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ハプログループZ (mtDNA)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』
Z (mtDNA) 系統
系統祖 {{{major-haplo}}}
発生時期 今より36473.3 (SD 7392.0)年前[1]
発生地（推定） 東アジア
現存下位系統の
分岐開始年代（下限値）		 今より21661.6 （SD 8380.8）年前[1]
親階層 CZ
分岐指標 152 6752 9090 15784 16185 16260[2]
高頻度民族・地域 東アジア、北アジア、ヨーロッパ北東部
ハプログループZの分布

ハプログループZ (mtDNA)（ハプログループZ (ミトコンドリアDNA)、英: Haplogroup Z (mtDNA)）とは、分子人類学で用いられる、人類のミトコンドリアDNAハプログループ（型集団）の分類のうち、「CZ」を祖先に持ち152 6752 9090 15784 16185 16260[2]の変異を持つものである。中国北部で誕生したと考えられる。

分布

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ハプログループZはフィン人、サーミ人、ロシア人、ハザーラ人、日本人、朝鮮人、中国、カムチャツカの先住民[3]などで観察される。一部はY染色体ハプログループNと同じような拡散経路をたどったと考えられ[4]、ウラル語族との関連が想定される。

現代の日本に於けるハプログループZの検出頻度は下記の通り：　3.4% (4/118) 東京都（JPT）[5]、1.5%（北海道・東北・中部北陸）[6]、1.4% (3/211）日本全国 [7]、1.3% (17/1312) 日本人[8]。

Yamamoto et al. (2020)[6]によれば現代日本人に見られるハプログループZのサブタイプは以下の通り：

  • Z 1.5%（北海道・東北・中部北陸）
    • Z2 0.9%（北海道・東北・中部北陸）
    • Z3 0.5%（東北・中部北陸）
      • Z3* 0.2%（東北・中部北陸）
      • Z3+709 (Z3c'd*) 0.1%（中部北陸）
      • Z3d 0.2%（東北・中部北陸）
    • Z4 0.1%（中部北陸）
      • Z4a1a1 0.1%（中部北陸）

Li Yuchun et al. (2019)[9]によれば現代漢族に見られるハプログループZのサブタイプは以下の通り：

  • Z 2.949%
      • Z1a 0.023%
        • Z1a1 0.014%
    • Z2 0.018%
    • Z3 1.823%
      • Z3a 0.106%
        • Z3a1 0.042%
          • Z3a1a 0.018%
      • Z3b 0.023%
      • Z3c 0.369%
      • Z3d 0.517%
    • Z4 0.798%
      • Z4a 0.549%
        • Z4a1 0.129%

系統樹

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This phylogenetic tree of haplogroup Z subclades is based on the paper by Mannis van Oven and Manfred Kayser Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation[2] and subsequent published research.

