「リケッチア科」の版間の差分
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{{生物分類表 |
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{| class="infobox biota" style="text-align: left; width: 200px; font-size: 100%" |
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|名称 = リケッチア科 |
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|画像 = [[Image:Rickettsia rickettsii.jpg|190px]] |
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|ドメイン = [[真正細菌]]<br />{{snamei||Bacteria}} |
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|目 = [[リケッチア目]]<br />{{snamei||Rickettsiales}} |
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! colspan="2" style="min-width:15em; text-align: center; background-color: rgb(220,235,245)" |分類 |
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|科 = '''リケッチア科<br />{{snamei||Rickettsiaceae}}''' |
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|学名 = '''{{snamei||Rickettsiaceae}}'''<br /><small>Henry Pinkerton 1936<ref name=10.1017/S003118200002237X>{{cite journal |doi=10.1017/S003118200002237X |journal=Parasitology |volume=28 |issue=2 |date=1 March 1936 |pages=172-189 |author=Henry Pinkerton |title=Criteria for the accurate classification of the Rickettsial diseases (Rickettsioses) and of their etiological agents }}</ref><br />(IJSEMリストに掲載 1980<ref name="10.1099/00207713-30-1-225">{{cite journal |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |doi=10.1099/00207713-30-1-225 |volume=30 |issue=1 |title=Approved Lists of Bacterial Names |author=V. B. D. Skerman1, Vicki. McGOWAN, P. H. A. Sneath |date=01 January 1980 |pages=225-420 }}</ref>)</small> |
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|Domain: |
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|タイプ属='''[[リケッチア属]]<br />{{snamei||Rickettsia}}'''<br /><small>da Rocha-Lima 1916<ref name="da Rocha-Lima">{{cite journal |author=Da Rocha-Lima H |title=Zur Aetiologie des Fleckfeibers |journal=Berliner Klinische Wochenschrift |year=1916 |volume=53 |pages=567-569 }}</ref><br />(IJSEMリストに掲載 1980<ref name="10.1099/00207713-30-1-225" />)</small> |
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|下位分類名=下位分類([[属 (分類学)|属]])<ref name=LPSN>{{Cite web |author=J. P. Euzéby |url=https://lpsn.dsmz.de/family/Rickettsiaceae |title=Family ''Rickettsiaceae'' |access-date=2023-08-13 |website=List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature}}</ref> |
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[[Bacteria]] |
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|下位分類= |
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* {{snamei||Occidentia}}<br /><small>Oleg Mediannikov ''et al''. 2017<ref name="10.1186/1944-3277-9-9">{{cite journal |doi=10.1186/1944-3277-9-9 |date=08 December 2014 |title=High quality draft genome sequence and description of ''Occidentia massiliensis'' gen. nov., sp. nov., a new member of the family ''Rickettsiaceae'' |author=Oleg Mediannikov, Thi-Thien Nguyen, Lesley Bell-Sakyi, Roshan Padmanabhan, Pierre-Edouard Fournier & Didier Raoult |journal=Standards in Genomic Sciences |volume=9 |PMID=25780502 |PMC=4334944 }}</ref><br />(IJSEMリストに掲載 2017<ref name="10.1099/ijsem.0.002122">{{cite journal |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |doi=10.1099/ijsem.0.002122 |volume=67 |issue=7 |title=List of novel names and novel combinations previously effectively, but not validly, published |author=Aharon Oren, George M. Garrity |date=01 July 2017 |pages=2075-2078 }}</ref>)</small> |
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|Phylum: |
