNA polymerase II
detection of glucose
ヘッジホッグシグナル伝達経路
中枢神経系発生
response to wounding
response to glucose
response to iron(II) ion
response to chlorate
遺伝子発現調節
positive regulation of cell death
有機環状化合物への反応
animal organ regeneration
response to nutrient levels
positive regulation of insulin secretion
response to vitamin
脂質への反応
response to cytokine
response to nicotine
response to leucine
アルカロイドへの反応
positive regulation of DNA binding
negative regulation of transcription, DNA-templated
stem cell differentiation
糖質コルチコイドへの反応
分化転換
response to fatty acid
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_000209

NM_008814

RefSeq
(タンパク質)

NP_000200

NP_032840

場所
(UCSC)
Chr 13: 27.92 – 27.93 MbChr 13: 147.21 – 147.21 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

PDX1(pancreatic and duodenal homeobox 1)またはIPF1(insulin promoter factor 1)は、ParaHox英語版遺伝子クラスター[5]中のPDX1遺伝子にコードされる転写因子である[6][7]脊椎動物では、Pdx1はβ細胞の成熟など膵臓の発生過程や、十二指腸の分化に必要である。この遺伝子はアフリカツメガエルXenopus laevisで同定され[8]左右相称動物に広く存在するが、節足動物線形動物では進化の過程で失われている[5]Pdx1という名称がつけられているものの、大部分の動物にはPdx2遺伝子は存在せず、全ての哺乳類でPdx1オルソログ1コピーのみが同定されている[9]。これまでに、シーラカンス軟骨魚類のみが2つのPdx遺伝子、Pdx1Pdx2を持つことが示されている[10]

機能[編集]

膵臓の発生[編集]

膵臓の発生過程において、PDX1は胚体内胚葉英語版の後方前腸英語版領域の細胞集団で発現しており、PDX1+上皮細胞膵芽英語版、そして最終的には膵臓全体(外分泌、内分泌、膵管細胞集団)の発生をもたらす[11]。マウス胚では、膵臓のPdx1+細胞は胎生8.5–9.0日(E8.5–9.0)に初めて発生し、Pdx1の発現はE12.0–12.5まで継続する[12]。ホモ接合型Pdx1ノックアウトマウスでは膵芽は形成されるものの、膵臓の発生は行われない[13]。また、テトラサイクリンによってPdx1+細胞が致死となるよう改変されたトランスジェニックマウスでは、妊娠期間を通じてドキシサイクリン(テトラサイクリン誘導体)を投与された場合にほぼ完全に膵臓を欠損することからも、膵臓発生におけるPdx1+細胞の必要性が強調される[12]

PDX1は膵臓発生の最初期のマーカーであると考えられており、膵臓細胞の運命はその下流の転写因子によって制御されている[13]。発生過程で最初に形成される膵芽は、HLXB9英語版HNF6英語版PTF1A英語版NKX6-1英語版を共発現するPDX1膵臓前駆細胞英語版から構成されている。これらの細胞はFGF10英語版シグナルに応答してさらに増殖し、分岐する。その後、膵臓細胞の分化が開始され、Notchシグナルが阻害された細胞集団はNGN3英語版を発現する。このNGN3集団は一過的に膵臓内分泌細胞前駆細胞集団となり、ランゲルハンス島のα、β、Δ、PP、ε細胞の発生をもたらす[12]。その他の細胞は外分泌細胞や膵管細胞の集団を生じさせることとなる。

β細胞の成熟と生存[編集]

膵臓の発生の最終段階は、インスリンを産生するβ細胞グルカゴンを産生するα細胞など、さまざまな内分泌細胞の形成である。PDX1はβ細胞の成熟に必要であり、発生中のβ細胞でのPDX1、NKX6-1、インスリンの共発現によって、β細胞の成熟に必要なスイッチである、MAFB英語版のサイレンシングとMAFA英語版の発現が引き起こされる[11]。この段階でPDX1の発現を実験的に低下させると、産生されるβ細胞の数は少なくなり、関連してα細胞数が増加する[14]

