ヨハン・フリードリッヒ・メッケル（ドイツ語: Johann Friedrich Meckel、1781年10月17日 - 1833年10月31日）はドイツの解剖学者、医師。
ハレで出生。マルティン・ルター大学ハレ・ヴィッテンベルクを卒業後は同大学の教授職を務め、「メッケルシンドローム」や「メッケル憩室」を発見した。