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* [[オリエンティア属]]<br />{{snamei||Orientia}}<br /><small>Akira Tamura ''et al''. 1995<ref name="10.1099/00207713-45-3-589">{{cite journal |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |doi=10.1099/00207713-45-3-589 |volume=45 |issue=3 |title=Classification of ''Rickettsia tsutsugamushi'' in a New Genus, ''Orientia'' gen. nov., as ''Orientia tsutsugamushi'' comb. nov. |author=Akira Tamura, Norio Ohashi, Hiroshi Urakami, Sadao Miyamura |date=01 July 1995 |PMID=8590688 |pages=589-591 }}</ref><br />(IJSEMリストに掲載 1995<ref name=10.1099/00207713-45-4-881>{{cite journal |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |doi=10.1099/00207713-45-4-881 |volume=45 |issue=4 |title=Notification that New Names and New Combinations Have Appeared in Volume 45, No. 3, of the IJSB |date=01 October 1995 |page=881 }}</ref>)</small> |
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* [[リケッチア属]]<br />{{snamei||Rickettsia}}<br /><small>da Rocha-Lima 1916<ref name="da Rocha-Lima" /><br />(IJSEMリストに掲載 1980<ref name="10.1099/00207713-30-1-225" />)</small> |
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[[Pseudomonadota]] |
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|Class: |
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⚫ | * "''Candidatus'' Gigarickettsia"<br /><small>Vannini ''et al''. 2014</small><ref name="Vannini"><cite class="citation journal cs1"><span class="cx-segment" data-segmentid="321">Vannini C, Boscaro V, Ferrantini F, Benken KA, Mironov TI, Schweikert M, Görtz H-D, Fokin SI, Sabaneyeva EV, Petroni G. (2014). </span><span class="cx-segment" data-segmentid="322">[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3914857 "Flagellar Movement in Two Bacteria of the Family ''Rickettsiaceae'': A Re-Evaluation of Motility in an Evolutionary Perspective"]. </span><span class="cx-segment" data-segmentid="323">''PLOS ONE''. '''9''' (2): e87718. </span><span class="cx-segment" data-segmentid="324">[[Bibcode (identifier)|Bibcode]]:[https://ui.adsabs.harvard.edu/abs/2014PLoSO...987718V 2014PLoSO...987718V]. [[Doi (identifier)|doi]]:<span class="cs1-lock-free" title="Freely accessible">[[doi:10.1371/journal.pone.0087718|10.1371/journal.pone.0087718]]</span>. </span><span class="cx-segment" data-segmentid="327">[[PMC (identifier)|PMC]] <span class="cs1-lock-free" title="Freely accessible">[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3914857 3914857]</span>. </span></cite><cite class="citation journal cs1">[[PMID (identifier)|PMID]] [https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24505307 24505307].</cite><span class="cs1-maint citation-comment"><code class="cs1-code"><nowiki>{{</nowiki>[[Template:Cite journal|cite journal]]<nowiki>}}</nowiki></code>: CS1 maint: uses authors parameter ([[:Category:CS1 maint: uses authors parameter|link]])</span></ref> |
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|Order: |
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|リケッチア目 |
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[[Rickettsiales]] |
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|Family: |
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|リケッチア科 |
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* "''Candidatus'' Xenohaliotis"<br /><small>Friedman ''et al''. 2000</small> |
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|- style="text-align: center; background-color: rgb(220,235,245)" |
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⚫ | '''リケッチア科'''('''''Rickettsiaceae''''')は[[細菌|真正細菌]]の[[プロテオバクテリア門]][[アルファプロテオバクテリア綱]][[リケッチア目]]の[[科 (分類学)|科]]の一つである。現在、[[真核細胞]]の[[細胞小器官]]の一つである[[ミトコンドリア]]を形成している細菌はこの科に由来すると考えられている。この科において[[リケッチア属]]は最も重要な属であり、同科におけるほとんどのヒト病原体はリケッチア属に属している。それらはライフサイクルの一部を[[マダニ]]や[[シラミ]]などの[[節足動物]]の体内で過ごし、これらの節足動物による刺咬を介して人間など他の哺乳類に感染する。感染菌には[[グラム陰性菌]]が含まれており、暴露状態に非常に敏感であるため、細胞内感染が必須である。リケッチア・リケッチイ(''Rickettsia rickettsii'')は同科の典型的な感染性生物である。 |
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! colspan="2" style="text-align: center; background-color: rgb(220,235,245)" |'''下位分類('''[[種 (分類学)|種]]''')''' |
