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ハプログループO (Y染色体)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』
Y染色体 O 系統
系統祖 O-M175
発生時期 36,800年前[1]、39,980年前[2]、41,750(95% CI 46,041 ↔ 30,597)年前[3]、44,700年前[4]
発生地(推定) 中国
現存下位系統の
分岐開始年代(下限値)
30,500年前[1]、32,460年前[5]、33,943(95% CI 37,631 ↔ 25,124)年前[3]、35,000年前[4]
親階層 NO
分岐指標 M175, P186, P191, P196
子階層 O1O2
高頻度民族・地域 東アジア東南アジア

ハプログループO (Y染色体)(ハプログループO (Yせんしょくたい)、英: Haplogroup O (Y-DNA))とは分子人類学において人類の父系を示すY染色体ハプログループ(型集団)の分類で、ハプログループNOの子型で「M175」以下の系統に位置すると定義されるものである。東アジア及び東南アジアで最も一般的に見られる系統であり、西ユーラシア系のハプログループRと並んで現代人類において最も帰属人口の多いY染色体であると考えられている。

概要

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ハプログループOに関連する民族移動

Y染色体ハプログループOは、おおよそ4万年前[注 1]ハプログループNと血筋が分かれた。

現存のハプログループO(即ちO1-F265とO2-M122)の最も近い共通祖先は、約3万年~3.5万年前[注 2]に生きたとされる。

華北平原長江流域などの豊かな地域を中心に多岐に渡るサブグループを産み出し、これらの地域から東アジア東南アジアからポリネシアに至るまで広範囲に拡散したと考えられている[7]

大渓文化」の遺跡人骨から検出されたY染色体ハプログループは、現在は中国南部から東南アジア北部の山岳地帯に分布する「モン・ミエン語族(ミャオ・ヤオ語族)」の民族に多い「O2a2a1a2 M7(旧O3系)」が主体(5/7)で、「O2*(旧O3*)」と「O1b1a1a M95(旧O2a系)」がそれぞれその一部(1/7)であった。 「大渓文化」は「屈家嶺文化」へ継承された。

大きくO1O2に大別される[8]。約3万年前頃までには、O1a-M119, O1b1-K18, O1b2-M176, O2a-M324, O2b-F742 という五つの古い系統に分かれていたと推定されている[1][9][4]

一塩基多型分岐図

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A0000
 
A000-T
 
PR2921
 
A00
 
 
A0
 
 
A1a
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
L1090
 
 
P305
 
 
V221
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
A1b1
 
 
サン族
 
 
 
 
 
 
PF1608
 
 
BY22527.2
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
M42
 
 
M168
 
YAP
 
 
CTS3946
 
 
M174
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
P143
 
M216
 
 
 
 
 
 
G系統
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
M89
 
F1329
 
 
M578
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
L15
 
M9 (P128)
 
M526
 
M2308
 
F549
 
M214
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
H系統
 
 
 
 
 
 
 
LT系統
 
 
YSC0000186
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
IJ系統
 
I系統
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
J系統
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
M231
 
Y6503
 
 
F2905
 
 
Z1956
 
TAT
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Z4762
 
 
L729
 
 
F1360
 
L666
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
M175
 
M122
 
F36
 
M324
 
L465
 
CTS2483
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
CTS10573
 
CTS879
 
FT318429
 
SK1670
 
MF9328
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
F18629
 
MF9361
 
 
SK1671
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
MF22416
 
MF21150
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
F18
 
F117
 
F2
 
F60
 
F2180
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
F26105
 
MF6914
 
MF16001
 
MF14442
 
MF18457
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Y16154
 
Y27894
 
SK1686
 
Y46851
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
F4054
 
 
 
 
 
 
F15439
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FGC5448
 
MF2463
 
MF2478
 
MF47835
 
FTC52891
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
MF9486
 
MF8073
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

(出典)"Y-Full"(Ver.12.00), "FTDNA Big Y Tree"

下位系統

[編集]

脚注

[編集]

注釈

[編集]
  1. ^ Karmin et al. (2015)によれば、41,900年(95% CI 40,175年–43,591年)前。Poznik, Xue & Mendez (2016)によれば、44,700年前、23mofang (October 2023)によれば39,980年前[6]YFull (2022)によれば、36,800年(95% CI 34,300年–39,300年)前。
  2. ^ Karmin et al. (2015)によれば、34,042年(95% CI 32,387年–35,708年)前。Poznik, Xue & Mendez (2016)によれば、35,000年前。23mofang (2022 April 22)によれば、32,890年前、YFull (2022)によれば、30,500(95% CI 28,700年–32,400年)前