成熟した膵臓では、PDX1の発現はβ細胞の維持と生存に必要であるようである。この段階でPDX1の発現レベルを実験的に低下させるとβ細胞のグルカゴン産生量が高まり[15]、このことはPDX1がβ細胞からα細胞への転換を阻害していることを示唆している。さらに、PDX1はβ細胞のアポトーシスに対するインスリンの作用の媒介にも重要であるようであり、β細胞は少量のインスリンによってアポトーシスから保護されるものの、PDX1の発現が阻害された細胞ではこうした効果がみられない[16][17]

十二指腸[編集]

PDX1は、近位十二指腸の発生と胃十二指腸境界の維持に必要である[18]。十二指腸の腸細胞英語版ブルンネル腺、腸管内分泌細胞(幽門部のものも含む)はPDX1の発現に依存している。PDX1はSOX2CDX2英語版とともに、前腸部の適切な細胞分化を決定する[18]。成体のマウスの十二指腸では、Pdx1の発現に依存する遺伝子がいくつか同定されており、その一部は脂質や鉄の吸収に影響している[19]

病理[編集]

動物モデルでの実験では、Pdx1の発現低下によって1型糖尿病2型糖尿病に特徴的な症状が引き起こされることが示されている[20]。さらに、胃がんではPDX1の発現が失われており、がん抑制遺伝子としての役割が示唆される[21]若年発症成人型糖尿病英語版4型(MODY 4英語版)は、PDX1ヘテロ接合型変異によって引き起こされる[22][23]。2型糖尿病症状に対する感受性が高い種であるデブスナネズミ英語版Psammomys obesusは、他の哺乳類と比較してPdx1遺伝子の配列が高度に多様化している[24]

相互作用[編集]

PDX1はMAFA英語版と相互作用することが示されている[25]