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⚫ | * "''Candidatus'' Gigarickettsia" <small>Vannini ''et al''. 2014</small><ref name="Vannini"><cite class="citation journal cs1"><span class="cx-segment" data-segmentid="321">Vannini C, Boscaro V, Ferrantini F, Benken KA, Mironov TI, Schweikert M, Görtz H-D, Fokin SI, Sabaneyeva EV, Petroni G. (2014). </span><span class="cx-segment" data-segmentid="322">[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3914857 "Flagellar Movement in Two Bacteria of the Family ''Rickettsiaceae'': A Re-Evaluation of Motility in an Evolutionary Perspective"]. </span><span class="cx-segment" data-segmentid="323">''PLOS ONE''. '''9''' (2): e87718. </span><span class="cx-segment" data-segmentid="324">[[Bibcode (identifier)|Bibcode]]:[https://ui.adsabs.harvard.edu/abs/2014PLoSO...987718V 2014PLoSO...987718V]. [[Doi (identifier)|doi]]:<span class="cs1-lock-free" title="Freely accessible">[[doi:10.1371/journal.pone.0087718|10.1371/journal.pone.0087718]]</span>. </span><span class="cx-segment" data-segmentid="327">[[PMC (identifier)|PMC]] <span class="cs1-lock-free" title="Freely accessible">[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3914857 3914857]</span>. </span></cite><cite class="citation journal cs1">[[PMID (identifier)|PMID]] [https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24505307 24505307].</cite><span class="cs1-maint citation-comment"><code class="cs1-code"><nowiki>{{</nowiki>[[Template:Cite journal|cite journal]]<nowiki>}}</nowiki></code>: CS1 maint: uses authors parameter ([[:Category:CS1 maint: uses authors parameter|link]])</span></ref |
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* ''[[Occidentia]]'' <small>Mediannikov ''et al''. 2017</small> |
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* [[オリエンティア属]]''[[Orientia]]'' <small>Tamura ''et al''. 1995</small> |
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* ''[[リケッチア属]][[Rickettsia]]'' <small>da Rocha-Lima 1916 (Approved Lists 1980)</small> |
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[[Category:Articles with 'species' microformats]] |
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'''リケッチア科'''('''''Rickettsiaceae''''')は[[細菌|真正細菌]]の[[プロテオバクテリア門]][[アルファプロテオバクテリア綱]][[リケッチア目]]の[[科 (分類学)|科]]の一つである。 |
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⚫ | 現在、[[真核細胞]]の[[細胞小器官]]の一つである[[ミトコンドリア]]を形成している細菌はこの科に由来すると考えられている。この科において[[リケッチア属]]は最も重要な属であり、同科におけるほとんどのヒト病原体はリケッチア属に属している。それらはライフサイクルの一部を[[マダニ]]や[[シラミ]]などの[[節足動物]]の体内で過ごし、これらの節足動物による刺咬を介して人間など他の哺乳類に感染する。感染菌には[[グラム陰性菌]]が含まれており、暴露状態に非常に敏感であるため、細胞内感染が必須である。リケッチア・リケッチイ(''Rickettsia rickettsii'')は同科の典型的な感染性生物である。 |
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== ゲノム == |
== ゲノム == |
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ゲノムの比較分析により、RP030、RP187、及びRP192という3種のタンパク質が同定された。これらはリケッチア科菌種に特有に見出され、この科の分子マーカーとして利用できる。さらに、転写修復共役因子Mfdにおける4種のアミノ酸インサート、リボソームタンパク質L19における10種のアミノ酸インサート、[[FtsZ]]タンパク質及び主要な[[シグマ因子]]70における各1種のアミノ酸インサート、並びにリケッチア科菌種に特異的な[[エキソヌクレアーゼVII]]タンパク質の1個のアミノ酸欠失を含む、多くのタンパク質で保存されたシグネチャーインデルが特定された。 |
[[ゲノム]]の比較分析により、RP030、RP187、及びRP192という3種のタンパク質が同定された。これらはリケッチア科菌種に特有に見出され、この科の分子マーカーとして利用できる<ref name="10.1186/1471-2180-7-106">{{cite journal |journal=BMC Microbiology |doi=10.1186/1471-2180-7-106 |date=2007 November 28 |volume=7 |pages=106 |title=Phylogenomics and signature proteins for the alpha proteobacteria and its main groups |author=Radhey S Gupta & Amy Mok |PMID=18045498 |PMC=2241609 }}</ref>。さらに、転写修復共役因子Mfdにおける4種のアミノ酸インサート、リボソームタンパク質L19における10種のアミノ酸インサート、[[FtsZ]]タンパク質及び主要な[[シグマ因子]]70における各1種のアミノ酸インサート、並びにリケッチア科菌種に特異的な[[エキソヌクレアーゼVII]]タンパク質の1個のアミノ酸欠失を含む、多くのタンパク質で保存されたシグネチャーインデルが特定された<ref name="10.1080/10408410590922393">{{cite journal |journal=Critical Reviews in Microbiology |doi=10.1080/10408410590922393 |volume=31 |ssue=2 |title=Protein Signatures Distinctive of Alpha Proteobacteria and Its Subgroups and a Model for α –Proteobacterial Evolution |author=Radhey S. Gupta |date=08 December 2005 |PMID=15986834 }}</ref>。 |
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== 脚注 == |
== 脚注 == |