  • Z
    • Z* – タイ王国 (チエンラーイ県プーラン族[10]）
    • Z5 – 日本 (愛知県[11])
    • Z-T152C!
      • Z1 (TMRCA 15962.5 [SD 4819.2]年前[1]、TMRCA 16,346 [99% CI 20,466 - 12,762]年前[12])
        • Z1a – ロシア（コリャーク、ブリヤート、カルムイク、ハカス、ショル、アルタイ人）、カザフ、キルギス、中国（ヒンガン盟・フルンボイル市・シリンゴル盟モンゴル族[13]、ウイグル族、漢族 0.023%[9])、トルコ、ウズベキスタン（アラブ人）(TMRCA 6316.6 [SD 2851.2]年前[1]、TMRCA 6,280 [99% CI 7,649 - 5,067]年前[12])
          • Z1a1 – イタリア、ハンガリー (アヴァール人骨)、ドイツ、スエーデン、カザフ、ブリヤート、中国（ウイグル族、キルギス族、漢族 0.014%[9]）(TMRCA 4634.1 [SD 2678.4]年前[1])
            • Z1a1a – ロシア（ハカス・ノガイ・ウドムルト・クラスノダール地方・アバザ人・チェルケス人等[14])、フィンランド、ノルウェー、スエーデン[14]、エストニア、ウクライナ人[14]
            • Z1a1b – ロシア（サハ共和国エヴェンキ・ドルガン[14]）
              • Z1a1b* – ロシア（タイミル半島ガナサン[16]、インディギルカ川下流域ユカギール[16])、サハ共和国エヴェン[18][14])、イエングラ川流域・ニュクジャ川流域エヴェンキ[18]）
              • Z1a1b1
                • Z1a1b1* – ロシア（イルクーツク州ブリヤート）
                • Z1a1b1a – 中国（ウイグル族）
          • Z1a2 (TMRCA 4774.2 [SD 3062.4]年前[1])
            • Z1a2* – ウリチ[16]
            • Z1a2a – ロシア（イテリメン・コリヤーク[14]）
              • Z1a2a* – ロシア（カムチャツカ地方エヴェン[18]、アナディル川上流域ユカギール[16]）
              • Z1a2a1
                • Z1a2a1* – ロシア（カムチャツカ地方エヴェン[18]、サハ共和国スレドネコリムスク管区ベレゾフカ村エヴェン[18])
                • Z1a2a1a – ロシア（カムチャツカ地方エヴェン[18]、ハバロフスク地方マヤ川流域ネルカン村エヴェンキ[14][16]）
          • Z1a3 (TMRCA 2400 [95% CI 1250 <-> 4300]年前[11])
            • Z1a3* – ロシア（アナディル川上流域ユカギール[16]、サハ共和国エヴェン[18][14]、ニュクジャ川流域エヴェンキ[18]、ヤクート[18]）
            • Z1a3a (Z1a3+A9151G)
              • Z1a3a* – ロシア（カムチャツカ地方エヴェン[18]・マガダン州エヴェン[11]）
              • Z1a3a1 (Z1a3a+C8997T) – ロシア（コリマ川下流域[16]ユカギール[18]、サハ共和国ベレゾフカ村エヴェン[18])
            • Z1a3b (Z1a3+G9145A) – ロシア（サハ共和国ベレゾフカ村エヴェン[18])、ヤクート[11]）
          • Z1a4 (Z1a+G5231A) (TMRCA 3500 [95% CI 1800 <-> 6300]年前[11])
            • Z1a4* – ハンガリー（今より約1200年前の人骨1体 ERS9945053[11]）、ロシア（Tuba[16]、テレウト[11]）、中国（ウイグル族[11]）
            • Z1a4a (Z1a4+C10160T) – 中国（ウイグル族[11]）
            • Z1a4b (Z1a4+A16219G) - ロシア（イルクーツク州ブリヤート[11]）
              • Z1a4b1 (Z1a4b+A9368G) - 中国（バルガ族[11]）
        • Z1b – ロシア（トファ人[19]）
          • Z1b1 (G251A) - ロシア（トファ人）、中国（バルガ族）
      • pre-Z2 (Z+A3145G+A8188G+C14668T) 韓国[12]、中国（山東省漢族1人・計0.0046%[9]）(TMRCA 5,215 [99% CI 8,282 - 2,949]年前[12]）
        • Z2 (pre-Z2+T15184C) – 日本[12] (東京都・愛知県等[11]、北海道地方・東北地方・中部北陸地方・計0.9%[6]) (TMRCA 3700 [95% CI 1600 <-> 7400] ybp[11])、中国（山東省漢族2人・四川省漢族1人・計0.014%[9]）
          • Z2a (Z2+A8521G) 日本（東京都等[11]）
      • Z3 – China (Shanghai,[11] Dengba, Xinjiang Uyghur, etc.), Singapore, Malaysia, Thailand (Lao Isan in Chaiyaphum Province[10]), Vietnam, Uyghur, Evenk (Sakha Republic), Mongol (Hohhot, Tongliao, Chaoyang, Chifeng, Jiangsu[13]), Buryat, Kalmyk, Altai Kizhi, Kyrgyz, Kazakh, Tajik, Azerbaijan, North Ossetian, Romania, USA (TMRCA 15,836 [SD 4,397] ybp[1])