出典[編集]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000139515 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029644 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ a b Brooke, N. M.; Garcia-Fernàndez, J.; Holland, P. W. (1998-04-30). “The ParaHox gene cluster is an evolutionary sister of the Hox gene cluster”. Nature 392 (6679): 920–922. doi:10.1038/31933. ISSN 0028-0836. PMID 9582071. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9582071. 
  6. ^ PDX1”. HGNC. 2016年4月22日閲覧。
  7. ^ “Localization of human homeodomain transcription factor insulin promoter factor 1 (IPF1) to chromosome band 13q12.1”. Genomics 28 (1): 125–6. (July 1995). doi:10.1006/geno.1995.1120. PMID 7590740. 
  8. ^ Wright, C. V.; Schnegelsberg, P.; De Robertis, E. M. (1989-04). “XlHbox 8: a novel Xenopus homeo protein restricted to a narrow band of endoderm”. Development (Cambridge, England) 105 (4): 787–794. doi:10.1242/dev.105.4.787. ISSN 0950-1991. PMID 2574662. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/2574662. 
  9. ^ OrthoMaM phylogenetic marker: PDX1 coding sequence”. OrthoMam v10 (2019年). 2019年2月24日閲覧。
  10. ^ “Parallel retention of Pdx2 genes in cartilaginous fish and coelacanths”. Molecular Biology and Evolution 27 (10): 2386–91. (October 2010). doi:10.1093/molbev/msq121. PMC 2944030. PMID 20463047. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2944030/. 
  11. ^ a b “Production of pancreatic hormone-expressing endocrine cells from human embryonic stem cells”. Nat. Biotechnol. 24 (11): 1392–401. (November 2006). doi:10.1038/nbt1259. PMID 17053790. 
  12. ^ a b c “Organ size is limited by the number of embryonic progenitor cells in the pancreas but not the liver”. Nature 445 (7130): 886–91. (February 2007). Bibcode2007Natur.445..886S. doi:10.1038/nature05537. PMID 17259975. 
  13. ^ a b “PAX4 enhances beta-cell differentiation of human embryonic stem cells”. PLOS ONE 3 (3): e1783. (2008). Bibcode2008PLoSO...3.1783L. doi:10.1371/journal.pone.0001783. PMC 2262135. PMID 18335054. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2262135/.  オープンアクセス
  14. ^ Gannon, Maureen; Ables, Elizabeth Tweedie; Crawford, Laura; Lowe, David; Offield, Martin F.; Magnuson, Mark A.; Wright, Christopher V. E. (2008-02-15). “pdx-1 function is specifically required in embryonic beta cells to generate appropriate numbers of endocrine cell types and maintain glucose homeostasis”. Developmental Biology 314 (2): 406–417. doi:10.1016/j.ydbio.2007.10.038. ISSN 1095-564X. PMC 2269701. PMID 18155690. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18155690. 
  15. ^ Ahlgren, U.; Jonsson, J.; Jonsson, L.; Simu, K.; Edlund, H. (1998-06-15). “beta-cell-specific inactivation of the mouse Ipf1/Pdx1 gene results in loss of the beta-cell phenotype and maturity onset diabetes”. Genes & Development 12 (12): 1763–1768. doi:10.1101/gad.12.12.1763. ISSN 0890-9369. PMC PMC316911. PMID 9637677. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9637677. 
  16. ^ “Increased islet apoptosis in Pdx1+/- mice”. J. Clin. Invest. 111 (8): 1147–60. (April 2003). doi:10.1172/JCI16537. PMC 152933. PMID 12697734. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC152933/. 
  17. ^ “Insulin protects islets from apoptosis via Pdx1 and specific changes in the human islet proteome”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (51): 19575–80. (December 2006). Bibcode2006PNAS..10319575J. doi:10.1073/pnas.0604208103. PMC 1748267. PMID 17158802. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1748267/. 
  18. ^ a b “The Parahox gene Pdx1 is required to maintain positional identity in the adult foregut”. Int. J. Dev. Biol. 57 (5): 391–8. (2013). doi:10.1387/ijdb.120048ah. PMID 23873371. http://www.ijdb.ehu.es/web/descarga/paper/120048ah. 
  19. ^ “Expression profiling identifies novel gene targets and functions for Pdx1 in the duodenum of mature mice”. Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. 302 (4): G407–19. (2012). doi:10.1152/ajpgi.00314.2011. PMC 3287393. PMID 22135308. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3287393/. 
  20. ^ Fujimoto, K.; Polonsky, K. S. (2009-11). “Pdx1 and other factors that regulate pancreatic beta-cell survival”. Diabetes, Obesity & Metabolism 11 Suppl 4 (Suppl 4): 30–37. doi:10.1111/j.1463-1326.2009.01121.x. ISSN 1463-1326. PMC 2802270. PMID 19817786. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19817786. 
  21. ^ “Pancreatic duodenal homeobox-1 (PDX1) functions as a tumor suppressor in gastric cancer”. Carcinogenesis 29 (7): 1327–33. (2008). doi:10.1093/carcin/bgn112. PMID 18477649. 
  22. ^ Entrez Gene: PDX1 pancreatic and duodenal homeobox 1”. 2023年6月11日閲覧。
  23. ^ “Molecular mechanisms and clinical pathophysiology of maturity-onset diabetes of the young”. N. Engl. J. Med. 345 (13): 971–80. (September 2001). doi:10.1056/NEJMra002168. PMID 11575290. 
  24. ^ “Genome sequence of a diabetes-prone rodent reveals a mutation hotspot around the ParaHox gene cluster”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 114 (29): 7677–7682. (July 2017). doi:10.1073/pnas.1702930114. PMC 5530673. PMID 28674003. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5530673/. 
  25. ^ “The islet beta cell-enriched MafA activator is a key regulator of insulin gene transcription”. J. Biol. Chem. 280 (12): 11887–94. (March 2005). doi:10.1074/jbc.M409475200. PMID 15665000. 

関連文献[編集]

外部リンク[編集]