キサントバクター属

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キサントバクター属
分類
ドメイン : 真正細菌
Bacteria
門 : プロテオバクテリア門
Pseudomonadota
綱 : アルファプロテオバクテリア綱
Alphaproteobacteria
目 : リゾビウム目
Hyphomicrobiales
科 : キサントバクター科
Xanthobacteraceae
属 : キサントバクター属
Xanthobacter
学名
Xanthobacter
Wiegel et al. 1978[1]
(IJSEMリストに記載 1980[2])
タイプ種
キサントバクター・オートトロフィカス
Xanthobacter autotrophicus
(Baumgarten et al. 1974[3])
Wiegel et al. 1978[1]
(IJSEMリストに記載 1980[2])
修正 Hördt et al. 2020[4]
(IJSEMリストに掲載 2020[5])
下位分類（種）[18]

キサントバクター属（ーぞく、Xanthobacter）は真正細菌プロテオバクテリア門アルファプロテオバクテリア綱リゾビウム目キサントバクター科の属の一つである[19][20]。

概要[編集]

0.4～1.0×0.8～6.0μmの小型の桿菌である[1]。コハク酸塩含有培地での培養では、分岐した、比較的多形性の細胞が確認された。唯一の炭素源としてアルコールを与えられた培地では最大10μmのサイズの球状細胞が出現した。ポリリン酸とポリ-β-ヒドロキシ酪酸が細胞全体に含まれている。

非運動性である。m-ジアミノピメリン酸と直接結合したペプチドグリカンを含むグラム陰性タイプの細胞壁を持つが、実際のグラム染色結果は多様である。細胞壁にはリポ多糖は存在するが、タイコ酸とタイクロン酸は存在しない。寒天培地上のコロニーは不透明且つ粘液状である。但し、粘液状ではない株も確認されている。コロニーは、水不溶性カロテノイド色素であるzeaxan- thin dirhamnosideにより黄色を呈する。

水素、酸素、二酸化炭素 (体積比7:2:1) の雰囲気下のミネラル培地において化学合成無機独立栄養生物として増殖し、メタノール、エタノール、n-プロパノール、n-ブタノール、その他唯一の炭素源としてよく用いられる多くの有機酸を与えた場合は化学有機栄養的に振舞う。炭水化物の利用は限定的であり、炭水化物を与えても酸やガスの生成は確認されない。

酸素減圧下の窒素固定培地に於いて窒素固定能を見せる。偏性好気性。カタラーゼ陽性。最適生育温度は25～30℃であり、最適生育pHは5.8～9.0である。GC含量は69～70mol%である。

系統樹[編集]

現在の真正細菌の分類体系はList of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature（LPSN）に従う。下記の系統樹は2020年に発表された、全ゲノム解析の結果に基づく[4]。

 
キサントバクター属
 
 

キサントバクター・アギリス

 
 
 

キサントバクター・ターゲッティディス

 
 
 

キサントバクター・フラバス

 
 

キサントバクター・アミノキシダンス

 
 
 
 
 
 

キサントバクター・オートトロフィカス

 
 

キサントバクター・ビスコーサス

 
 
 
外群

アゾリゾビウム属

 
 

脚注[編集]