        • Z3a – China (Mongol,[13] Xibo, Deng, etc.), Kazakh[14] (TMRCA 12,900 [95% CI 9,000 <-> 18,000] ybp[11])
        • Z3b (Z3+G9055A+G12501A) – 中国（Deng族[11]）(TMRCA 8100 [95% CI 14200 <-> 4200] ybp[11])
          • Z3b1 (Z3b+C16287T) 中国（Deng族[11]）
          • Z3b2 (Z3b+T146C!) インド（Gallong族[21][11]）
          • Z3b3 (Z3b+T7378A)
        • Z3c'd (Z3+G709A)
          • Z3c'd* - ロシア（ヤクート[14]）、中国（河南省漢族[11]）、日本（中部北陸地方・計0.1%[6]）
          • Z3c – アルタイ人[14]、中国 (通遼市モンゴル族[13]、漢族 0.369%[9])、カンボジア (シェムリアップ州)[11]、ベトナム[12][11]、日本[12]（TMRCA 8,200 [99% CI 10,154 - 6,487]年前[12]）
            • Z3c1 (Z3c+T15300C) イラン[11]、中国 (タシュクルガンタジク自治県キルギス族[23]）
            • Z3c2 (Z3c+C5424T)
            • Z3c3 (Z3c+T9813d）
          • Z3d – 中国（漢族 0.517%[9]）、モンゴル[12]、韓国[12]、日本 (東北地方・中部北陸地方・計0.2%[6])（TMRCA 10,187 [99% CI 12,055 - 8,503]年前[12]）
            • Z3d* 中国（モンゴル族・黒竜江省ダウール族・重慶市等[11]）
            • Z3d1 (Z3d+A9494G) 中国[11]
            • Z3d2 (Z3d+T3396C) キルギス[11]
              • Z3d2a (Z3d2+A3405G) シンガポール[11]
                • Z3d2a1 (Z3d2a+C13654T) 台湾[11]
        • Z3+G11696A – China,[11] Korea[11]
          • Z3+G11696A+C16380T - China[11]
          • Z3+G11696A+T454C - China[11]
        • Z3+T8227C – China[11]
          • Z3+T8227C+A13629G - China[11]
          • Z3+T8227C+T4363C - Korea[11]
        • Z3g (Z3+G7337A) - 日本[12]（東京都[11]）、中国（漢族 内モンゴル自治区1人・北京市1人・上海市1人・四川省1人・浙江省1人・計0.023%[9]）、カザフスタン[11]
        • Z3+A13105G! - China (Barghut from Inner Mongolia)[11]
          • Z3+A13105G!+A13434G - China (Han from Henan, etc.[11])
      • Z4 – China (Suzhou, Mongol in Shandong,[13] etc.), Thailand (Phuan in Suphan Buri Province[10]), Philippines, Uzbekistan, Kazakhstan,[11] Kalmyk,[14] Khakas,[14] Karanogai[14] (TMRCA 16665.5 [SD 4320.0]年前[1])
        • Z4a – 中国（Han from Hunan and Denver, 内モンゴル自治区・遼寧省・黒竜江省・河北省・河南省・山東省モンゴル族[13]、ダウール族、ウイグル族等）、日本（東京都[11]）、アメリカ合衆国[11]
          • Z4a1 – 中国 (漢族 0.129%[9]、包頭市・シリンゴル盟モンゴル族[13])
            • Z4a1a (Z4a1+A5894G) 中国[12]（チベット自治区出土の今より約2000年前の人骨Sangdalongguo_2018M6[11]）、インドネシア[12]
              • Z4a1a1 (Z4a1a+A3520G+T7270C+T8654C+A11719G+C16294T) 日本（東京都等[11]、中部北陸地方・計0.1%[6]）、韓国
              • Z4a1a2 (Z4a1a+C5288T) 中国（貴州省ミャオ族・湖南省漢族・雲南省漢族[11]）
            • Z4a1b (Z4a1+T3394C) 中国（武漢市漢族等[11]、漢族 0.051%[9]）
      • Z7 (Z+T2352C+C2780T+T4363C+T8598C) ネパール[11]（TMRCA 10900 [95% CI 17000 <-> 6500]年前[11]）
        • Z7a (Z7+G4841A) ネパール[11]、パキスタン（バルティ人[11]）
          • Z7a1 (Z7a+C7466d) インド（Dirang Monpa族[21][11]）
          • Z7a2 (Z7a+A16212G) 中国（ラサ市チベット族・山南市チベット族[24]・ティンリ県チベット族[11]）
        • Z7b (Z7+A4026G) ネパール[11]

