ナノアーキオータ門
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| ?ナノアーキオータ門 | ||||||
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I. hospitalisの表面に付着している N. equitansの電子顕微鏡写真(右下) |
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| 分類 | ||||||
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| 属・種 | ||||||
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ナノアーキオータ門(もん、Nanoarchaeota)とは、2002年に提唱された古細菌の門(あるいは界)である。同年発見されたNanoarchaeum equitans の16S rRNAの遺伝子配列が、ユリアーキオータ、クレンアーキオータ、コルアーキオータいずれとも大きく異なっていたことを受け提唱された。先に提唱された古細菌ドメインの他の3門と異なり、最初から門として提案されたが、界として扱うこともある。また、特殊化しているだけで実際はユリーアーキオータに含まれるという主張もある。
[編集] Nanoarchaeum equitans
アイスランド沿岸の海底熱水噴出孔から分離されたNanoarchaeum equitans の一属一種のみが確認されている。この菌は現在知られている唯一の寄生性古細菌[1]で、硫黄還元古細菌Ignicoccus hospitalis の表面に付着する形で増殖する。完全にI. hospitalis に依存しており、N. equitans のみの純粋培養は成功していない[2]。このため生育至適条件などは不明だが、宿主であるI. hospitalis と共に70-98℃、嫌気環境で培養された。なお、後にI. hospitalis は単独で培養されたが、こちらは別にN. equitans がいてもいなくても増殖速度は変化しないようである。
菌体の大きさは400nmと古細菌の中でもかなり小さく、ゲノムサイズも49万885塩基対と、発見時は全生物中最小であった[3]。DNA複製・修復、転写、翻訳に関する遺伝子は保持しているものの、殆どのアミノ酸、ヌクレオチド、脂肪酸、補酵素の代謝経路を欠いており、これらをI. hospitalis に依存していると考えられる。このほかジャンクDNA領域が極めて少ないことも特徴的である。ゲノムの95%がタンパク質かノンコーディングRNA何れかをコードしている。ORFは536、非コードRNAは46。tRNAの中にはゲノム中で二つに分離しているものも発見されている。
- ^ 正確には寄生ではなく共生
- ^ なのでNanoarchaeum equitans は正式な学名ではない。“”を付けて『“Nanoarchaeum equitans”』と表記される
- ^ 現在はCarsonella ruddii の159,662塩基対の方が小さいとされる、ただし細胞内共生で細胞小器官に近い
[編集] 関連項目
[編集] 参考文献
- H. Huber, et al. (2002) "A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont", Nature, 417: 63-7.
- E. Waters, et al. (2003) "The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and derived parasitism", PNAS, 100: 12984-8.

