MSDOS.SYS

MSDOS.SYS は、MS-DOS および Windows 9x系で重要なシステムファイルである。IO.SYS の後に動作する。MS-DOS では、MSDOS.SYS にオペレーティングシステム本体のコード、すなわちカーネルが含まれている。Windows 9x系ではDOSカーネルのコードは IO.SYS に統合されており、MSDOS.SYS は設定情報が書かれたテキストファイルになっている。

通常、このファイルは起動ドライブのルートディレクトリ（通常 C:\）に存在し、隠しファイル属性、読み取り専用属性、システムファイル属性が付与されている。

DR-DOS や PC-DOS では同じ機能を持つファイルとして IBMDOS.COM が存在する。

Windows NT ベースのOS（NT、2000、XP、Vista）では、ブート方法が異なるので（NTLDRなど）、このファイルは使われていない。