出典

[編集]
  1. ^ a b c O YTree”. YFull. Haplogroup YTree v10.00.00 (2022年1月11日). 2022年1月11日時点のオリジナルよりアーカイブ。2022年2月12日閲覧。
  2. ^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/NO
  3. ^ a b Monika Karmin, Rodrigo Flores, Lauri Saag, et al. (2022), "Episodes of Diversification and Isolation in Island Southeast Asian and Near Oceanian Male Lineages." Mol. Biol. Evol. 39(3): msac045 doi:10.1093/molbev/msac045. cf. Figure S4: Dated phylogenetic tree of haplogroup (hg) O-M175及びTable S5: Coalescence ages within hg O and other lineages included in the analyses presented on Supplemental Figure S4.
  4. ^ a b c The 1000 Genomes Project Consortium; Poznik, G David; Xue, Yali; Mendez, Fernando L; Willems, Thomas F; Massaia, Andrea; Wilson Sayres, Melissa A; Ayub, Qasim et al. (2016-06). “Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences” (英語). Nature Genetics 48 (6): 593–599. doi:10.1038/ng.3559. ISSN 1061-4036. PMC 4884158. PMID 27111036. http://www.nature.com/articles/ng.3559. 
  5. ^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/O-F175
  6. ^ Phylogenetic tree of haplogroup NO at 23mofang
  7. ^ Yan, Shi; Wang, Chuan-Chao; Li, Hui; Li, Shi-Lin; Jin, Li (2011-09). “An updated tree of Y-chromosome Haplogroup O and revised phylogenetic positions of mutations P164 and PK4” (英語). European Journal of Human Genetics 19 (9): 1013–1015. doi:10.1038/ejhg.2011.64. ISSN 1476-5438. PMC 3179364. PMID 21505448. https://www.nature.com/articles/ejhg201164. 
  8. ^ Yan, Shi; Wang, Chuan-Chao; Zheng, Hong-Xiang; Wang, Wei; Qin, Zhen-Dong; Wei, Lan-Hai; Wang, Yi; Pan, Xue-Dong et al. (2014-08-29). Su, Bing. ed. “Y Chromosomes of 40% Chinese Descend from Three Neolithic Super-Grandfathers” (英語). PLoS ONE 9 (8): e105691. doi:10.1371/journal.pone.0105691. ISSN 1932-6203. PMC 4149484. PMID 25170956. https://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0105691. 
  9. ^ Karmin, Monika; Saag, Lauri; Vicente, Mário; Sayres, Melissa A. Wilson; Järve, Mari; Talas, Ulvi Gerst; Rootsi, Siiri; Ilumäe, Anne-Mai et al. (2015-04). “A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture” (英語). Genome Research 25 (4): 459–466. doi:10.1101/gr.186684.114. ISSN 1088-9051. PMC 4381518. PMID 25770088. http://genome.cshlp.org/lookup/doi/10.1101/gr.186684.114. 
  10. ^ Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael P. H.; Gratrix, Fiona; Oppenheimer, Stephen; Underhill, Peter; Pascali, Vincenzo L. et al. (2001-02-01). “A Predominantly Indigenous Paternal Heritage for the Austronesian-Speaking Peoples of Insular Southeast Asia and Oceania” (English). The American Journal of Human Genetics 68 (2): 432–443. doi:10.1086/318205. ISSN 0002-9297. PMC 1235276. PMID 11170891. https://www.cell.com/ajhg/abstract/S0002-9297(07)64095-6. 
  11. ^ 崎谷満『DNA・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史: 日本人集団・日本語の成立史』勉誠出版、2009年8月。ISBN 978-4-585-05394-1OCLC 429025925 
  12. ^ https://discover.familytreedna.com/y-dna/O-CTS1754/frequency?view=table
  13. ^ Kayser, M.; Choi, Y.; van Oven, M.; Mona, S.; Brauer, S.; Trent, R. J.; Suarkia, D.; Schiefenhovel, W. et al. (2008-04-03). “The Impact of the Austronesian Expansion: Evidence from mtDNA and Y Chromosome Diversity in the Admiralty Islands of Melanesia” (英語). Molecular Biology and Evolution 25 (7): 1362–1374. doi:10.1093/molbev/msn078. ISSN 0737-4038. https://academic.oup.com/mbe/article-lookup/doi/10.1093/molbev/msn078. 
  14. ^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/O-F742/detail
  15. ^ Youichi Sato, Toshikatsu Shinka, Ashraf A. Ewis, Aiko Yamauchi, Teruaki Iwamoto, and Yutaka Nakahori, "Overview of genetic variation in the Y chromosome of modern Japanese males." Anthropological Science Vol. 122(3), 131–136, 2014. DOI: 10.1537/ase.140709
ヒトY染色体ハプログループ系統樹
Y染色体アダム (Y-MRCA)
A0 A1
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
G H IJK
IJ K
I J K1 K2
L T MS NO P K2*
N O Q R