脚注

[編集]
  1. ^ a b c d e f g h Behar DM, van Oven M, Rosset S, Metspalu M, Loogväli EL, Silva NM, Kivisild T, Torroni A, Villems R. A "Copernican" reassessment of the human mitochondrial DNA tree from its root. Am J Hum Genet. 2012 Apr 6;90(4):675-84. doi: 10.1016/j.ajhg.2012.03.002. Erratum in: Am J Hum Genet. 2012 May 4;90(5):936. PMID 22482806; PMC PMC3322232.
  2. ^ a b c van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). “Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation”. Human Mutation 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. http://www3.interscience.wiley.com/journal/121449735/abstract?CRETRY=1&SRETRY=0 2009年5月20日閲覧。. 
  3. ^ 篠田謙一 (2007)『日本人になった祖先たち - DNAから解明するその多元的構造』 日本放送出版協会　P126
  4. ^ 崎谷満『DNA・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史』（勉誠出版　2009年）
  5. ^ Zheng H-X, Yan S, Qin Z-D, Wang Y, Tan J-Z, et al. (2011), "Major Population Expansion of East Asians Began before Neolithic Time: Evidence of mtDNA Genomes." PLoS ONE 6(10):e25835. doi:10.1371/journal.pone.0025835
  6. ^ a b c d e f Yamamoto, K., Sakaue, S., Matsuda, K. et al. "Genetic and phenotypic landscape of the mitochondrial genome in the Japanese population." Commun Biol 3, 104 (2020). https://doi.org/10.1038/s42003-020-0812-9
  7. ^ Maruyama, Sayaka; Minaguchi, Kiyoshi; Saitou, Naruya (2003-08). “Sequence polymorphisms of the mitochondrial DNA control region and phylogenetic analysis of mtDNA lineages in the Japanese population”. International Journal of Legal Medicine 117 (4): 218–225. doi:10.1007/s00414-003-0379-2. ISSN 0937-9827. PMID 12845447. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12845447. 
  8. ^ Tanaka, Masashi; Cabrera, Vicente M.; González, Ana M.; Larruga, José M.; Takeyasu, Takeshi; Fuku, Noriyuki; Guo, Li-Jun; Hirose, Raita et al. (2004-10). “Mitochondrial genome variation in eastern Asia and the peopling of Japan”. Genome Research 14 (10A): 1832–1850. doi:10.1101/gr.2286304. ISSN 1088-9051. PMC 524407. PMID 15466285. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15466285. 
  9. ^ a b c d e f g h i j Yu-Chun Li, Wei-Jian Ye, Chuan-Gui Jiang, Zhen Zeng, Jiao-Yang Tian, Li-Qin Yang, Kai-Jun Liu, and Qing-Peng Kong, "River Valleys Shaped the Maternal Genetic Landscape of Han Chinese," Molecular Biology and Evolution, Volume 36, Issue 8, August 2019, Pages 1643–1652, https://doi.org/10.1093/molbev/msz072
  10. ^ a b c d e Kutanan, Wibhu; Kampuansai, Jatupol; Srikummool, Metawee; Kangwanpong, Daoroong; Ghirotto, Silvia; Brunelli, Andrea; Stoneking, Mark (2017-01). “Complete mitochondrial genomes of Thai and Lao populations indicate an ancient origin of Austroasiatic groups and demic diffusion in the spread of Tai-Kadai languages”. Human Genetics 136 (1): 85–98. doi:10.1007/s00439-016-1742-y. ISSN 1432-1203. PMC 5214972. PMID 27837350. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27837350. 
  11. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar as at au av aw ax ay az ba bb bc bd be bf bg bh bi bj bk bl bm bn YFull MTree 1.01.5396 as of April 4, 2019.
  12. ^ a b c d e f g h i j k l m n Haplotree for mitochondrial DNA haplogroup Z at FamilyTreeDNA Discover
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ヒトのミトコンドリアDNAハプログループの系統樹

  ミトコンドリア・イブ (L)    
L0 L1 L5 L2 L6 L4 L3  
  M   N  
M7   M8   M9   D G Q N1   N2   N9   A O S X   R  
M7a C Z E I W Y R0   R9   B JT P  U
HV F J T K
H V
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