アスパラギン酸ラセマーゼ

aspartate racemase
識別子
EC番号	5.1.1.13
CAS登録番号	37237-56-2
データベース
IntEnz	IntEnz view
BRENDA	BRENDA entry
ExPASy	NiceZyme view
KEGG	KEGG entry
MetaCyc	metabolic pathway
PRIAM	profile
PDB構造	RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー	AmiGO / QuickGO
検索 PMC articles PubMed articles NCBI proteins

アスパラギン酸ラセマーゼ(Aspartate racemase、EC 5.1.1.13)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。

L-アスパラギン酸 $\rightleftharpoons$ D-アスパラギン酸

従って、この酵素の基質はL-アスパラギン酸のみ、生成物はD-アスパラギン酸のみである。

この酵素は、異性化酵素、特にアミノ酸やその誘導体に作用するラセマーゼやエピメラーゼに分類される。McyFとも呼ばれる。この酵素は、アラニン及びアスパラギン酸の代謝に関与する。

構造

2007年末時点で、3つの構造が解かれている。蛋白質構造データバンクのコードは、1IU9、1JFL及び2DX7である。

出典

• Lamont HC, Staudenbauer WL, Strominger JL (1972). “Partial purification and characterization of an aspartate racemase from Streptococcus faecalis”. J. Biol. Chem. 247 (16): 5103–6. PMID 4626916. 
• Yamauchi T, Choi SY, Okada H, Yohda M, Kumagai H, Esaki N, Soda K (1992). “Properties of aspartate racemase, a pyridoxal 5'-phosphate-independent amino acid racemase”. J. Biol. Chem. 267 (26): 18361–4. PMID 1526977. 
• Liu L, Iwata K, Kita A, Kawarabayasi Y, Yohda M, Miki K (2002). “Crystal structure of aspartate racemase from Pyrococcus horikoshii OT3 and its implications for molecular mechanism of PLP-independent racemization”. J. Mol. Biol. 319 (2): 479–89. doi:10.1016/S0022-2836(02)00296-6. PMID 12051922. 
• H, Borner T, Schwecke T (2003). “The mcyF gene of the microcystin biosynthetic gene cluster from Microcystis aeruginosa encodes an aspartate racemase”. Biochem. J. 373 (Pt 3): 909–16. doi:10.1042/BJ20030396. PMC 1223527. PMID 12713441. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1223527/. 
• Yamashita T, Ashiuchi M, Ohnishi K, Kato S, Nagata S, Misono H (2004). “Molecular identification of monomeric aspartate racemase from Bifidobacterium bifidum”. Eur. J. Biochem. 271 (23–24): 4798–803. doi:10.1111/j.1432-1033.2004.04445.x. PMID 15606767.