フラボタンパク質（英:Flavoprotein）は、以下はほんの一例であるが、生物発光、酸化ストレスに関わるラジカルの除去、光合成、DNA修復、アポトーシスのように非常に多くの生化学反応に関わっている。フラボタンパク質は、特にフラビン補因子の分光学的特性について最も盛んに研究されている酵素の１つである。
