クロロフレクサス門
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| ?クロロフレクサス門 | ||||||
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| 分類 | ||||||
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| 学名 | ||||||
| Chloroflexi Garrity and Holt 2001 |
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| 綱 | ||||||
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クロロフレクサス門は16S rRNA系統解析に基づく真正細菌の分類群の1つで、好熱性の細菌を多く含む。カール・ウーズが光合成性の緑色非硫黄細菌を含む系統群として定義したのが始まりだが、非光合成性の細菌も含んでいる。真正細菌としては比較的小さめの門であるが、未培養の細菌がかなりの種類存在していることが推定されている。
目次 |
[編集] 特徴
クロロフレクサス門に属する細菌はリポ多糖(LPS)を含む外膜を持たず、ペプチドグリカン壁もないか、変わった組成になっている。これまでのところグラム陰性で糸状の群体を形成するものが多い。
[編集] 下位分類
緑色非硫黄細菌を含む系統群であるが、他にも非光合成性の様々な細菌が含まれている。これまでに以下に示す6つの系統が存在していることが知られており、それぞれが綱に相当すると考えられているが、ここには正式に記載されていないもの（カッコ付き）も含まれていることに注意が必要である。またそれぞれの系統には未培養の細菌が存在しており、それらはここに記した系統の説明にあてはまらない性質を持っている可能性もある。
[編集] 「クロロフレクサス綱」
糸状の群体を形成し滑走により運動する細菌からなる系統。緑色非硫黄細菌と、それによく似た非光合成性の細菌が含まれている。
- 「クロロフレクサス目」（"Chloroflexales"）
- 緑色非硫黄細菌5属7種。基本的には好熱性で、嫌気条件では光合成従属栄養、好気条件では化学合成従属栄養で生育する。
- 「ヘルペトシフォン目」（"Herpetosiphonales"）
- Herpetosiphon属2種。非光合成性。中温性で、好気性化学合成従属栄養。
[編集] テルモミクロビウム綱
高度好熱性で、偏性好気性の桿菌からなる系統。運動能はない。Sphaerobacterは一時は放線菌に近縁と考えられたことがあり、またThermomicrobiumに独自の門をあてる見解もある。しかしこの2つは系統的に近縁であることからクロロフレクサス門に含めて考えられるようになっている。
- テルモミクロビウム目（Thermomicrobiales）
- Thermomicrobium roseumのみ。
- スファエロバクター目（Sphaerobacterales）
- Sphaerobacter thermophilusのみ。
[編集] アナエロリネア綱
偏性嫌気性で、糸状の群体を形成する細菌からなる系統。滑走能はない。排水処理施設の嫌気性汚泥から分離される。
- アナエロリネア目（Anaerolineales）
- 3属4種。好熱性または中温性。
[編集] カルディリネア綱
好熱性で滑走能のない糸状の群体を形成する細菌を含む系統。
- カルディリネア目（Caldilineales）
- Caldilinea aerophilaのみ。温泉から分離された。
[編集] 「デハロココイデス綱」
テトラクロロエチレンを分解する脱塩素細菌"Dehalococcoides ethenogenes"（未記載）を含む系統。
[編集] 未培養系統
主として海洋から得られる系統で、その正体は現在のところ全く不明。
[編集] 参考文献
- Castenholz, R. W., "Herpetosiphonales," Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd ed., volume 1, Garrity, G. M. et al. (eds.), Springer, 2001, pp. 444-446. ISBN 0-387-98771-1
- Garrity, G. M. and Holt, J. G., "Phylum BVII. Thermomicrobia phy. nov.," Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd ed., volume 1, Garrity, G. M. et al. (eds.), Springer, 2001, pp. 447-450. ISBN 0-387-98771-1
- Hugenholtz, P. and Stackebrandt, E. (2004). “Reclassification of Sphaerobacter thermophilus from the subclass Sphaerobacteridae in the phylum Actinobacteria to the class Thermomicrobia (emended description) in the phylum Chloroflexi (emended description)”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 54 (6): 2049-2051. PDF available.
- Yamada, T. et al. (2006). “Anaerolinea thermolimosa sp. nov., Levilinea saccharolytica gen. nov., sp. nov. and Leptolinea tardivitalis gen. nov., sp. nov., novel filamentous anaerobes, and description of the new classes Anaerolineae classis nov. and Caldilineae classis nov. in the bacterial phylum Chloroflexi”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56 (6): 1331-1340. PDF available.
