チモポイエチン

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TMPO
Protein TMPO PDB 1gjj.png
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

1GJJ, 1H9F, 1H9E

識別子
記号TMPO, CMD1T, LAP2, LEMD4, PRO0868, TP, thymopoietin
外部IDOMIM: 188380 MGI: 106920 HomoloGene: 31144 GeneCards: TMPO
遺伝子の位置 (ヒト)
12番染色体 (ヒト)
染色体12番染色体 (ヒト)[1]
12番染色体 (ヒト)
TMPO遺伝子の位置
TMPO遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点98,515,579 bp[1]
終点98,550,351 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
10番染色体 (マウス)
染色体10番染色体 (マウス)[2]
10番染色体 (マウス)
TMPO遺伝子の位置
TMPO遺伝子の位置
バンドデータ無し開始点90,983,433 bp[2]
終点91,017,177 bp[2]
RNA発現パターン
PBB GE TMPO 209753 s at fs.png

PBB GE TMPO 203432 at fs.png

PBB GE TMPO 209754 s at fs.png
さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 DNA結合
lamin binding
cadherin binding
血漿タンパク結合
細胞の構成要素 クロマチン
nuclear envelope
細胞核
染色体
細胞質
integral component of membrane
核内膜
核膜

生物学的プロセス regulation of transcription, DNA-templated
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_001032283
NM_001032284
NM_001307975
NM_003276

NM_001080129
NM_001080130
NM_001080131
NM_001080132
NM_001080134

NM_011605
NM_001283048

RefSeq
(タンパク質)
NP_001027454
NP_001027455
NP_001294904
NP_003267
NP_001027454.1

NP_001027455.1
NP_001294904.1
NP_001027454.1

NP_001073598
NP_001073599
NP_001073600
NP_001073601
NP_001269977

NP_035735
NP_035735.2

場所
(UCSC)
Chr 12: 98.52 – 98.55 MbChr 12: 90.98 – 91.02 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

チモポイエチン[5][6](Thymopoietin、Lamina-associated polypeptide 2 (LAP2), isoforms beta/gamma)はタンパク質の一つ。ヒトではTMPO 遺伝子にコードされる[7][8]。LAP2は、核内膜タンパク質英語版である[9]

胸腺でのCD90英語版の誘導に関与するタンパク質である。TMPO遺伝子はすべての細胞で発現しており、選択的スプライシングにより75kDa(α)、51kDa(β)、39kDa(γ)のタンパク質をコードする。ヒトTMPO 遺伝子は染色体バンド12q22に位置し、8つのエクソンから構成される。TMPOαは細胞核に散在し、TMPOβとγは核膜に局在する。TMPOβはマウスタンパク質LAP2のヒトホモログである。LAP2は有糸分裂期にラミンB1英語版リン酸化を制御することによってラミンB1と染色体を結合させ、核構造を制御している[10]

相互作用[編集]

チモポイエチンは、自己統合障壁因子1英語版[11](BAF1)、AKAP8L英語版[12][13]LMNB1英語版[14][15]LMNA[16][17]相互作用する事が示されている。

参考資料[編集]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000120802 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019961 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ G, Goldstein、T, Audhya、A, Heavner G.「チモポイエチン 免疫制御性ポリペプチドの構造的研究」『Peptides』1981年、 535–539。
  6. ^ Weblio和英辞書 -「チモポイエチン」の英語・英語例文・英語表現”. ejje.weblio.jp. 2021年9月27日閲覧。
  7. ^ “Three distinct human thymopoietins are derived from alternatively spliced mRNAs”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 91 (14): 6283–7. (Jul 1994). Bibcode1994PNAS...91.6283H. doi:10.1073/pnas.91.14.6283. PMC 44185. PMID 7517549. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC44185/. 
  8. ^ Entrez Gene: TMPO thymopoietin”. 2021年9月27日閲覧。
  9. ^ “Inner nuclear membrane proteins: functions and targeting”. Cellular and Molecular Life Sciences 58 (12–13): 1741–7. (Nov 2001). doi:10.1007/PL00000813. PMID 11766875. 
  10. ^ “Structure and mapping of the human thymopoietin (TMPO) gene and relationship of human TMPO beta to rat lamin-associated polypeptide 2”. Genomics 28 (2): 198–205. (Jul 1995). doi:10.1006/geno.1995.1131. PMID 8530026. 
  11. ^ “LAP2 binding protein 1 (L2BP1/BAF) is a candidate mediator of LAP2-chromatin interaction”. Journal of Cell Science 112 ( Pt 15) (15): 2485–92. (Aug 1999). doi:10.1242/jcs.112.15.2485. PMID 10393804. 
  12. ^ “HA95 is a protein of the chromatin and nuclear matrix regulating nuclear envelope dynamics”. Journal of Cell Science 113 Pt 21 (21): 3703–13. (Nov 2000). doi:10.1242/jcs.113.21.3703. PMID 11034899. 
  13. ^ “HA95 and LAP2 beta mediate a novel chromatin-nuclear envelope interaction implicated in initiation of DNA replication”. The Journal of Cell Biology 160 (2): 177–88. (Jan 2003). doi:10.1083/jcb.200210026. PMC 2172640. PMID 12538639. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2172640/. 
  14. ^ “Identification of the lamina-associated-polypeptide-2-binding domain of B-type lamin”. European Journal of Biochemistry / FEBS 251 (3): 729–33. (Feb 1998). doi:10.1046/j.1432-1327.1998.2510729.x. PMID 9490046. 
  15. ^ “Integral membrane proteins of the nuclear envelope interact with lamins and chromosomes, and binding is modulated by mitotic phosphorylation”. Cell 73 (7): 1267–79. (Jul 1993). doi:10.1016/0092-8674(93)90355-T. PMID 8324822. 
  16. ^ “Lamin A/C binding protein LAP2alpha is required for nuclear anchorage of retinoblastoma protein”. Molecular Biology of the Cell 13 (12): 4401–13. (Dec 2002). doi:10.1091/mbc.E02-07-0450. PMC 138642. PMID 12475961. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC138642/. 
  17. ^ “Lamina-associated polypeptide 2alpha binds intranuclear A-type lamins”. Journal of Cell Science 113 Pt 19 (19): 3473–84. (Oct 2000). doi:10.1242/jcs.113.19.3473. PMID 10984438. 

関連文献[編集]

外部リンク[編集]