2023年8月13日 (日) 09:20時点における版
リケッチア科 | |||||||||||||||
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![]() 図の赤い点は、シカダニの細胞内部にて増殖するリケッチア・リケッチイ(R. rickettsii)
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分類 | |||||||||||||||
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学名 | |||||||||||||||
Rickettsiaceae Henry Pinkerton 1936[1] (IJSEMリストに掲載 1980[2]) | |||||||||||||||
タイプ属 | |||||||||||||||
リケッチア属 Rickettsia da Rocha-Lima 1916[3] (IJSEMリストに掲載 1980[2]) | |||||||||||||||
下位分類(属)[9] | |||||||||||||||
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リケッチア科(Rickettsiaceae)は真正細菌のプロテオバクテリア門アルファプロテオバクテリア綱リケッチア目の科の一つである。現在、真核細胞の細胞小器官の一つであるミトコンドリアを形成している細菌はこの科に由来すると考えられている。この科においてリケッチア属は最も重要な属であり、同科におけるほとんどのヒト病原体はリケッチア属に属している。それらはライフサイクルの一部をマダニやシラミなどの節足動物の体内で過ごし、これらの節足動物による刺咬を介して人間など他の哺乳類に感染する。感染菌にはグラム陰性菌が含まれており、暴露状態に非常に敏感であるため、細胞内感染が必須である。リケッチア・リケッチイ(Rickettsia rickettsii)は同科の典型的な感染性生物である。
ゲノム
ゲノムの比較分析により、RP030、RP187、及びRP192という3種のタンパク質が同定された。これらはリケッチア科菌種に特有に見出され、この科の分子マーカーとして利用できる[10]。さらに、転写修復共役因子Mfdにおける4種のアミノ酸インサート、リボソームタンパク質L19における10種のアミノ酸インサート、FtsZタンパク質及び主要なシグマ因子70における各1種のアミノ酸インサート、並びにリケッチア科菌種に特異的なエキソヌクレアーゼVIIタンパク質の1個のアミノ酸欠失を含む、多くのタンパク質で保存されたシグネチャーインデルが特定された[11]。
脚注
- ^ Henry Pinkerton (1 March 1936). “Criteria for the accurate classification of the Rickettsial diseases (Rickettsioses) and of their etiological agents”. Parasitology 28 (2): 172-189. doi:10.1017/S003118200002237X.
- ^ a b c V. B. D. Skerman1, Vicki. McGOWAN, P. H. A. Sneath (01 January 1980). “Approved Lists of Bacterial Names”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 30 (1): 225-420. doi:10.1099/00207713-30-1-225.
- ^ a b Da Rocha-Lima H (1916). “Zur Aetiologie des Fleckfeibers”. Berliner Klinische Wochenschrift 53: 567-569.
- ^ Oleg Mediannikov, Thi-Thien Nguyen, Lesley Bell-Sakyi, Roshan Padmanabhan, Pierre-Edouard Fournier & Didier Raoult (08 December 2014). “High quality draft genome sequence and description of Occidentia massiliensis gen. nov., sp. nov., a new member of the family Rickettsiaceae”. Standards in Genomic Sciences 9. doi:10.1186/1944-3277-9-9. PMC 4334944. PMID 25780502 .
- ^ Aharon Oren, George M. Garrity (01 July 2017). “List of novel names and novel combinations previously effectively, but not validly, published”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 67 (7): 2075-2078. doi:10.1099/ijsem.0.002122.
- ^ Akira Tamura, Norio Ohashi, Hiroshi Urakami, Sadao Miyamura (01 July 1995). “Classification of Rickettsia tsutsugamushi in a New Genus, Orientia gen. nov., as Orientia tsutsugamushi comb. nov.”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 45 (3): 589-591. doi:10.1099/00207713-45-3-589. PMID 8590688.
- ^ “Notification that New Names and New Combinations Have Appeared in Volume 45, No. 3, of the IJSB”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 45 (4): 881. (01 October 1995). doi:10.1099/00207713-45-4-881.
- ^ a b Vannini C, Boscaro V, Ferrantini F, Benken KA, Mironov TI, Schweikert M, Görtz H-D, Fokin SI, Sabaneyeva EV, Petroni G. (2014). "Flagellar Movement in Two Bacteria of the Family Rickettsiaceae: A Re-Evaluation of Motility in an Evolutionary Perspective". PLOS ONE. 9 (2): e87718. Bibcode:2014PLoSO...987718V. doi:10.1371/journal.pone.0087718. PMC 3914857. PMID 24505307.
{{cite journal}}
: CS1 maint: uses authors parameter (link) - ^ J. P. Euzéby. “Family Rickettsiaceae”. List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature. 2023年8月13日閲覧。
- ^ Radhey S Gupta & Amy Mok (2007 November 28). “Phylogenomics and signature proteins for the alpha proteobacteria and its main groups”. BMC Microbiology 7: 106. doi:10.1186/1471-2180-7-106. PMC 2241609. PMID 18045498 .
- ^ Radhey S. Gupta (08 December 2005). “Protein Signatures Distinctive of Alpha Proteobacteria and Its Subgroups and a Model for α –Proteobacterial Evolution”. Critical Reviews in Microbiology 31. doi:10.1080/10408410590922393. PMID 15986834.