  1. ^ a b c d JüRGEN WIEGEL, DETLEF WILKE, JÖRG BAUMGARTEN, RAINER OPITZ and HANS G. SCHLEGEL (01 October 1978). “Transfer of the Nitrogen-Fixing Hydrogen Bacterium Corynebacterium autotrophicum Baumgarten et al. to Xanthobacter gen. nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 28 (4): 573-581. doi:10.1099/00207713-28-4-573. 
  2. ^ a b c d V. B. D. SKERMAN, VICKI McGOWAN and P. H. A. SNEATH (01 January 1980). “Approved Lists of Bacterial Names”. International Journal of Systematic Bacteriology 30. doi:10.1099/00207713-30-1-225. 
  3. ^ a b J. Baumgarten, M. Reh & H. G. Schlegel (January 1974). “Taxonomic studies on some Gram-positive coryneform hydrogen bacteria”. Archives of Microbiology 100: 207-217. doi:10.1007/BF00446318. 
  4. ^ a b c “Analysis of 1,000+ Type-Strain Genomes Substantially Improves Taxonomic Classification of Alphaproteobacteria”. Front. Microbiol. 11: 468. (2020). doi:10.3389/fmicb.2020.00468. PMC 7179689. PMID 32373076. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7179689/. 
  5. ^ a b Aharon Oren, George Garrity (30 July 2020). “Notification of changes in taxonomic opinion previously published outside the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 (7): 4061-4090. doi:10.1099/ijsem.0.004245. 
  6. ^ B. Jenni, M. Aragno (August 1987). “Xanthobacter agilis sp. nov., a Motile, Dinitrogen-Fixing, Hydrogen-Oxidizing Bacterium”. Systematic and Applied Microbiology 9 (3): 254-257. doi:10.1016/S0723-2020(87)80030-9. 
  7. ^ “Validation of the Publication of New Names and New Combinations Previously Effectively Published Outside the IJSB List No. 24”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 38 (1): 136-137. (01 January 1988). doi:10.1099/00207713-38-1-136. 
  8. ^ a b Nina V. Doronina and Yuri A. Trotsenko (01 January 2003). “Reclassification of ‘Blastobacter viscosus’ 7d and ‘Blastobacter aminooxidans’ 14a as Xanthobacter viscosus sp. nov. and Xanthobacter aminoxidans sp. nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 53 (1): 179-182. doi:10.1099/ijs.0.02231-0. PMID 12656170. 
  9. ^ a b “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 53, part 1, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 53 (3): 629-630. (01 May 2003). doi:10.1099/ijs.0.02769-0. 
  10. ^ Yingning Wang, Fang Ma, Jixian Yang, Haijuan Guo, Delin Su (09 December 2021). “Xanthobacter dioxanivorans sp. nov., a 1,4-dioxane-degrading bacterium”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 71 (12): 5139. doi:10.1099/ijsem.0.005139. PMID 34882528. 
  11. ^ Aharon Oren and George M. Garrity (31 March 2022). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 71, part 12 of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 72 (3): 5273. doi:10.1099/ijsem.0.005273. 
  12. ^ K. A. Malik and D. Claus (01 October 1979). “Xanthobacter flavus, a New Species of Nitrogen-Fixing Hydrogen Bacteria”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 29 (4): 283-287. doi:10.1099/00207713-29-4-283. 
  13. ^ H. Keith Reding, Grace L. M. Croes, Lubbert Dijkhuizen and Juergen Wiegel (01 April 1992). “Emendation of Xanthobacter flavus as a Motile Species”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 42 (2): 309-11. doi:10.1099/00207713-42-2-309. PMID 1581192. 
  14. ^ Ekaterina N Tikhonova, Denis S Grouzdev, Irina K Kravchenko​ (19 August 2021). “Xanthobacter oligotrophicus sp.nov., isolated from paper mill sewage”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 71 (8): 4972. doi:10.1099/ijsem.0.004972. PMID 34410902. 
  15. ^ Aharon Oren and George M. Garrity (01 December 2021). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 71, part 8 of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 71 (11): 5057. doi:10.1099/ijsem.0.005057. 
  16. ^ A. NIKKI PADDEN, FREDERICK A. RAINEY, DONOVAN P. KELLY and ANN P. WOOD (01 January 1997). “Xanthobacter tagetidis sp. nov., an Organism Associated with Tagetes Species and Able To Grow on Substituted Thiophenes”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 47 (2): 394-401. doi:10.1099/00207713-47-2-394. PMID 9103627. 
  17. ^ “Notification that New Names and New Combinations Have Appeared in Volume 47, No. 2, of the IJSB”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 47 (3): 917-919. (01 July 1997). doi:10.1099/00207713-47-3-917. 
  18. ^ Jean P. Euzéby, Aidan C. Parte. “Genus Xanthobacter”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. 2024年5月2日閲覧。
  19. ^ Garrity, George M., ed (2005). Bergey's manual of systematic bacteriology (2nd ed.). New York: Springer. ISBN 0-387-24145-0. https://archive.org/details/bergeysmanualofs00boon 
  20. ^ Falkow, Stanley, ed (2006). Proteobacteria: Alpha and Beta subclasses (3rd ed.). New York: Springer. ISBN 0-387-25495-1 
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